DNAstackは、分散型研究ネットワークでゲノムデータや健康データを発見、共有、分析するための、標準準拠のSaaSプラットフォーム「Omics AI」を構築しています。フェデレーテッド方式により、データ管理者は機微なデータセットを中央リポジトリに集約せずにAI分析へ利用でき、プライバシーとセキュリティを保ちながらGA4GH標準にも対応できます。このプラットフォームは、パンデミック監視、神経科学、希少疾患、腫瘍学にまたがる共同研究で利用されています。DNAstackは2014年創業のソフトウェア企業で、従業員数は11～50人です。
バイオインフォマティクス カスタマーサクセススペシャリスト
DNAstackの精密医療向けデータ共有プラットフォームを利用する顧客をサポートします。 ゲノム解析パイプラインの運用や品質確認から、導入支援、技術的なトラブルシューティングまで担当します。
仕事内容
- 顧客チケット、パートナーからの問い合わせ、データ納品依頼の主な技術窓口を務めます。
- 二次・三次解析パイプラインの実行失敗、アノテーションやソートの不具合、クラウドアクセスの問題を調査して解決します。
- バリアントの欠落、対照サンプルの不一致、実行遅延の根本原因を特定し、調査結果を顧客に説明します。
- 繰り返し発生する問題を、ナレッジベースの記事、手順書、FAQにまとめます。
- Google Cloud PlatformとAWS上の本番ワークフローおよびデータセットのデプロイを監視します。
- サンプルの同一性、カバレッジ、バリアントレベルの指標を対象に、入力・出力の品質確認を設定して実施します。
- 回帰テストやGIABなどの参照リソースを使って、パイプラインとプラットフォームのリリースを検証します。
- クラウドプロバイダーごとのワークフロー計算費用を予測し、追跡します。
- インシデントを記録し、解決までエンジニアリングチームの修正対応を追跡します。
- パイプラインの依存関係を更新し、ワークフロー全体を再検証します。
- ターゲットキャプチャファイル、メタデータシート、サンプル識別子を確認し、顧客の導入準備を行います。
- 顧客アカウント間でサンプル解析や再解析を登録、監視し、完了を確認します。
- 各デプロイ環境でデータセットノードを再インデックス、再ロードし、検証します。
- BAMの部分データ、コレクション単位のVCF、対象を絞ったTSVファイルなど、要望に応じたデータ抽出物を作成します。
- パートナーへの納品に向けて、構造バリアント、短鎖タンデムリピート、メチル化の結果を準備し、品質を確認します。
- 事業開発チームと連携し、デモ用データセット、概念実証、計算コストの見積もりを準備します。
- 顧客からのフィードバックを整理してプロダクトチームとエンジニアリングチームに共有し、ロードマップ策定に役立てます。
- ベンチマークを通じて、バリアントコーラーやパイプライン設定を比較します。
- スタッフバイオインフォマティシャンと探索的な機能開発に取り組み、社内のバイオインフォマティクス読書会に参加します。
応募要件
- 計算生物学、バイオインフォマティクス、生物統計学、コンピューターサイエンスの修士号、または同等の経験。
- バイオテクノロジー、診断、臨床バイオインフォマティクス分野で1～3年の実務経験。顧客やパートナーとの業務経験があれば尚可。
- 優れた文章力と会話力を持ち、計算分野以外の相手にも複雑な技術事項を説明できること。
- 体系的なトラブルシューティングと根本原因分析ができること。
- NGSおよびオミクスデータ処理パイプラインの実行とデバッグに関する実務経験。
- FASTQ、BAM/CRAM、VCF、BED形式および解析ツールに関する実務的な知識。
- Python、R、Javaのいずれかに習熟し、シェルスクリプトとコマンドライン操作に優れていること。
- 細部に注意を払い、データ品質に責任を持って取り組めること。
- 生物学または遺伝学の知識があり、優れた批判的思考力と調査力を備えていること。
- カナダで就労する資格があること。
- 歓迎条件：WDL、CWL、Nextflow、Snakemakeなどのワークフロー言語や、Docker、Singularityなどのコンテナの使用経験。
- 歓迎条件：GCP、AWS、Azure、HPC環境の使用経験。監視・ログツールの経験を含む。
- 歓迎条件：バイオインフォマティクスパイプラインの自動テストまたはCI/CDの経験。
- 歓迎条件：CAP/CLIAやISO 13485などの品質システムまたは規制環境での経験。
- 歓迎条件：Jira Service Management、Zendesk、Intercomなどのチケット管理またはカスタマーサクセスプラットフォームに関する知識。
- 歓迎条件：構造バリアント、STR、メチル化解析を含むロングリードシーケンシングの経験。
- 歓迎条件：統計解析とデータ可視化のスキル。
- 歓迎条件：ゲノミクスのウェットラボ経験。
- 歓迎条件：Claude Codeなどの最新AIツールに関する知識。
福利厚生
- 柔軟な勤務時間とリモートワークに対応し、トロントオフィスへの出社も選択できます。
- 従業員と扶養家族を対象とする医療、歯科、眼科の保険。
- 3週間の休暇。
- 病気休暇は無制限。
- 出産休暇および育児休暇の補填制度。
- リモートオフィスのセットアップに使える一時金。
- キャリア開発と学習の支援。
- 従業員株式オプション制度への参加資格。
- オープンサイエンスとグローバルなデータ共有の取り組みに貢献できる機会。