A DNAstack desenvolve o Omics AI, uma plataforma SaaS em conformidade com padrões para descobrir, compartilhar e analisar dados genômicos e de saúde em redes de pesquisa distribuídas. Sua abordagem federada permite que os responsáveis pelos dados disponibilizem conjuntos de dados sensíveis para análises com IA sem transferi-los para um repositório central, ao mesmo tempo que oferece suporte à privacidade, à segurança e aos padrões da GA4GH. A plataforma é usada em colaborações que abrangem vigilância de pandemias, neurociência, doenças raras e oncologia. A DNAstack é uma empresa de software fundada em 2014, com uma equipe de 11 a 50 pessoas.
Especialista em sucesso do cliente em bioinformática
Presta suporte a clientes que usam a plataforma de compartilhamento de dados de medicina de precisão da DNAstack, da operação de pipelines genômicos e verificações de qualidade à integração e solução de problemas técnicos.
Descrição
- Atua como principal contato técnico para chamados de clientes, dúvidas de parceiros e solicitações de entrega de dados.
- Investiga e resolve falhas em execuções de pipelines secundários e terciários, defeitos de anotação ou ordenação e problemas de acesso à nuvem.
- Rastreia as causas raiz de variantes ausentes, discrepâncias em amostras de controle e atrasos de execução, e explica os resultados aos clientes.
- Transforma problemas recorrentes em conteúdo para a base de conhecimento, manuais operacionais e perguntas frequentes.
- Monitora fluxos de trabalho de produção e implantações de conjuntos de dados no Google Cloud Platform e na AWS.
- Configura e realiza verificações de qualidade de entrada e saída, abrangendo identidade das amostras, cobertura e métricas no nível de variante.
- Valida versões de pipelines e da plataforma com testes de regressão e recursos de referência, como o GIAB.
- Prevê e acompanha os custos computacionais dos fluxos de trabalho entre provedores de nuvem.
- Registra incidentes e acompanha correções de engenharia até a resolução.
- Atualiza as dependências dos pipelines e revalida o fluxo de trabalho completo.
- Prepara a integração de clientes verificando arquivos de captura de regiões-alvo, planilhas de metadados e identificadores de amostras.
- Envia, monitora e confirma execuções e reanálises de amostras nas contas dos clientes.
- Reindexa, recarrega e verifica nós de conjuntos de dados em diferentes ambientes de implantação.
- Produz extrações de dados personalizadas, como recortes de BAM, arquivos VCF no nível de coleção e arquivos TSV direcionados.
- Prepara e verifica a qualidade de resultados de variantes estruturais, repetições curtas em tandem e metilação para entrega a parceiros.
- Trabalha com Desenvolvimento de Negócios em conjuntos de dados para demonstrações, provas de conceito e estimativas de custos computacionais.
- Compartilha feedback organizado dos clientes com as equipes de produto e engenharia para orientar o roteiro do produto.
- Compara ferramentas de chamada de variantes e configurações de pipelines por meio de benchmarking.
- Colabora com o bioinformata sênior em recursos exploratórios e participa do clube interno de leitura de bioinformática.
Requisitos
- Mestrado em biologia computacional, bioinformática, bioestatística, ciência da computação ou experiência equivalente.
- De 1 a 3 anos de experiência profissional em biotecnologia, diagnóstico ou bioinformática clínica na indústria, de preferência trabalhando com clientes ou parceiros.
- Excelentes habilidades de comunicação oral e escrita, incluindo a capacidade de explicar questões técnicas complexas a pessoas sem formação computacional.
- Abordagem sistemática para solução de problemas e análise de causa raiz.
- Experiência prática na execução e depuração de pipelines de processamento de dados de NGS e ômicos.
- Familiaridade prática com os formatos FASTQ, BAM/CRAM, VCF e BED e com ferramentas de análise.
- Proficiência em Python, R ou Java, além de sólidas habilidades em shell scripting e linha de comando.
- Atenção cuidadosa aos detalhes e responsabilidade pela qualidade dos dados.
- Formação em biologia ou genética, com fortes habilidades de pensamento crítico e pesquisa.
- Autorização para trabalhar no Canadá.
- Diferencial: experiência com linguagens de fluxo de trabalho, como WDL, CWL, Nextflow ou Snakemake, e contêineres, como Docker ou Singularity.
- Diferencial: experiência com GCP, AWS, Azure ou ambientes HPC, incluindo ferramentas de monitoramento e registro.
- Diferencial: experiência com testes automatizados ou CI/CD para pipelines de bioinformática.
- Diferencial: experiência em sistemas de qualidade ou ambientes regulamentados, como CAP/CLIA ou ISO 13485.
- Diferencial: familiaridade com plataformas de chamados ou sucesso do cliente, como Jira Service Management, Zendesk ou Intercom.
- Diferencial: experiência com sequenciamento de leituras longas, incluindo análise de variantes estruturais, STR e metilação.
- Diferencial: habilidades de análise estatística e visualização de dados.
- Diferencial: experiência em genômica de bancada.
- Diferencial: familiaridade com ferramentas modernas de IA, como Claude Code.
Benefícios
- Horário flexível e trabalho compatível com o modelo remoto, com opção de trabalhar no escritório de Toronto.
- Cobertura médica, odontológica e oftalmológica para funcionários e seus dependentes.
- Três semanas de férias.
- Licença médica ilimitada.
- Programas de complemento salarial para licenças maternidade e parental.
- Auxílio único para montar um escritório remoto.
- Apoio ao desenvolvimento de carreira e à aprendizagem.
- Elegibilidade para participar do Programa de Opções de Ações para Funcionários.
- Oportunidade de contribuir para a ciência aberta e iniciativas globais de compartilhamento de dados.