A DNAstack az Omics AI nevű, szabványoknak megfelelő SaaS-platformot fejleszti, amely elosztott kutatási hálózatokban teszi lehetővé a genomikai és egészségügyi adatok felkutatását, megosztását és elemzését. Föderált megközelítése révén az adatgazdák úgy tehetik elérhetővé az érzékeny adatkészleteket MI-alapú elemzésre, hogy nem kell azokat központi adattárba áthelyezniük. A platform támogatja az adatvédelmet, a biztonságot és a GA4GH-szabványokat. A DNAstacket világjárvány-felügyeleti, idegtudományi, ritka betegségekkel kapcsolatos és onkológiai együttműködésekben használják. A 2014-ben alapított szoftvercég 11–50 fős csapattal rendelkezik.
Bioinformatikai ügyfélsiker-szakértő
Támogassa a DNAstack precíziós orvoslási adatmegosztó platformját használó ügyfeleket a genomikai munkafolyamatok működtetésétől és a minőségellenőrzéstől a bevezetésig és a technikai hibaelhárításig.
Kanada70 000 $ – 95 000 $ / év
TávoliTeljes munkaidőJuniorKötelező Nyelv: angolÜgyfélsikerÜgyfélsiker-menedzserLeírás
- Legyen az ügyfélkérések, partneri kérdések és adatszolgáltatási igények elsődleges műszaki kapcsolattartója.
- Vizsgálja ki és oldja meg a másodlagos és harmadlagos munkafolyamat-futtatások hibáit, az annotációs vagy rendezési problémákat, valamint a felhőhozzáférési gondokat.
- Keresse meg a hiányzó variánsok, a kontrollminták eltérései és a futási késedelmek kiváltó okait, majd ismertesse a megállapításokat az ügyfelekkel.
- Alakítsa a visszatérő problémákat tudásbázis-tartalmakká, eljárásrendekké és gyakori kérdésekké.
- Felügyelje az éles munkafolyamatokat és az adatkészletek telepítését a Google Cloud Platformon és az AWS-en.
- Állítson be és végezzen bemeneti és kimeneti minőségellenőrzéseket, beleértve a mintaazonosságot, a lefedettséget és a variánsszintű mérőszámokat.
- Validálja a munkafolyamat- és platformkiadásokat regressziós tesztekkel és olyan referenciaforrásokkal, mint a GIAB.
- Tervezze meg és kövesse nyomon a munkafolyamatok számítási költségeit a felhőszolgáltatóknál.
- Rögzítse az incidenseket, és kövesse nyomon a mérnöki javításokat azok lezárásáig.
- Frissítse a munkafolyamat függőségeit, és validálja újra a teljes folyamatot.
- Készítse elő az ügyfelek bevezetését a célzott befogási fájlok, metaadatlapok és mintaazonosítók ellenőrzésével.
- Indítsa el, kövesse nyomon és erősítse meg a mintafuttatásokat és újraelemzéseket az ügyfélfiókokban.
- Indexelje újra, töltse be ismét és ellenőrizze az adatkészlet-csomópontokat a telepítési környezetekben.
- Készítsen testre szabott adatkivonatokat, például BAM-szeleteket, gyűjteményszintű VCF-eket és célzott TSV-fájlokat.
- Készítse elő és ellenőrizze a strukturális variánsokra, rövid tandem ismétlődésekre és metilációra vonatkozó eredményeket a partnereknek történő átadáshoz.
- Működjön együtt az üzletfejlesztési csapattal bemutató adatkészleteken, koncepcióigazolásokon és számításiköltség-becsléseken.
- Rendszerezze az ügyfél-visszajelzéseket, és ossza meg a termék- és mérnöki csapatokkal az ütemterv alakításához.
- Benchmarkokkal hasonlítsa össze a variánshívókat és a munkafolyamat-beállításokat.
- Dolgozzon együtt a vezető bioinformatikussal feltáró jellegű funkciókon, és vegyen részt a belső bioinformatikai folyóiratklubban.
Követelmények
- Mesterfokozat számításbiológiából, bioinformatikából, biostatisztikából vagy számítástechnikából, illetve ezekkel egyenértékű tapasztalat.
- 1–3 év szakmai tapasztalat biotechnológiai, diagnosztikai vagy klinikai bioinformatikai iparági szerepkörben; lehetőleg ügyfelekkel vagy partnerekkel végzett munkával.
- Kiváló írásbeli és szóbeli kommunikáció, beleértve az összetett műszaki kérdések számítástechnikai háttérrel nem rendelkezők számára történő elmagyarázását.
- Módszeres megközelítés a hibaelhárításhoz és a kiváltó okok elemzéséhez.
- Gyakorlati tapasztalat NGS- és omikai adatfeldolgozó munkafolyamatok futtatásában és hibakeresésében.
- A FASTQ, BAM/CRAM, VCF és BED formátumok, valamint elemzőeszközök ismerete.
- Jártasság Pythonban, R-ben vagy Javában, továbbá erős shell scripting- és parancssori készségek.
- Aprólékosság és felelősségvállalás az adatminőségért.
- Biológiai vagy genetikai háttér, erős kritikai gondolkodási és kutatási készségekkel.
- Kanadai munkavállalási engedély.
- Előny: tapasztalat olyan munkafolyamat-nyelvekkel, mint a WDL, CWL, Nextflow vagy Snakemake, illetve olyan konténerekkel, mint a Docker vagy a Singularity.
- Előny: tapasztalat GCP-, AWS-, Azure- vagy HPC-környezetekkel, beleértve a felügyeleti és naplózási eszközöket.
- Előny: automatizált tesztelési vagy CI/CD-tapasztalat bioinformatikai munkafolyamatokhoz.
- Előny: tapasztalat minőségügyi rendszerekben vagy szabályozott környezetben, például CAP/CLIA vagy ISO 13485 szerint.
- Előny: Jira Service Managementhez, Zendeskhez vagy Intercomhoz hasonló hibajegykezelő vagy ügyfélsiker-platformok ismerete.
- Előny: hosszú leolvasású szekvenálási tapasztalat, beleértve a strukturális variánsok, STR-ek és metiláció elemzését.
- Előny: statisztikai elemzési és adatvizualizációs készségek.
- Előny: genomikai laboratóriumi tapasztalat.
- Előny: korszerű MI-eszközök, például a Claude Code ismerete.
Juttatások
- Rugalmas munkaidő és távoli munkavégzésre alkalmas munkarend, a torontói irodai munkavégzés lehetőségével.
- Egészségügyi, fogászati és látásbiztosítás a munkavállalóknak és eltartottjaiknak.
- Három hét szabadság.
- Korlátlan betegszabadság.
- Szülési és szülői szabadságra vonatkozó kiegészítő juttatási programok.
- Egyszeri támogatás otthoni iroda kialakításához.
- Karrierfejlesztési és tanulási támogatás.
- Részvételi lehetőség a munkavállalói részvényopciós programban.
- Lehetőség a nyílt tudomány és a globális adatmegosztási kezdeményezések támogatására.