DNAstack phát triển Omics AI, một nền tảng SaaS tuân thủ các tiêu chuẩn, giúp khám phá, chia sẻ và phân tích dữ liệu hệ gen và sức khỏe trên các mạng lưới nghiên cứu phân tán. Cách tiếp cận liên kết cho phép đơn vị quản lý dữ liệu cung cấp các tập dữ liệu nhạy cảm để phân tích bằng AI mà không cần tập trung dữ liệu vào một kho lưu trữ, đồng thời hỗ trợ quyền riêng tư, bảo mật và các tiêu chuẩn GA4GH. Nền tảng được sử dụng trong các hoạt động hợp tác về giám sát đại dịch, khoa học thần kinh, bệnh hiếm và ung thư học. DNAstack là công ty phần mềm được thành lập năm 2014, với đội ngũ từ 11 đến 50 nhân viên.
Chuyên viên Thành công Khách hàng Tin sinh học
Hỗ trợ khách hàng sử dụng nền tảng chia sẻ dữ liệu y học chính xác của DNAstack, từ vận hành quy trình phân tích hệ gen và kiểm tra chất lượng đến hướng dẫn sử dụng và khắc phục sự cố kỹ thuật.
Mô tả
- Là đầu mối kỹ thuật chính xử lý yêu cầu hỗ trợ của khách hàng, câu hỏi từ đối tác và yêu cầu cung cấp dữ liệu.
- Điều tra và khắc phục các lần chạy quy trình phân tích bậc hai, bậc ba bị lỗi, lỗi chú giải hoặc sắp xếp dữ liệu và sự cố truy cập đám mây.
- Truy tìm nguyên nhân gốc rễ của biến thể bị thiếu, sai lệch ở mẫu đối chứng và chậm thời gian chạy, sau đó giải thích kết quả cho khách hàng.
- Chuyển các vấn đề lặp lại thành nội dung cơ sở kiến thức, quy trình vận hành và câu hỏi thường gặp.
- Theo dõi quy trình sản xuất và triển khai bộ dữ liệu trên Google Cloud Platform và AWS.
- Thiết lập và thực hiện kiểm tra chất lượng đầu vào, đầu ra, bao gồm định danh mẫu, độ bao phủ và các chỉ số ở cấp biến thể.
- Xác thực các bản phát hành quy trình và nền tảng bằng kiểm thử hồi quy cùng tài nguyên tham chiếu như GIAB.
- Dự báo và theo dõi chi phí tính toán quy trình trên các nhà cung cấp đám mây.
- Ghi nhận sự cố và theo dõi các bản sửa lỗi của nhóm kỹ thuật đến khi được xử lý xong.
- Cập nhật các phần phụ thuộc của quy trình và xác thực lại toàn bộ quy trình làm việc.
- Chuẩn bị tiếp nhận khách hàng bằng cách kiểm tra tệp bắt giữ mục tiêu, bảng siêu dữ liệu và mã định danh mẫu.
- Gửi yêu cầu, theo dõi và xác nhận các lần chạy mẫu cũng như phân tích lại trên các tài khoản khách hàng.
- Tạo lại chỉ mục, tải lại và xác minh các nút bộ dữ liệu giữa các môi trường triển khai.
- Tạo các trích xuất dữ liệu theo yêu cầu, chẳng hạn như đoạn BAM, tệp VCF cấp bộ sưu tập và tệp TSV theo mục tiêu.
- Chuẩn bị và kiểm tra chất lượng kết quả biến thể cấu trúc, đoạn lặp ngắn STR và methyl hóa trước khi gửi cho đối tác.
- Phối hợp với bộ phận Phát triển Kinh doanh về bộ dữ liệu trình diễn, thử nghiệm khả thi và ước tính chi phí tính toán.
- Tổng hợp phản hồi có hệ thống của khách hàng và chia sẻ với nhóm sản phẩm, kỹ thuật để hỗ trợ định hướng lộ trình.
- So sánh các công cụ gọi biến thể và cấu hình quy trình thông qua đánh giá hiệu năng.
- Phối hợp với Chuyên gia Tin sinh học cấp cao về các tính năng thăm dò và tham gia câu lạc bộ đọc chuyên đề tin sinh học nội bộ.
Yêu cầu
- Bằng thạc sĩ về sinh học tính toán, tin sinh học, thống kê sinh học, khoa học máy tính hoặc kinh nghiệm tương đương.
- Có 1–3 năm kinh nghiệm chuyên môn trong lĩnh vực công nghệ sinh học, chẩn đoán hoặc tin sinh học lâm sàng, ưu tiên từng làm việc với khách hàng hoặc đối tác.
- Kỹ năng giao tiếp bằng văn bản và lời nói xuất sắc, bao gồm khả năng giải thích vấn đề kỹ thuật phức tạp cho người không chuyên về tính toán.
- Có phương pháp tiếp cận hệ thống trong xử lý sự cố và phân tích nguyên nhân gốc rễ.
- Có kinh nghiệm thực tế chạy và gỡ lỗi các quy trình xử lý dữ liệu NGS và omics.
- Có hiểu biết thực hành về các định dạng FASTQ, BAM/CRAM, VCF và BED cũng như các công cụ phân tích.
- Thành thạo Python, R hoặc Java, cùng kỹ năng viết tập lệnh shell và sử dụng dòng lệnh tốt.
- Chú ý kỹ đến chi tiết và có trách nhiệm với chất lượng dữ liệu.
- Có nền tảng về sinh học hoặc di truyền học, cùng tư duy phản biện và kỹ năng nghiên cứu tốt.
- Được phép làm việc tại Canada.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm với ngôn ngữ quy trình như WDL, CWL, Nextflow hoặc Snakemake và công nghệ container như Docker hoặc Singularity.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm với GCP, AWS, Azure hoặc môi trường HPC, bao gồm công cụ theo dõi và ghi nhật ký.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm kiểm thử tự động hoặc CI/CD cho quy trình tin sinh học.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm trong hệ thống chất lượng hoặc môi trường được quản lý như CAP/CLIA hoặc ISO 13485.
- Ưu tiên: Quen thuộc với nền tảng quản lý yêu cầu hỗ trợ hoặc thành công khách hàng như Jira Service Management, Zendesk hoặc Intercom.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm giải trình tự đọc dài, bao gồm phân tích biến thể cấu trúc, STR và methyl hóa.
- Ưu tiên: Có kỹ năng phân tích thống kê và trực quan hóa dữ liệu.
- Ưu tiên: Có kinh nghiệm về genomics trong phòng thí nghiệm.
- Ưu tiên: Quen thuộc với các công cụ AI hiện đại như Claude Code.
Phúc lợi
- Lịch làm việc linh hoạt và hình thức làm việc thân thiện với làm việc từ xa, có lựa chọn làm tại văn phòng Toronto.
- Bảo hiểm y tế, nha khoa và thị lực cho nhân viên cùng người phụ thuộc.
- Ba tuần nghỉ phép.
- Nghỉ ốm không giới hạn.
- Các chương trình bổ sung chế độ nghỉ thai sản và nghỉ dành cho cha mẹ.
- Trợ cấp một lần để thiết lập văn phòng từ xa.
- Hỗ trợ phát triển nghề nghiệp và học tập.
- Đủ điều kiện tham gia Chương trình quyền chọn cổ phiếu cho nhân viên.
- Cơ hội đóng góp cho khoa học mở và các sáng kiến chia sẻ dữ liệu toàn cầu.