DNAstack
DNAstack
تطوّر DNAstack منصة Omics AI، وهي منصة برمجية كخدمة متوافقة مع المعايير لاكتشاف البيانات الجينومية والصحية ومشاركتها وتحليلها عبر شبكات بحثية موزعة. يتيح نهجها الاتحادي للقائمين على حفظ البيانات إتاحة مجموعات البيانات الحساسة للتحليل المدعوم بالذكاء الاصطناعي من دون نقلها إلى مستودع مركزي، مع دعم الخصوصية والأمان ومعايير GA4GH. وتُستخدم المنصة في تعاونات تشمل مراقبة الأوبئة وعلم الأعصاب والأمراض النادرة والأورام. DNAstack شركة برمجيات تأسست عام 2014، ويضم فريقها 11 إلى 50 موظفًا.

أخصائي نجاح العملاء في المعلوماتية الحيوية

دعم العملاء في استخدام منصة DNAstack لمشاركة بيانات الطب الدقيق، بدءًا من تشغيل مسارات العمل الجينومية وفحوص الجودة وصولًا إلى تهيئة العملاء الجدد واستكشاف المشكلات التقنية وإصلاحها.

الوصف

  • تولّى دور جهة الاتصال التقنية الرئيسية لتذاكر العملاء واستفسارات الشركاء وطلبات تسليم البيانات.
  • تحرَّ عن حالات فشل تشغيل مسارات المعالجة الثانوية والثالثية، وعيوب التعليق التوضيحي أو الفرز، ومشكلات الوصول إلى السحابة، واعمل على حلها.
  • تتبّع المتغيرات المفقودة والتباينات في العينات الضابطة وتأخيرات وقت التشغيل حتى تصل إلى أسبابها الجذرية، ثم اشرح النتائج للعملاء.
  • حوّل المشكلات المتكررة إلى محتوى لقاعدة المعرفة، وأدلة تشغيل، وأسئلة شائعة.
  • راقب مسارات العمل الإنتاجية وعمليات نشر مجموعات البيانات على Google Cloud Platform وAWS.
  • أعدّ فحوص جودة المدخلات والمخرجات ونفّذها، بما يشمل هوية العينة والتغطية ومقاييس مستوى المتغيرات.
  • تحقّق من إصدارات مسارات العمل والمنصة باستخدام اختبارات الانحدار وموارد مرجعية مثل GIAB.
  • توقّع نفقات الحوسبة لمسارات العمل لدى موفري الخدمات السحابية وتتبّعها.
  • سجّل الحوادث وتابع الإصلاحات الهندسية حتى اكتمالها.
  • حدّث تبعيات مسارات العمل وأعِد التحقق من سير العمل بالكامل.
  • هيّئ انضمام العملاء الجدد من خلال التحقق من ملفات الالتقاط المستهدفة وجداول البيانات الوصفية ومعرّفات العينات.
  • قدّم عمليات تشغيل العينات وإعادة تحليلها عبر حسابات العملاء، وراقبها وأكّد اكتمالها.
  • أعِد فهرسة عُقد مجموعات البيانات وإعادة تحميلها والتحقق منها عبر بيئات النشر.
  • أنتج مستخرجات بيانات مخصصة، مثل مقاطع BAM وملفات VCF على مستوى المجموعة وملفات TSV المستهدفة.
  • أعدّ نتائج المتغيرات البنيوية والتكرارات الترادفية القصيرة والميثلة لتسليمها إلى الشركاء، وافحص جودتها.
  • تعاون مع فريق تطوير الأعمال بشأن مجموعات بيانات العروض التوضيحية وإثباتات المفهوم وتقديرات تكاليف الحوسبة.
  • شارك ملاحظات العملاء المنظّمة مع فريقي المنتج والهندسة للمساعدة في توجيه خارطة الطريق.
  • قارن بين أدوات استدعاء المتغيرات وإعدادات مسارات العمل من خلال قياس الأداء.
  • تعاون مع اختصاصي المعلوماتية الحيوية الأول على الميزات الاستكشافية وشارك في نادي المجلة الداخلية للمعلوماتية الحيوية.

المتطلبات

  • درجة الماجستير في الأحياء الحاسوبية أو المعلوماتية الحيوية أو الإحصاء الحيوي أو علوم الحاسوب، أو خبرة معادلة.
  • خبرة مهنية من سنة إلى ثلاث سنوات في مجال التكنولوجيا الحيوية أو التشخيص أو المعلوماتية الحيوية السريرية، ويُفضّل أن تشمل العمل مع العملاء أو الشركاء.
  • مهارات ممتازة في التواصل الكتابي والشفهي، بما في ذلك القدرة على شرح المسائل التقنية المعقدة لجمهور غير متخصص حاسوبيًا.
  • نهج منهجي في استكشاف المشكلات وإصلاحها وتحليل أسبابها الجذرية.
  • خبرة عملية في تشغيل مسارات معالجة بيانات التسلسل من الجيل التالي (NGS) والبيانات الأوميّة وتصحيح أخطائها.
  • إلمام عملي بتنسيقات FASTQ وBAM/CRAM وVCF وBED وأدوات التحليل.
  • إتقان Python أو R أو Java، إلى جانب مهارات قوية في البرمجة النصية باستخدام Shell وسطر الأوامر.
  • اهتمام دقيق بالتفاصيل وتحمل المسؤولية عن جودة البيانات.
  • خلفية في علم الأحياء أو علم الوراثة، مع مهارات قوية في التفكير النقدي والبحث.
  • تصريح بالعمل في كندا.
  • يُفضّل: خبرة بلغات مسارات العمل مثل WDL أو CWL أو Nextflow أو Snakemake، وبالحاويات مثل Docker أو Singularity.
  • يُفضّل: خبرة في GCP أو AWS أو Azure أو بيئات الحوسبة عالية الأداء (HPC)، بما يشمل أدوات المراقبة والتسجيل.
  • يُفضّل: خبرة في الاختبارات الآلية أو التكامل والتسليم المستمر (CI/CD) لمسارات المعلوماتية الحيوية.
  • يُفضّل: خبرة في أنظمة الجودة أو البيئات الخاضعة للتنظيم مثل CAP/CLIA أو ISO 13485.
  • يُفضّل: إلمام بمنصات إدارة التذاكر أو نجاح العملاء مثل Jira Service Management أو Zendesk أو Intercom.
  • يُفضّل: خبرة في التسلسل طويل القراءة، بما يشمل تحليل المتغيرات البنيوية والتكرارات الترادفية القصيرة والميثلة.
  • يُفضّل: مهارات في التحليل الإحصائي وتصوير البيانات.
  • يُفضّل: خبرة في علم الجينوم المخبري.
  • يُفضّل: إلمام بأدوات الذكاء الاصطناعي الحديثة مثل Claude Code.

المزايا

  • جدولة مرنة وعمل ملائم للعمل عن بُعد، مع إمكانية العمل من مكتب تورونتو.
  • تغطية طبية وتغطية للأسنان والبصر للموظفين ومَن يعولونهم.
  • إجازة سنوية لمدة ثلاثة أسابيع.
  • إجازة مرضية غير محدودة.
  • برامج دعم مالي إضافي لإجازتي الأمومة والوالدية.
  • مخصص لمرة واحدة لتجهيز مكتب منزلي.
  • دعم للتطوير المهني والتعلّم.
  • الأهلية للمشاركة في برنامج خيارات أسهم الموظفين.
  • فرصة للإسهام في العلم المفتوح ومبادرات مشاركة البيانات عالميًا.