DNAstack tworzy Omics AI — zgodną ze standardami platformę SaaS do odkrywania, udostępniania i analizowania danych genomicznych oraz zdrowotnych w rozproszonych sieciach badawczych. Federacyjne podejście pozwala administratorom danych udostępniać wrażliwe zbiory do analiz wspieranych przez AI bez przenoszenia ich do centralnego repozytorium, przy zachowaniu prywatności, bezpieczeństwa i zgodności ze standardami GA4GH. Platforma jest wykorzystywana we współpracach obejmujących nadzór nad pandemią, neuronaukę, choroby rzadkie i onkologię. DNAstack to firma programistyczna założona w 2014 roku, zatrudniająca 11–50 osób.
Specjalista ds. obsługi klienta w bioinformatyce
Wspieraj klientów korzystających z platformy DNAstack do udostępniania danych w medycynie precyzyjnej: od obsługi procesów genomowych i kontroli jakości po wdrożenie i rozwiązywanie problemów technicznych.
Kanada70 000 $ – 95 000 $ / rok
ZdalniePełny etatJuniorWymagany Język: angielskiMenedżer ds. sukcesu klientaSukces klientaOpis
- Pełnij funkcję głównej osoby kontaktowej w sprawach technicznych dotyczących zgłoszeń klientów, pytań partnerów i próśb o dostarczenie danych.
- Badaj i rozwiązuj problemy z nieudanymi uruchomieniami drugiego i trzeciego etapu potoków, błędami adnotacji lub sortowania oraz dostępem do chmury.
- Ustalaj przyczyny źródłowe brakujących wariantów, rozbieżności w próbkach kontrolnych i opóźnień działania, a następnie wyjaśniaj wyniki klientom.
- Przekształcaj powtarzające się problemy w materiały bazy wiedzy, instrukcje operacyjne i odpowiedzi na często zadawane pytania.
- Monitoruj przepływy pracy w środowisku produkcyjnym i wdrażanie zbiorów danych w Google Cloud Platform oraz AWS.
- Konfiguruj i przeprowadzaj kontrole jakości danych wejściowych i wyjściowych, obejmujące tożsamość próbek, pokrycie i metryki na poziomie wariantów.
- Weryfikuj wydania potoków i platformy za pomocą testów regresyjnych oraz zasobów referencyjnych, takich jak GIAB.
- Prognozuj i śledź koszty obliczeniowe przepływów pracy u różnych dostawców usług chmurowych.
- Rejestruj incydenty i monitoruj poprawki zespołu inżynieryjnego aż do ich wdrożenia.
- Aktualizuj zależności potoków i ponownie weryfikuj cały przepływ pracy.
- Przygotowuj klientów do rozpoczęcia pracy, sprawdzając pliki przechwytywania celów, arkusze metadanych i identyfikatory próbek.
- Zlecaj, monitoruj i potwierdzaj przebiegi próbek oraz ponowne analizy na kontach klientów.
- Ponownie indeksuj, wczytuj i weryfikuj węzły zbiorów danych w różnych środowiskach wdrożeniowych.
- Twórz dostosowane wyciągi danych, takie jak fragmenty BAM, pliki VCF dla całych kolekcji i ukierunkowane pliki TSV.
- Przygotowuj i kontroluj jakość wyników analizy wariantów strukturalnych, krótkich powtórzeń tandemowych i metylacji przed przekazaniem partnerom.
- Współpracuj z zespołem ds. rozwoju biznesu przy tworzeniu zestawów demonstracyjnych, weryfikacji koncepcji i szacowaniu kosztów obliczeniowych.
- Przekazuj zespołom produktowym i inżynieryjnym uporządkowane opinie klientów, aby wspierać tworzenie planu rozwoju produktu.
- Porównuj programy do wykrywania wariantów i ustawienia potoków za pomocą testów porównawczych.
- Współpracuj ze starszym bioinformatykiem nad funkcjami eksperymentalnymi i bierz udział w wewnętrznym klubie czasopism bioinformatycznych.
Wymagania
- Tytuł magistra z biologii obliczeniowej, bioinformatyki, biostatystyki, informatyki lub równoważne doświadczenie.
- 1–3 lata doświadczenia zawodowego w firmie biotechnologicznej, diagnostyce lub bioinformatyce klinicznej, najlepiej w pracy z klientami lub partnerami.
- Doskonałe umiejętności komunikacji pisemnej i ustnej, w tym umiejętność wyjaśniania złożonych zagadnień technicznych osobom bez przygotowania obliczeniowego.
- Systematyczne podejście do rozwiązywania problemów i analizy ich przyczyn źródłowych.
- Praktyczne doświadczenie w uruchamianiu i debugowaniu potoków przetwarzania danych NGS i omicznych.
- Praktyczna znajomość formatów FASTQ, BAM/CRAM, VCF i BED oraz narzędzi analitycznych.
- Biegła znajomość Python, R lub Java, a także umiejętność pisania skryptów powłoki i pracy w wierszu poleceń.
- Dbałość o szczegóły i odpowiedzialność za jakość danych.
- Wykształcenie lub doświadczenie w biologii albo genetyce oraz umiejętność krytycznego myślenia i prowadzenia badań.
- Prawo do pracy w Kanadzie.
- Atutem będzie: doświadczenie z językami opisu przepływów pracy, takimi jak WDL, CWL, Nextflow lub Snakemake, oraz kontenerami, takimi jak Docker lub Singularity.
- Atutem będzie: doświadczenie z GCP, AWS, Azure lub środowiskami HPC, w tym narzędziami do monitorowania i rejestrowania zdarzeń.
- Atutem będzie: doświadczenie w automatycznym testowaniu lub CI/CD potoków bioinformatycznych.
- Atutem będzie: doświadczenie z systemami jakości lub w środowiskach regulowanych, takich jak CAP/CLIA lub ISO 13485.
- Atutem będzie: znajomość platform obsługi zgłoszeń lub obsługi klienta, takich jak Jira Service Management, Zendesk lub Intercom.
- Atutem będzie: doświadczenie w sekwencjonowaniu długich odczytów, w tym analizie wariantów strukturalnych, STR i metylacji.
- Atutem będą: umiejętności analizy statystycznej i wizualizacji danych.
- Atutem będzie: doświadczenie w laboratoryjnej genomice.
- Atutem będzie: znajomość nowoczesnych narzędzi AI, takich jak Claude Code.
Benefity
- Elastyczny harmonogram i możliwość pracy zdalnej, a także możliwość pracy w biurze w Toronto.
- Ubezpieczenie medyczne, stomatologiczne i okulistyczne dla pracowników oraz osób pozostających na ich utrzymaniu.
- Trzy tygodnie urlopu.
- Nielimitowany urlop chorobowy.
- Programy uzupełniające świadczenia z tytułu urlopu macierzyńskiego i rodzicielskiego.
- Jednorazowe dofinansowanie na urządzenie zdalnego miejsca pracy.
- Wsparcie rozwoju zawodowego i nauki.
- Możliwość udziału w programie opcji na akcje dla pracowników.
- Możliwość wspierania otwartej nauki i globalnych inicjatyw udostępniania danych.