DNAstack พัฒนา Omics AI ซึ่งเป็นแพลตฟอร์ม SaaS ที่สอดคล้องกับมาตรฐาน สำหรับการค้นหา แบ่งปัน และวิเคราะห์ข้อมูลจีโนมและข้อมูลสุขภาพในเครือข่ายวิจัยแบบกระจายศูนย์ แนวทางแบบสหพันธ์ช่วยให้ผู้ดูแลข้อมูลเปิดให้ใช้ชุดข้อมูลที่มีความอ่อนไหวสำหรับการวิเคราะห์ด้วย AI ได้โดยไม่ต้องย้ายข้อมูลไปไว้ในคลังข้อมูลส่วนกลาง พร้อมรองรับความเป็นส่วนตัว ความปลอดภัย และมาตรฐาน GA4GH แพลตฟอร์มนี้ใช้ในความร่วมมือด้านการเฝ้าระวังการระบาดใหญ่ ประสาทวิทยาศาสตร์ โรคหายาก และมะเร็งวิทยา DNAstack เป็นบริษัทซอฟต์แวร์ที่ก่อตั้งในปี 2014 และมีทีมงาน 11–50 คน
ผู้เชี่ยวชาญด้านความสำเร็จของลูกค้าสายชีวสารสนเทศ
สนับสนุนลูกค้าที่ใช้แพลตฟอร์มแบ่งปันข้อมูลการแพทย์แม่นยำของ DNAstack ตั้งแต่การดูแลไปป์ไลน์จีโนมิกส์และตรวจสอบคุณภาพ ไปจนถึงการเริ่มใช้งานและแก้ไขปัญหาทางเทคนิค
รายละเอียด
- เป็นผู้ติดต่อหลักด้านเทคนิคสำหรับคำขอช่วยเหลือจากลูกค้า คำถามจากพันธมิตร และคำขอส่งมอบข้อมูล
- ตรวจสอบและแก้ไขการทำงานที่ล้มเหลวของไปป์ไลน์ขั้นทุติยภูมิและตติยภูมิ ข้อบกพร่องด้านการทำ annotation หรือการจัดเรียง และปัญหาการเข้าถึงคลาวด์
- ติดตามหาสาเหตุรากของตัวแปรพันธุกรรมที่หายไป ความคลาดเคลื่อนของตัวอย่างควบคุม และความล่าช้าของเวลาประมวลผล แล้วอธิบายผลการตรวจสอบให้ลูกค้าทราบ
- เปลี่ยนปัญหาที่เกิดซ้ำให้เป็นเนื้อหาในฐานความรู้ คู่มือปฏิบัติงาน และคำถามที่พบบ่อย
- ติดตามเวิร์กโฟลว์การผลิตและการนำชุดข้อมูลขึ้นใช้งานบน Google Cloud Platform และ AWS
- ตั้งค่าและดำเนินการตรวจสอบคุณภาพข้อมูลขาเข้าและขาออก ครอบคลุมอัตลักษณ์ตัวอย่าง ความครอบคลุม และตัวชี้วัดระดับตัวแปรพันธุกรรม
- ตรวจสอบความถูกต้องของรุ่นไปป์ไลน์และแพลตฟอร์มด้วยการทดสอบถดถอยและทรัพยากรอ้างอิง เช่น GIAB
- คาดการณ์และติดตามค่าใช้จ่ายด้านการประมวลผลของเวิร์กโฟลว์ในผู้ให้บริการคลาวด์ต่าง ๆ
- บันทึกเหตุการณ์และติดตามการแก้ไขจากทีมวิศวกรรมจนกว่าจะเสร็จสิ้น
- อัปเดต dependencies ของไปป์ไลน์และตรวจสอบเวิร์กโฟลว์ทั้งหมดซ้ำ
- เตรียมการเริ่มใช้งานของลูกค้าโดยตรวจสอบไฟล์ target capture แผ่นข้อมูลเมทาดาทา และรหัสระบุตัวอย่าง
- ส่งคำขอ ติดตาม และยืนยันการประมวลผลตัวอย่างและการวิเคราะห์ซ้ำในบัญชีลูกค้าต่าง ๆ
- สร้างดัชนีใหม่ โหลดซ้ำ และตรวจสอบโหนดชุดข้อมูลในสภาพแวดล้อมการนำขึ้นใช้งานต่าง ๆ
- จัดทำข้อมูลที่คัดแยกตามความต้องการ เช่น ส่วนย่อยของ BAM ไฟล์ VCF ระดับคอลเลกชัน และไฟล์ TSV เฉพาะเป้าหมาย
- จัดเตรียมและตรวจสอบคุณภาพผลการวิเคราะห์ structural variant, short tandem repeat และ methylation ก่อนส่งมอบให้พันธมิตร
- ทำงานร่วมกับฝ่ายพัฒนาธุรกิจเกี่ยวกับชุดข้อมูลสาธิต การพิสูจน์แนวคิด และการประเมินค่าใช้จ่ายด้านการประมวลผล
- รวบรวมความคิดเห็นของลูกค้าอย่างเป็นระบบและแบ่งปันกับทีมผลิตภัณฑ์และวิศวกรรมเพื่อใช้กำหนดแผนงาน
- เปรียบเทียบเครื่องมือเรียกตัวแปรพันธุกรรมและการตั้งค่าไปป์ไลน์ด้วยการทดสอบประสิทธิภาพ
- ร่วมมือกับนักชีวสารสนเทศอาวุโสในฟีเจอร์เชิงสำรวจ และเข้าร่วมชมรมอ่านงานวิชาการด้านชีวสารสนเทศภายในองค์กร
คุณสมบัติ
- วุฒิปริญญาโทด้านชีววิทยาเชิงคำนวณ ชีวสารสนเทศ ชีวสถิติ วิทยาการคอมพิวเตอร์ หรือประสบการณ์เทียบเท่า
- มีประสบการณ์ทำงานในอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ การวินิจฉัย หรือชีวสารสนเทศทางคลินิก 1–3 ปี โดยควรมีประสบการณ์ทำงานกับลูกค้าหรือพันธมิตร
- มีทักษะการสื่อสารทั้งการเขียนและการพูดเป็นเลิศ รวมถึงความสามารถในการอธิบายประเด็นทางเทคนิคที่ซับซ้อนให้ผู้ฟังที่ไม่ใช่สายคำนวณเข้าใจ
- มีแนวทางการแก้ไขปัญหาและวิเคราะห์สาเหตุรากอย่างเป็นระบบ
- มีประสบการณ์ปฏิบัติจริงในการรันและดีบักไปป์ไลน์ประมวลผลข้อมูล NGS และ omics
- คุ้นเคยกับรูปแบบไฟล์ FASTQ, BAM/CRAM, VCF และ BED รวมถึงเครื่องมือวิเคราะห์
- เชี่ยวชาญ Python, R หรือ Java พร้อมทักษะการเขียน shell script และใช้งาน command line ที่แข็งแกร่ง
- ใส่ใจรายละเอียดและรับผิดชอบต่อคุณภาพข้อมูล
- มีพื้นฐานด้านชีววิทยาหรือพันธุศาสตร์ พร้อมทักษะการคิดเชิงวิพากษ์และการวิจัยที่ดี
- ได้รับอนุญาตให้ทำงานในแคนาดา
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์กับภาษาเวิร์กโฟลว์ เช่น WDL, CWL, Nextflow หรือ Snakemake และคอนเทนเนอร์ เช่น Docker หรือ Singularity
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์กับ GCP, AWS, Azure หรือสภาพแวดล้อม HPC รวมถึงเครื่องมือติดตามและบันทึก log
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์ทดสอบอัตโนมัติหรือ CI/CD สำหรับไปป์ไลน์ชีวสารสนเทศ
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์ในระบบคุณภาพหรือสภาพแวดล้อมที่มีการกำกับดูแล เช่น CAP/CLIA หรือ ISO 13485
- พิจารณาเป็นพิเศษ: คุ้นเคยกับแพลตฟอร์มจัดการคำขอช่วยเหลือหรืองานดูแลความสำเร็จของลูกค้า เช่น Jira Service Management, Zendesk หรือ Intercom
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์การหาลำดับเบสแบบอ่านยาว รวมถึงการวิเคราะห์ structural variant, STR และ methylation
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีทักษะการวิเคราะห์ทางสถิติและการแสดงภาพข้อมูล
- พิจารณาเป็นพิเศษ: มีประสบการณ์ genomics ในห้องปฏิบัติการ
- พิจารณาเป็นพิเศษ: คุ้นเคยกับเครื่องมือ AI สมัยใหม่ เช่น Claude Code
สวัสดิการ
- เวลาทำงานยืดหยุ่นและรูปแบบการทำงานที่รองรับการทำงานทางไกล พร้อมตัวเลือกทำงานที่สำนักงานในโตรอนโต
- ความคุ้มครองด้านการแพทย์ ทันตกรรม และสายตาสำหรับพนักงานและผู้ที่อยู่ในอุปการะ
- วันลาพักร้อนสามสัปดาห์
- ลาป่วยได้ไม่จำกัด
- โครงการเพิ่มเติมสิทธิประโยชน์สำหรับการลาคลอดและลาเพื่อเลี้ยงดูบุตร
- เงินสนับสนุนครั้งเดียวสำหรับจัดตั้งสำนักงานทางไกล
- การสนับสนุนการพัฒนาอาชีพและการเรียนรู้
- มีสิทธิ์เข้าร่วมโครงการสิทธิซื้อหุ้นของพนักงาน
- โอกาสมีส่วนร่วมในวิทยาศาสตร์แบบเปิดและโครงการริเริ่มแบ่งปันข้อมูลทั่วโลก