DNAstack
DNAstack
DNAstack utvikler Omics AI, en standardkompatibel SaaS-plattform for å finne, dele og analysere genomiske data og helsedata på tvers av distribuerte forskningsnettverk. Den fødererte tilnærmingen gjør det mulig for dataansvarlige å gjøre sensitive datasett tilgjengelige for AI-basert analyse uten å samle dem i et sentralt arkiv, samtidig som den støtter personvern, sikkerhet og GA4GH-standarder. Plattformen brukes i samarbeid innen blant annet pandemiovervåking, nevrovitenskap, sjeldne sykdommer og onkologi. DNAstack er et programvareselskap grunnlagt i 2014 med 11–50 ansatte.

Spesialist på kundesuksess innen bioinformatikk

Støtt kunder som bruker DNAstacks plattform for datadeling innen presisjonsmedisin, fra genomiske arbeidsflyter og kvalitetskontroller til onboarding og teknisk feilsøking.

Beskrivelse

  • Vær den viktigste tekniske kontaktpersonen for kundehenvendelser, partnerspørsmål og dataforespørsler.
  • Undersøk og løs problemer med mislykkede sekundære og tertiære pipelinekjøringer, annoterings- eller sorteringsfeil og tilgang til skytjenester.
  • Finn årsaken til manglende varianter, avvik i kontrollprøver og lange kjøretider, og forklar deretter funnene for kundene.
  • Gjør tilbakevendende problemer om til innhold i kunnskapsbasen, driftsveiledninger og vanlige spørsmål.
  • Overvåk produksjonsarbeidsflyter og distribusjon av datasett på Google Cloud Platform og AWS.
  • Etabler og utfør kvalitetskontroller av inndata og utdata, inkludert prøveidentitet, dekning og målinger på variantnivå.
  • Valider oppdateringer av pipelines og plattformen med regresjonstester og referanseressurser som GIAB.
  • Prognostiser og følg opp beregningskostnader for arbeidsflyter på tvers av skyleverandører.
  • Registrer hendelser og følg tekniske rettelser helt frem til løsning.
  • Oppdater pipelineavhengigheter og valider hele arbeidsflyten på nytt.
  • Forbered kundeonboarding ved å kontrollere målrettede capture-filer, metadataark og prøve-ID-er.
  • Send inn, overvåk og bekreft prøveruns og nye analyser på tvers av kundekontoer.
  • Indekser på nytt, last inn på nytt og verifiser datasettnoder på tvers av distribusjonsmiljøer.
  • Lag tilpassede datauttrekk, som BAM-utdrag, VCF-filer på samlingsnivå og målrettede TSV-filer.
  • Forbered og kvalitetskontroller resultater for strukturelle varianter, korte tandemrepetisjoner og metylering før levering til partnere.
  • Samarbeid med forretningsutvikling om demonstrasjonsdatasett, proof of concept-prosjekter og estimater for beregningskostnader.
  • Systematiser tilbakemeldinger fra kunder og del dem med produkt- og ingeniørteamene som grunnlag for veikartet.
  • Sammenlign variantfinnere og pipelineinnstillinger gjennom benchmarking.
  • Samarbeid med den ledende bioinformatikeren om utforskende funksjoner og delta i den interne journal cluben for bioinformatikk.

Krav

  • Mastergrad i beregningsbiologi, bioinformatikk, biostatistikk, informatikk eller tilsvarende erfaring.
  • 1–3 års yrkeserfaring innen bioteknologi, diagnostikk eller klinisk bioinformatikk, gjerne med kunde- eller partnerkontakt.
  • Svært gode skriftlige og muntlige kommunikasjonsevner, inkludert evnen til å forklare komplekse tekniske forhold til personer uten beregningsfaglig bakgrunn.
  • Systematisk tilnærming til feilsøking og analyse av grunnårsaker.
  • Praktisk erfaring med å kjøre og feilsøke arbeidsflyter for NGS- og omikkdatabehandling.
  • Kjennskap til formatene FASTQ, BAM/CRAM, VCF og BED samt analyseverktøy.
  • Gode ferdigheter i Python, R eller Java, samt sterke ferdigheter i shell-skripting og kommandolinjebruk.
  • Nøyaktighet og ansvarsfølelse for datakvalitet.
  • Bakgrunn innen biologi eller genetikk, med sterke ferdigheter innen kritisk tenkning og forskning.
  • Arbeidstillatelse i Canada.
  • Foretrukket: erfaring med arbeidsflytspråk som WDL, CWL, Nextflow eller Snakemake, og containere som Docker eller Singularity.
  • Foretrukket: erfaring med GCP, AWS, Azure eller HPC-miljøer, inkludert verktøy for overvåking og logging.
  • Foretrukket: erfaring med automatisert testing eller CI/CD for bioinformatikkpipelines.
  • Foretrukket: erfaring med kvalitetssystemer eller regulerte miljøer som CAP/CLIA eller ISO 13485.
  • Foretrukket: kjennskap til plattformer for saksbehandling eller kundesuksess som Jira Service Management, Zendesk eller Intercom.
  • Foretrukket: erfaring med langlesningssekvensering, inkludert analyse av strukturelle varianter, STR og metylering.
  • Foretrukket: ferdigheter innen statistisk analyse og datavisualisering.
  • Foretrukket: erfaring med genomikk i våtlaboratorium.
  • Foretrukket: kjennskap til moderne AI-verktøy som Claude Code.

Fordeler

  • Fleksibel arbeidstid og mulighet for fjernarbeid, med mulighet til å jobbe fra kontoret i Toronto.
  • Helse-, tann- og synsforsikring for ansatte og deres pårørende.
  • Tre ukers ferie.
  • Ubegrenset sykefravær.
  • Ordninger med ekstra permisjon ved fødsel og foreldrepermisjon.
  • Et engangstilskudd til oppsett av hjemmekontor.
  • Støtte til karriereutvikling og læring.
  • Mulighet til å delta i selskapets aksjeopsjonsprogram for ansatte.
  • Mulighet til å bidra til åpen vitenskap og globale initiativer for datadeling.