DNAstack entwickelt Omics AI, eine standardkonforme SaaS-Plattform, mit der Genom- und Gesundheitsdaten über verteilte Forschungsnetzwerke hinweg entdeckt, geteilt und analysiert werden können. Der föderierte Ansatz ermöglicht es Datenverantwortlichen, sensible Datensätze für KI-gestützte Analysen bereitzustellen, ohne sie in ein zentrales Repository zu übertragen. Dabei unterstützt die Plattform Datenschutz, Sicherheit und GA4GH-Standards. Sie kommt in Kooperationen zu Pandemieüberwachung, Neurowissenschaften, seltenen Erkrankungen und Onkologie zum Einsatz. DNAstack ist ein 2014 gegründetes Softwareunternehmen mit 11 bis 50 Mitarbeitenden.
Bioinformatik-Spezialist:in für Kundenerfolg
Unterstütze Kund:innen bei der Nutzung der DNAstack-Plattform für den Austausch von Präzisionsmedizin-Daten – von genomischen Pipelines und Qualitätsprüfungen bis hin zu Onboarding und technischer Fehlerbehebung.
Kanada70.000 $ – 95.000 $ / Jahr
RemoteVollzeitJuniorErforderliche Sprache: EnglischCustomer-Success-ManagerKundenerfolgBeschreibung
- Betreue technische Kundenanfragen, Partnerfragen und Anforderungen zur Datenbereitstellung als erste Ansprechperson.
- Untersuche fehlgeschlagene sekundäre und tertiäre Pipeline-Läufe, Fehler bei Annotation oder Sortierung sowie Probleme mit dem Cloud-Zugriff und behebe sie.
- Ermittle die Ursachen fehlender Varianten, Abweichungen bei Kontrollproben und Laufzeitverzögerungen und erläutere die Ergebnisse den Kund:innen.
- Bereite wiederkehrende Probleme als Wissensdatenbank-Einträge, Runbooks und FAQs auf.
- Überwache Produktionsabläufe und die Bereitstellung von Datensätzen auf Google Cloud Platform und AWS.
- Richte Qualitätsprüfungen für Ein- und Ausgaben ein und führe sie durch; dabei prüfst du Probenidentität, Abdeckung und Kennzahlen auf Variantenebene.
- Validiere Pipeline- und Plattform-Releases mit Regressionstests und Referenzressourcen wie GIAB.
- Prognostiziere und erfasse Rechenkosten für Workflows bei verschiedenen Cloud-Anbietern.
- Dokumentiere Vorfälle und begleite technische Fehlerbehebungen bis zum Abschluss.
- Aktualisiere Pipeline-Abhängigkeiten und validiere den gesamten Workflow erneut.
- Bereite das Kunden-Onboarding vor, indem du Zielanreicherungsdateien, Metadatenblätter und Probenkennungen prüfst.
- Reiche Probenläufe und Reanalysen für verschiedene Kundenkonten ein, überwache sie und bestätige ihren Abschluss.
- Indiziere Datensatzknoten in verschiedenen Bereitstellungsumgebungen neu, lade sie erneut und überprüfe sie.
- Erstelle maßgeschneiderte Datenextrakte, etwa BAM-Ausschnitte, VCF-Dateien auf Sammlungsniveau und gezielte TSV-Dateien.
- Bereite Ergebnisse zu strukturellen Varianten, kurzen Tandemwiederholungen und Methylierung für die Partnerübergabe auf und prüfe ihre Qualität.
- Arbeite mit der Geschäftsentwicklung an Demonstrationsdatensätzen, Machbarkeitsnachweisen und Schätzungen der Rechenkosten.
- Teile strukturiertes Kundenfeedback mit den Produkt- und Entwicklungsteams, damit es in die Produkt-Roadmap einfließt.
- Vergleiche Variant Caller und Pipeline-Einstellungen mithilfe von Benchmarking.
- Arbeite mit dem leitenden Bioinformatiker an explorativen Funktionen und nimm am internen Bioinformatik-Journalclub teil.
Anforderungen
- Masterabschluss in Computational Biology, Bioinformatik, Biostatistik, Informatik oder gleichwertige Berufserfahrung.
- 1–3 Jahre Berufserfahrung in einem Biotech-, Diagnostik- oder klinischen Bioinformatikunternehmen, idealerweise in der Zusammenarbeit mit Kund:innen oder Partnern.
- Sehr gute schriftliche und mündliche Kommunikationsfähigkeiten, einschließlich der Fähigkeit, komplexe technische Sachverhalte einem nicht auf Informatik spezialisierten Publikum zu erklären.
- Systematisches Vorgehen bei der Fehlerbehebung und Ursachenanalyse.
- Praktische Erfahrung mit dem Ausführen und Debuggen von NGS- und Omics-Datenverarbeitungspipelines.
- Vertrautheit mit den Formaten FASTQ, BAM/CRAM, VCF und BED sowie mit Analysewerkzeugen.
- Sicherer Umgang mit Python, R oder Java sowie ausgeprägte Kenntnisse in Shell-Scripting und der Kommandozeile.
- Sorgfalt und Verantwortungsbewusstsein für die Datenqualität.
- Hintergrund in Biologie oder Genetik sowie ausgeprägtes kritisches Denken und wissenschaftliche Recherchefähigkeiten.
- Berechtigung, in Kanada zu arbeiten.
- Von Vorteil: Erfahrung mit Workflow-Sprachen wie WDL, CWL, Nextflow oder Snakemake sowie Containern wie Docker oder Singularity.
- Von Vorteil: Erfahrung mit GCP, AWS, Azure oder HPC-Umgebungen, einschließlich Überwachungs- und Protokollierungswerkzeugen.
- Von Vorteil: Erfahrung mit automatisierten Tests oder CI/CD für Bioinformatik-Pipelines.
- Von Vorteil: Erfahrung mit Qualitätssystemen oder regulierten Umgebungen wie CAP/CLIA oder ISO 13485.
- Von Vorteil: Vertrautheit mit Ticketing- oder Customer-Success-Plattformen wie Jira Service Management, Zendesk oder Intercom.
- Von Vorteil: Erfahrung mit Long-Read-Sequenzierung, einschließlich der Analyse struktureller Varianten, von STRs und Methylierung.
- Von Vorteil: Kenntnisse in statistischer Analyse und Datenvisualisierung.
- Von Vorteil: Erfahrung mit Genomik im Nasslabor.
- Von Vorteil: Vertrautheit mit modernen KI-Werkzeugen wie Claude Code.
Zusatzleistungen
- Flexible Arbeitszeiten und remote-freundliche Arbeit mit der Möglichkeit, im Büro in Toronto zu arbeiten.
- Kranken-, Zahn- und Sehhilfeschutz für Mitarbeitende und ihre Angehörigen.
- Drei Wochen Urlaub.
- Unbegrenzter Krankheitsurlaub.
- Aufstockungsprogramme für Mutterschafts- und Elternzeit.
- Einmaliger Zuschuss zur Einrichtung eines Remote-Arbeitsplatzes.
- Unterstützung für berufliche Entwicklung und Weiterbildung.
- Möglichkeit zur Teilnahme am Aktienoptionsprogramm für Mitarbeitende.
- Die Möglichkeit, zu Open Science und globalen Initiativen zum Datenaustausch beizutragen.