DNAstack разработва Omics AI — SaaS платформа, съвместима със стандартите, за откриване, споделяне и анализ на геномни и здравни данни в разпределени изследователски мрежи. Федеративният ѝ подход позволява на администраторите на данни да предоставят чувствителни набори от данни за анализ с помощта на изкуствен интелект, без те да бъдат премествани в централизирано хранилище, като същевременно се поддържат поверителността, сигурността и стандартите на GA4GH. Платформата се използва в сътрудничества в областта на наблюдението на пандемии, невронауката, редките заболявания и онкологията. DNAstack е софтуерна компания, основана през 2014 г., с екип от 11 до 50 служители.
Специалист по клиентска поддръжка в биоинформатиката
Подкрепа за клиенти, използващи платформата на DNAstack за споделяне на данни за прецизна медицина — от работата на геномни процеси и проверките на качеството до въвеждането в работата и техническото отстраняване на проблеми.
Канада70 000 CAD – 95 000 CAD / година
ДистанционноПълен работен денМладшиЗадължителен Език: английскиМениджър клиентски успехУспех на клиентитеОписание
- Бъдете основното техническо лице за контакт по клиентски заявки, въпроси от партньори и заявки за предоставяне на данни.
- Проучвайте и отстранявайте проблеми с неуспешни вторични и третични изпълнения на процеси, дефекти в анотацията или сортирането и достъпа до облачни услуги.
- Проследявайте до първопричината липсващи варианти, несъответствия в контролните проби и забавяния при изпълнение, след което обяснявайте констатациите на клиентите.
- Превръщайте повтарящите се проблеми в материали за база знания, оперативни инструкции и често задавани въпроси.
- Следете производствените работни процеси и внедряването на набори от данни в Google Cloud Platform и AWS.
- Настройвайте и извършвайте проверки на качеството на входните и изходните данни, включително идентичността на пробите, покритието и показателите на ниво вариант.
- Проверявайте версиите на процесите и платформата чрез регресионни тестове и референтни ресурси като GIAB.
- Прогнозирайте и следете разходите за изчислителни ресурси на работните процеси при различни облачни доставчици.
- Документирайте инциденти и проследявайте инженерните корекции до разрешаването на проблема.
- Актуализирайте зависимостите на процесите и проверявайте отново целия работен поток.
- Подготвяйте въвеждането на клиентите, като проверявате файловете за целево обогатяване, таблиците с метаданни и идентификаторите на пробите.
- Подавате, следите и потвърждавате изпълненията на проби и повторните анализи в клиентските профили.
- Преиндексирайте, зареждайте отново и проверявайте възлите с набори от данни в различните среди за внедряване.
- Изготвяйте персонализирани извлечения на данни, като BAM сегменти, VCF файлове на ниво колекция и целеви TSV файлове.
- Подготвяйте и проверявайте качеството на резултатите за структурни варианти, къси тандемни повтори и метилиране преди предоставяне на партньори.
- Работете с екипа за бизнес развитие по демонстрационни набори от данни, доказателства за концепция и оценки на изчислителните разходи.
- Споделяйте систематизирана обратна връзка от клиентите с продуктовите и инженерните екипи, за да подпомагате продуктовия план.
- Сравнявайте инструментите за откриване на варианти и настройките на процесите чрез бенчмаркинг.
- Сътрудничете със старши биоинформатика по експериментални функции и участвайте във вътрешния клуб за четене по биоинформатика.
Изисквания
- Магистърска степен по изчислителна биология, биоинформатика, биостатистика, компютърни науки или еквивалентен опит.
- 1–3 години професионален опит в индустриална биотехнология, диагностика или клинична биоинформатика, за предпочитане с работа с клиенти или партньори.
- Отлични умения за писмена и устна комуникация, включително способност за обясняване на сложни технически теми на хора без изчислителна подготовка.
- Систематичен подход към отстраняването на проблеми и анализа на първопричините.
- Практически опит с изпълнение и отстраняване на грешки в процеси за обработка на NGS и омични данни.
- Работни познания за форматите FASTQ, BAM/CRAM, VCF и BED, както и за аналитични инструменти.
- Владеене на Python, R или Java, както и отлични умения за shell скриптове и работа с команден ред.
- Внимание към детайлите и отговорност за качеството на данните.
- Образование или опит в областта на биологията или генетиката, силно критично мислене и изследователски умения.
- Разрешение за работа в Канада.
- Предимство е опитът с езици за описание на работни процеси като WDL, CWL, Nextflow или Snakemake и с контейнери като Docker или Singularity.
- Предимство е опитът със среди GCP, AWS, Azure или HPC, включително инструменти за наблюдение и регистриране на събития.
- Предимство е опитът с автоматизирано тестване или CI/CD за биоинформатични процеси.
- Предимство е опитът със системи за качество или регулирани среди като CAP/CLIA или ISO 13485.
- Предимство е познаването на системи за управление на заявки или платформи за клиентска поддръжка като Jira Service Management, Zendesk или Intercom.
- Предимство е опитът със секвениране на дълги прочити, включително анализ на структурни варианти, STR и метилиране.
- Предимство са уменията за статистически анализ и визуализация на данни.
- Предимство е лабораторният опит в геномиката.
- Предимство е познаването на съвременни инструменти с изкуствен интелект като Claude Code.
Придобивки
- Гъвкаво работно време и възможност за дистанционна работа, както и опция за работа в офиса в Торонто.
- Здравно, стоматологично и зрително покритие за служителите и техните лица на издръжка.
- Три седмици отпуск.
- Неограничен отпуск по болест.
- Допълнителни програми за отпуск по майчинство и родителски отпуск.
- Еднократна помощ за оборудване на домашен офис.
- Подкрепа за кариерно развитие и обучение.
- Възможност за участие в програмата за опции върху акции за служители.
- Възможност за принос към отворената наука и глобалните инициативи за споделяне на данни.