LogoFresh Jobs Ahead
DNAstack
DNAstack
11 – 50 Anställda
Hälso- och sjukvårdKonsultverksamhetLogistik
DNAstack bygger Omics AI, en SaaS-plattform som följer standarder och används för att upptäcka, dela och analysera genomik- och hälsodata i distribuerade forskningsnätverk. Den federerade lösningen gör det möjligt för dataansvariga att tillgängliggöra känsliga dataset för AI-baserad analys utan att samla dem i ett centralt arkiv, samtidigt som den stöder integritet, säkerhet och GA4GH-standarder. Plattformen används i samarbeten inom bland annat pandemibevakning, neurovetenskap, sällsynta sjukdomar och onkologi. DNAstack är ett mjukvaruföretag grundat 2014 med 11–50 anställda.
LinkedIn
Jobb på företaget

Specialist inom kundframgång för bioinformatik

Stöd kunder som använder DNAstacks plattform för datadelning inom precisionsmedicin, från genomiska arbetsflöden och kvalitetskontroller till introduktion och teknisk felsökning.

CAKanada
70 000 $ – 95 000 $ / år
DistansHeltidJuniorObligatoriskt Språk: engelskaCustomer success managerKundframgång
AWSAzureDockerGoogle Cloud PlatformJavaMolnPythonShellskriptning

Beskrivning

  • Var den främsta tekniska kontaktpersonen för kundärenden, partnerfrågor och dataförfrågningar.
  • Undersök och lös problem med misslyckade sekundära och tertiära pipelinekörningar, annoterings- eller sorteringsfel samt åtkomst till molntjänster.
  • Spåra saknade varianter, avvikelser i kontrollprover och långa körtider till grundorsaken och förklara sedan resultaten för kunderna.
  • Omvandla återkommande problem till innehåll i kunskapsbasen, driftinstruktioner och vanliga frågor.
  • Övervaka produktionsflöden och driftsättningar av dataset på Google Cloud Platform och AWS.
  • Ta fram och utföra kvalitetskontroller av in- och utdata, inklusive providentitet, täckning och mätvärden på variantnivå.
  • Validera uppdateringar av pipelines och plattformen med regressionstester och referensresurser som GIAB.
  • Prognostisera och följa upp beräkningskostnader för arbetsflöden hos olika molnleverantörer.
  • Dokumentera incidenter och följa tekniska korrigeringar tills de är genomförda.
  • Uppdatera pipelineberoenden och validera hela arbetsflödet på nytt.
  • Förbereda kundintroduktion genom att kontrollera målfångstfiler, metadataark och prov-ID:n.
  • Skicka in, övervaka och bekräfta provkörningar och omkörda analyser för olika kundkonton.
  • Indexera om, läsa in på nytt och verifiera datasetnoder i olika driftsmiljöer.
  • Ta fram anpassade datautdrag, till exempel BAM-utdrag, VCF-filer på samlingsnivå och riktade TSV-filer.
  • Förbereda och kvalitetskontrollera resultat för strukturella varianter, korta tandemupprepningar och metylering inför leverans till partner.
  • Samarbeta med affärsutveckling kring demonstrationsdataset, koncepttester och uppskattningar av beräkningskostnader.
  • Sammanställa kundernas synpunkter och dela dem med produkt- och teknikteam för att bidra till produktplanen.
  • Jämföra variantdetektorer och pipelineinställningar genom benchmarking.
  • Samarbeta med den seniora bioinformatikern kring utforskande funktioner och delta i den interna journal cluben för bioinformatik.

Krav

  • Masterexamen i beräkningsbiologi, bioinformatik, biostatistik, datavetenskap eller motsvarande erfarenhet.
  • 1–3 års yrkeserfarenhet från bioteknik, diagnostik eller klinisk bioinformatik, gärna med kund- eller partnerkontakt.
  • Mycket god förmåga att kommunicera muntligt och skriftligt, inklusive att förklara komplexa tekniska frågor för personer utan beräkningsbakgrund.
  • Systematiskt arbetssätt för felsökning och rotorsaksanalys.
  • Praktisk erfarenhet av att köra och felsöka pipelines för NGS- och omikdata.
  • Arbetskunskap om formaten FASTQ, BAM/CRAM, VCF och BED samt analysverktyg.
  • Goda kunskaper i Python, R eller Java samt starka kunskaper i skalskript och kommandoradsverktyg.
  • Noggrannhet och ansvarskänsla för datakvalitet.
  • Bakgrund inom biologi eller genetik samt god analytisk och forskningsmässig förmåga.
  • Tillstånd att arbeta i Kanada.
  • Meriterande: erfarenhet av arbetsflödesspråk som WDL, CWL, Nextflow eller Snakemake och containrar som Docker eller Singularity.
  • Meriterande: erfarenhet av GCP, AWS, Azure eller HPC-miljöer, inklusive övervaknings- och loggningsverktyg.
  • Meriterande: erfarenhet av automatiserade tester eller CI/CD för bioinformatikpipelines.
  • Meriterande: erfarenhet av kvalitetssystem eller reglerade miljöer som CAP/CLIA eller ISO 13485.
  • Meriterande: kännedom om ärendehanterings- eller kundframgångsplattformar som Jira Service Management, Zendesk eller Intercom.
  • Meriterande: erfarenhet av långläsningssekvensering, inklusive analys av strukturella varianter, STR och metylering.
  • Meriterande: kunskaper i statistisk analys och datavisualisering.
  • Meriterande: erfarenhet av genomik i våtlaboratorium.
  • Meriterande: kännedom om moderna AI-verktyg som Claude Code.

Förmåner

  • Flexibla arbetstider och möjlighet till distansarbete, med möjlighet att arbeta på plats vid kontoret i Toronto.
  • Sjukvårds-, tandvårds- och synvårdsförsäkring för anställda och deras anhöriga.
  • Tre veckors semester.
  • Obegränsad sjukfrånvaro.
  • Utfyllnadsprogram för föräldraledighet vid graviditet och föräldraskap.
  • Ett engångsbidrag för att inreda ett hemmakontor.
  • Stöd för karriärutveckling och lärande.
  • Möjlighet att delta i företagets aktieoptionsprogram för anställda.
  • Möjlighet att bidra till öppen vetenskap och globala initiativ för datadelning.

Relaterade jobb

Serve Robotics

Finansanalytiker, FP&A — Serve Robotics (Distans, USA)

Serve Robotics
51 – 200 Anställda
Sponsor för H1B-visumLivsmedel och dryckerLogistikTransport
USUSA
100 000 $ – 125 000 $ / år
DistansHeltidMellannivåSeniorObligatoriskt Språk: engelskaFinansiell planering och analys
ERP

Stöd budgetering, prognoser och scenarioanalys för Serve Robotics verksamhet inom leveranser på trottoarer. Använd avancerade kunskaper i Excel, Google Kalkylark och ChatGPT för att ta fram finansiella insikter.

Öppna