Cape Cod Technology Council, Inc. ialah sebuah organisasi yang berpusat di Cape Cod dan menyokong inovasi serta kerjasama merentasi sektor teknologi. Ditubuhkan pada tahun 1996, majlis ini menghubungkan perniagaan dan golongan profesional tempatan dengan sumber, inisiatif dan peluang rangkaian yang berfokus pada teknologi. Usahanya merangkumi perundingan, penjagaan kesihatan dan pendidikan, dengan tumpuan untuk memperkukuh ekonomi serantau melalui pertumbuhan yang didorong oleh teknologi.
Penolong Penyelidik II Jarak Jauh – Genomik Pengiraan Marin
Mengaplikasikan kaedah biologi pengiraan dan bioinformatik pada set data genom mikrob marin dan terumbu karang. Menyokong penyelidikan pemuliharaan lautan di Woods Hole Oceanographic Institution.
Penerangan
- Menganalisis data penjujukan mikrob marin untuk Makmal Ekologi Mikrob bagi Pemuliharaan Lautan
- Membina dan melaksanakan saluran paip bioinformatik untuk projek data penyelidikan
- Memproses, menganalisis secara statistik, mengintegrasikan, dan memvisualisasikan set data mikrob marin berasaskan jujukan
- Mewujudkan platform bioinformatik dan analisis data untuk organisma serta sistem alam sekitar yang kurang dikaji, dengan tumpuan pada karang dan ekosistem terumbu karang
- Menyokong aktiviti analisis dan pengurusan data penyelidikan
- Menghubungkan projek dan alat analisis dengan kluster pengkomputeran berprestasi tinggi sedia ada di makmal
- Mengajar teknik analisis yang berkaitan kepada pelajar dan kakitangan apabila diperlukan
- Mengurus kerja merentasi beberapa projek yang berjalan serentak
- Melaksanakan tugas di bawah arahan makmal Dr. Amy Apprill
Keperluan
- Ijazah sarjana dalam sains komputer, bioinformatik, oseanografi, mikrobiologi, kimia, sains alam sekitar, atau disiplin berkaitan, atau ijazah sarjana muda dengan pengalaman beberapa tahun
- Pengalaman profesional yang berkaitan diutamakan
- Latihan atau pengalaman dalam bioinformatik diutamakan
- Pengalaman dalam mikrobiologi marin diutamakan
- Minat terhadap persekitaran terumbu karang diutamakan
- Pengalaman dalam genomik perbandingan, filogenomik, analisis gen dan keluarga protein, inferens konteks genomik dan fungsi, pembangunan hipotesis genotip kepada fenotip, kelompok gen biosintetik, laluan metabolik, pemasangan dan anotasi genom serta metagenom, metagenomik, metatranskriptomik, penjujukan bacaan panjang, analisis berasaskan HMM, pengelompokan protein, perbandingan jujukan berskala besar, dan analisis gen rRNA 16S
- Mahir menggunakan Python dan pustaka saintifik, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow atau Snakemake, persekitaran HPC, SLURM atau Sun Grid Engine, AWS, Git, serta aliran kerja pengiraan berskala
- Mempunyai pengetahuan tentang MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK, dan alat analisis perbandingan atau filogenetik
- Pengalaman hands-on yang diutamakan dalam kaedah penjujukan, pengasingan DNA dan RNA, PCR, qRT-PCR, pengkulturan dan penapaian mikrob, serta reka bentuk eksperimen yang menghubungkan ramalan genomik dengan fenotip biologi
- Keupayaan mengurus beberapa projek secara serentak
- Mengemukakan curriculum vitae lengkap dengan maklumat hubungan tiga orang rujukan
- Mengemukakan surat iringan terperinci yang menerangkan pengalaman yang berkaitan dengan jawatan ini
Faedah
- Faedah lengkap disediakan
- Pakej faedah yang komprehensif
- Pekerjaan sepenuh masa dengan status exempt
- Jawatan boleh diperbaharui setiap tahun berdasarkan prestasi dan ketersediaan pembiayaan