Η DNAstack αναπτύσσει το Omics AI, μια πλατφόρμα SaaS που συμμορφώνεται με πρότυπα και επιτρέπει την ανακάλυψη, την κοινή χρήση και την ανάλυση γονιδιωματικών δεδομένων και δεδομένων υγείας σε κατανεμημένα ερευνητικά δίκτυα. Η ομοσπονδιακή προσέγγισή της επιτρέπει στους θεματοφύλακες δεδομένων να διαθέτουν ευαίσθητα σύνολα δεδομένων για ανάλυση με τεχνητή νοημοσύνη χωρίς να τα μεταφέρουν σε κεντρικό αποθετήριο, υποστηρίζοντας παράλληλα την ιδιωτικότητα, την ασφάλεια και τα πρότυπα GA4GH. Η πλατφόρμα χρησιμοποιείται σε συνεργασίες που καλύπτουν την επιτήρηση πανδημιών, τη νευροεπιστήμη, τις σπάνιες ασθένειες και την ογκολογία. Η DNAstack είναι εταιρεία λογισμικού που ιδρύθηκε το 2014 και η ομάδα της αριθμεί 11–50 εργαζομένους.
Ειδικός επιτυχίας πελατών στη βιοπληροφορική
Υποστήριξη πελατών που χρησιμοποιούν την πλατφόρμα της DNAstack για κοινή χρήση δεδομένων ιατρικής ακριβείας, από τη λειτουργία γονιδιωματικών ροών εργασίας και τους ελέγχους ποιότητας έως την ένταξη πελατών και την αντιμετώπιση τεχνικών προβλημάτων.
Περιγραφή
- Να λειτουργείς ως κύριο τεχνικό σημείο επαφής για αιτήματα πελατών, ερωτήσεις συνεργατών και αιτήματα παράδοσης δεδομένων.
- Να διερευνάς και να επιλύεις αποτυχημένες εκτελέσεις δευτερογενών και τριτογενών ροών ανάλυσης, ελαττώματα σχολιασμού ή ταξινόμησης και προβλήματα πρόσβασης στο νέφος.
- Να εντοπίζεις τις βασικές αιτίες ελλειπόντων παραλλαγών, αποκλίσεων σε δείγματα ελέγχου και καθυστερήσεων εκτέλεσης και να εξηγείς τα ευρήματα στους πελάτες.
- Να μετατρέπεις επαναλαμβανόμενα προβλήματα σε περιεχόμενο βάσης γνώσεων, οδηγούς λειτουργίας και συχνές ερωτήσεις.
- Να παρακολουθείς ροές εργασίας παραγωγής και αναπτύξεις συνόλων δεδομένων στο Google Cloud Platform και στο AWS.
- Να ρυθμίζεις και να εκτελείς ελέγχους ποιότητας εισόδου και εξόδου, καλύπτοντας την ταυτότητα δείγματος, την κάλυψη και μετρικές σε επίπεδο παραλλαγής.
- Να επικυρώνεις εκδόσεις ροών ανάλυσης και πλατφόρμας με δοκιμές παλινδρόμησης και πόρους αναφοράς όπως το GIAB.
- Να προβλέπεις και να παρακολουθείς τα υπολογιστικά έξοδα των ροών εργασίας σε παρόχους υπηρεσιών νέφους.
- Να καταγράφεις περιστατικά και να παρακολουθείς τις διορθώσεις της ομάδας μηχανικών μέχρι την επίλυσή τους.
- Να ενημερώνεις τις εξαρτήσεις των ροών ανάλυσης και να επανεπικυρώνεις ολόκληρη τη ροή εργασίας.
- Να προετοιμάζεις την ένταξη πελατών ελέγχοντας αρχεία σύλληψης στόχων, φύλλα μεταδεδομένων και αναγνωριστικά δειγμάτων.
- Να υποβάλλεις εκτελέσεις δειγμάτων και επαναναλύσεις στους λογαριασμούς πελατών, να τις παρακολουθείς και να επιβεβαιώνεις την ολοκλήρωσή τους.
- Να επαναδημιουργείς ευρετήρια, να επαναφορτώνεις και να επαληθεύεις κόμβους συνόλων δεδομένων σε περιβάλλοντα ανάπτυξης.
- Να παράγεις προσαρμοσμένα εξαγόμενα δεδομένα, όπως τμήματα BAM, αρχεία VCF σε επίπεδο συλλογής και στοχευμένα αρχεία TSV.
- Να προετοιμάζεις και να ελέγχεις την ποιότητα αποτελεσμάτων δομικών παραλλαγών, μικρών διαδοχικών επαναλήψεων (STR) και μεθυλίωσης για παράδοση σε συνεργάτες.
- Να συνεργάζεσαι με την ομάδα επιχειρηματικής ανάπτυξης για σύνολα δεδομένων επίδειξης, αποδείξεις λειτουργικότητας και εκτιμήσεις υπολογιστικού κόστους.
- Να κοινοποιείς οργανωμένα σχόλια πελατών στις ομάδες προϊόντος και μηχανικών, ώστε να συμβάλλεις στον σχεδιασμό του οδικού χάρτη.
- Να συγκρίνεις εργαλεία εντοπισμού παραλλαγών και ρυθμίσεις ροών ανάλυσης μέσω συγκριτικών δοκιμών.
- Να συνεργάζεσαι με τον Ανώτερο Βιοπληροφορικό σε διερευνητικές λειτουργίες και να συμμετέχεις στην εσωτερική λέσχη ανάγνωσης περιοδικών βιοπληροφορικής.
Απαιτήσεις
- Μεταπτυχιακός τίτλος στη υπολογιστική βιολογία, στη βιοπληροφορική, στη βιοστατιστική, στην επιστήμη υπολογιστών ή ισοδύναμη εμπειρία.
- Επαγγελματική εμπειρία 1–3 ετών σε ρόλο στον κλάδο της βιοτεχνολογίας, της διάγνωσης ή της κλινικής βιοπληροφορικής, κατά προτίμηση με εργασία με πελάτες ή συνεργάτες.
- Εξαιρετικές δεξιότητες γραπτής και προφορικής επικοινωνίας, συμπεριλαμβανομένης της ικανότητας εξήγησης σύνθετων τεχνικών θεμάτων σε κοινό χωρίς υπολογιστικό υπόβαθρο.
- Συστηματική προσέγγιση στην αντιμετώπιση προβλημάτων και στην ανάλυση βασικών αιτιών.
- Πρακτική εμπειρία στην εκτέλεση και τον εντοπισμό σφαλμάτων σε ροές επεξεργασίας δεδομένων NGS και ομικών δεδομένων.
- Εξοικείωση με τις μορφές FASTQ, BAM/CRAM, VCF και BED και με εργαλεία ανάλυσης.
- Επάρκεια σε Python, R ή Java, καθώς και ισχυρές δεξιότητες σε shell scripting και στη γραμμή εντολών.
- Μεγάλη προσοχή στη λεπτομέρεια και υπευθυνότητα για την ποιότητα των δεδομένων.
- Υπόβαθρο στη βιολογία ή τη γενετική, με ισχυρές δεξιότητες κριτικής σκέψης και έρευνας.
- Άδεια εργασίας στον Καναδά.
- Επιθυμητό: εμπειρία σε γλώσσες ροών εργασίας όπως WDL, CWL, Nextflow ή Snakemake και σε περιέκτες όπως Docker ή Singularity.
- Επιθυμητό: εμπειρία σε GCP, AWS, Azure ή περιβάλλοντα HPC, συμπεριλαμβανομένων εργαλείων παρακολούθησης και καταγραφής.
- Επιθυμητό: εμπειρία σε αυτοματοποιημένες δοκιμές ή CI/CD για ροές εργασίας βιοπληροφορικής.
- Επιθυμητό: εμπειρία σε συστήματα ποιότητας ή ρυθμιζόμενα περιβάλλοντα όπως CAP/CLIA ή ISO 13485.
- Επιθυμητό: εξοικείωση με πλατφόρμες διαχείρισης αιτημάτων ή επιτυχίας πελατών όπως Jira Service Management, Zendesk ή Intercom.
- Επιθυμητό: εμπειρία στην αλληλούχιση μακρών αναγνώσεων, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης δομικών παραλλαγών, STR και μεθυλίωσης.
- Επιθυμητό: δεξιότητες στατιστικής ανάλυσης και οπτικοποίησης δεδομένων.
- Επιθυμητό: εμπειρία στη γονιδιωματική υγρού εργαστηρίου.
- Επιθυμητό: εξοικείωση με σύγχρονα εργαλεία τεχνητής νοημοσύνης όπως το Claude Code.
Παροχές
- Ευέλικτο ωράριο και εργασία φιλική προς την εξ αποστάσεως εργασία, με δυνατότητα εργασίας από το γραφείο στο Τορόντο.
- Ιατρική, οδοντιατρική και οφθαλμολογική κάλυψη για τους εργαζομένους και τα εξαρτώμενα μέλη τους.
- Τρεις εβδομάδες άδειας.
- Απεριόριστη αναρρωτική άδεια.
- Προγράμματα συμπληρωματικών παροχών για άδεια μητρότητας και γονική άδεια.
- Εφάπαξ επίδομα για τη διαμόρφωση γραφείου εξ αποστάσεως.
- Υποστήριξη επαγγελματικής εξέλιξης και μάθησης.
- Δικαίωμα συμμετοχής στο πρόγραμμα δικαιωμάτων προαίρεσης αγοράς μετοχών εργαζομένων.
- Ευκαιρία συμβολής στην ανοικτή επιστήμη και σε πρωτοβουλίες παγκόσμιας κοινής χρήσης δεδομένων.