DNAstack
DNAstack
11 – 50 Medewerkers
AdviesGezondheidszorgLogistiek
DNAstack ontwikkelt Omics AI, een SaaS-platform dat aan standaarden voldoet voor het ontdekken, delen en analyseren van genomische en gezondheidsgegevens binnen gedistribueerde onderzoeksnetwerken. Dankzij de federatieve aanpak kunnen gegevensbeheerders gevoelige datasets beschikbaar stellen voor AI-gest analyse zonder ze naar een centrale opslagplaats te verplaatsen. Het platform ondersteunt privacy, beveiliging en GA4GH-standaarden. Het wordt gebruikt in samenwerkingen rond pandemiebewaking, neurowetenschappen, zeldzame aandoeningen en oncologie. DNAstack is een softwarebedrijf dat in 2014 is opgericht en 11 tot 50 medewerkers telt.

Specialist bio-informatica voor klantensucces

Ondersteun klanten bij het gebruik van DNAstacks platform voor het delen van precisiegeneeskundige data, van genomische workflows en kwaliteitscontroles tot onboarding en technische probleemoplossing.

Beschrijving

  • Ben het eerste technische aanspreekpunt voor klanttickets, vragen van partners en verzoeken om data te leveren.
  • Onderzoek mislukte secundaire en tertiaire pipeline-uitvoeringen, fouten in annotatie of sortering en problemen met cloudtoegang, en los deze op.
  • Achterhaal de oorzaken van ontbrekende varianten, afwijkingen bij controlesamples en vertragingen in de uitvoering, en licht de bevindingen toe aan klanten.
  • Zet terugkerende problemen om in kennisbankartikelen, draaiboeken en FAQ's.
  • Monitor productie-workflows en de implementatie van datasets op Google Cloud Platform en AWS.
  • Stel kwaliteitscontroles voor invoer en uitvoer in en voer ze uit, met aandacht voor sample-identiteit, dekking en statistieken op variantniveau.
  • Valideer releases van pipelines en het platform met regressietests en referentiebronnen zoals GIAB.
  • Maak prognoses van en houd de rekenkosten van workflows bij verschillende cloudproviders bij.
  • Registreer incidenten en volg oplossingen door het engineeringteam totdat ze zijn afgerond.
  • Werk pipeline-afhankelijkheden bij en valideer de volledige workflow opnieuw.
  • Bereid de onboarding van klanten voor door target-capturebestanden, metadatasheets en sample-identificaties te controleren.
  • Dien sample-uitvoeringen en heranalyses in voor klantaccounts, monitor ze en bevestig de afronding.
  • Indexeer datasetnodes opnieuw, laad ze opnieuw en controleer ze in verschillende implementatieomgevingen.
  • Maak gegevensselecties op maat, zoals BAM-fragmenten, VCF-bestanden op collectieniveau en gerichte TSV-bestanden.
  • Bereid resultaten van structurele varianten, korte tandemherhalingen en methylering voor levering aan partners voor en controleer de kwaliteit ervan.
  • Werk met Business Development aan demonstratiedatasets, proof-of-concepts en schattingen van rekenkosten.
  • Deel gestructureerde klantfeedback met product- en engineeringteams om de roadmap te helpen bepalen.
  • Vergelijk variantcallers en pipeline-instellingen met behulp van benchmarking.
  • Werk samen met de Staff Bioinformatician aan verkennende functies en neem deel aan de interne bio-informatica-journalclub.

Vereisten

  • Masterdiploma in computationele biologie, bio-informatica, biostatistiek, informatica of gelijkwaardige ervaring.
  • 1–3 jaar professionele ervaring in biotech, diagnostiek of klinische bio-informatica, bij voorkeur in een rol met klant- of partnercontact.
  • Uitstekende schriftelijke en mondelinge communicatievaardigheden, waaronder het vermogen om complexe technische onderwerpen uit te leggen aan mensen zonder computationele achtergrond.
  • Systematische aanpak van probleemoplossing en oorzaakanalyse.
  • Praktische ervaring met het uitvoeren en debuggen van NGS- en omics-datapipelines.
  • Praktische bekendheid met FASTQ-, BAM/CRAM-, VCF- en BED-formaten en analysetools.
  • Goede beheersing van Python, R of Java, naast sterke vaardigheden in shell-scripting en de commandoregel.
  • Zorgvuldigheid en verantwoordelijkheid voor datakwaliteit.
  • Achtergrond in biologie of genetica, met sterk kritisch denkvermogen en onderzoeksvaardigheden.
  • Bevoegdheid om in Canada te werken.
  • Pré: ervaring met workflowtalen zoals WDL, CWL, Nextflow of Snakemake en containers zoals Docker of Singularity.
  • Pré: ervaring met GCP, AWS, Azure of HPC-omgevingen, inclusief monitoring- en loggingtools.
  • Pré: ervaring met geautomatiseerd testen of CI/CD voor bio-informaticapipelines.
  • Pré: ervaring met kwaliteitssystemen of gereguleerde omgevingen zoals CAP/CLIA of ISO 13485.
  • Pré: bekendheid met ticketing- of klantensuccesplatforms zoals Jira Service Management, Zendesk of Intercom.
  • Pré: ervaring met long-readsequencing, waaronder analyse van structurele varianten, STR's en methylering.
  • Pré: vaardigheden in statistische analyse en datavisualisatie.
  • Pré: ervaring met genomica in een nat laboratorium.
  • Pré: bekendheid met moderne AI-tools zoals Claude Code.

Voordelen

  • Flexibele werktijden en remotevriendelijk werken, met de mogelijkheid om op kantoor in Toronto te werken.
  • Medische, tandheelkundige en oogzorgdekking voor medewerkers en hun gezinsleden.
  • Drie weken vakantie.
  • Onbeperkt ziekteverlof.
  • Aanvullende regelingen voor zwangerschaps- en ouderschapsverlof.
  • Een eenmalige vergoeding om een thuiswerkplek in te richten.
  • Ondersteuning voor loopbaanontwikkeling en leren.
  • Mogelijkheid om deel te nemen aan het aandelenoptieprogramma voor medewerkers.
  • De kans om bij te dragen aan open science en wereldwijde initiatieven voor het delen van data.