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Cape Cod Technology Council, Inc.
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1 – 10 Mitarbeitende
BeratungBildungGesundheitswesen
Cape Cod Technology Council, Inc. ist eine auf Cape Cod ansässige Organisation, die Innovation und Zusammenarbeit im Technologiesektor unterstützt. Der 1996 gegründete Council bringt lokale Unternehmen und Fachkräfte mit technologieorientierten Ressourcen, Initiativen und Networking-Möglichkeiten zusammen. Seine Arbeit erstreckt sich auf die Bereiche Beratung, Gesundheitswesen und Bildung und zielt darauf ab, die regionale Wirtschaft durch technologiegetriebenes Wachstum zu stärken.
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Stellen im Unternehmen

Remote Research Associate II – Computationale Genomik mariner Organismen

Wenden Sie Methoden der Computational Biology und Bioinformatik auf genomische Datensätze mariner Mikroorganismen und Korallenriffe an. Unterstützen Sie die Forschung zum Schutz der Meere an der Woods Hole Oceanographic Institution.

USVereinigte StaatenMAMassachusetts
70.963 $ – 91.796 $ / Jahr
RemoteVollzeitJuniorMittlere StufeErforderliche Sprache: EnglischResearch-Analyst
AssemblerspracheAWSPythonSQLUnix

Beschreibung

  • Analysieren Sie Sequenzierungsdaten mariner Mikroorganismen für das Labor für mikrobielle Ökologie und Meeresschutz
  • Entwickeln und führen Sie Bioinformatik-Pipelines für Forschungsdatenprojekte aus
  • Verarbeiten, analysieren Sie statistisch, integrieren und visualisieren Sie sequenzbasierte Datensätze mariner Mikroorganismen
  • Erstellen Sie Bioinformatik- und Datenanalyseplattformen für wenig untersuchte Organismen und Umweltsysteme mit Schwerpunkt auf Korallen und Korallenriff-Ökosystemen
  • Unterstützen Sie Aktivitäten zur Analyse und Verwaltung von Forschungsdaten
  • Verbinden Sie Projekte und Analysewerkzeuge mit dem bestehenden Hochleistungsrechencluster des Labors
  • Vermitteln Sie Studierenden und Mitarbeitenden bei Bedarf relevante Analysetechniken
  • Koordinieren Sie die Arbeit an mehreren parallel laufenden Projekten
  • Erfüllen Sie Ihre Aufgaben unter der Leitung des Labors von Dr. Amy Apprill

Anforderungen

  • Masterabschluss in Informatik, Bioinformatik, Ozeanografie, Mikrobiologie, Chemie, Umweltwissenschaften oder einer verwandten Fachrichtung oder Bachelorabschluss mit mehreren Jahren Berufserfahrung
  • Einschlägige Berufserfahrung ist wünschenswert
  • Ausbildung oder Erfahrung in Bioinformatik ist wünschenswert
  • Erfahrung in mariner Mikrobiologie ist wünschenswert
  • Interesse an Korallenriff-Umgebungen ist wünschenswert
  • Erfahrung mit vergleichender Genomik, Phylogenomik, Gen- und Proteinfamilienanalysen, genomischem Kontext und funktioneller Inferenz, der Entwicklung von Hypothesen zur Verbindung von Genotyp und Phänotyp, biosynthetischen Genclustern, Stoffwechselwegen, der Assemblierung und Annotation von Genomen und Metagenomen, Metagenomik, Metatranskriptomik, Long-Read-Sequenzierung, HMM-basierten Analysen, Protein-Clustering, groß angelegten Sequenzvergleichen und der Analyse von 16S-rRNA-Genen
  • Sicherer Umgang mit Python und wissenschaftlichen Bibliotheken, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow oder Snakemake, HPC-Umgebungen, SLURM oder Sun Grid Engine, AWS, Git und skalierbaren Computational-Workflows
  • Vertrautheit mit MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK sowie Werkzeugen für vergleichende oder phylogenetische Analysen
  • Praktische Erfahrung mit Sequenzierungsmethoden, DNA- und RNA-Isolierung, PCR, qRT-PCR, mikrobieller Kultivierung und Fermentation sowie mit Versuchsplanung zur Verknüpfung genomischer Vorhersagen mit biologischen Phänotypen ist wünschenswert
  • Fähigkeit, mehrere Projekte gleichzeitig zu verwalten
  • Reichen Sie einen vollständigen Lebenslauf mit Kontaktdaten von drei Referenzpersonen ein
  • Reichen Sie ein ausführliches Anschreiben ein, in dem Sie für die Position relevante Erfahrungen beschreiben

Zusatzleistungen

  • Es werden umfassende Leistungen angeboten
  • Umfassendes Leistungspaket
  • Vollzeitbeschäftigung als Angestellte oder Angestellter ohne Anspruch auf Überstundenvergütung
  • Die Stelle kann abhängig von der Leistung und der Verfügbarkeit von Fördermitteln jährlich verlängert werden

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