Cape Cod Technology Council, Inc. er en organisation med base på Cape Cod, som støtter innovation og samarbejde på tværs af teknologisektoren. Rådet blev grundlagt i 1996 og forbinder lokale virksomheder og fagfolk med teknologifokuserede ressourcer, initiativer og netværksmuligheder. Arbejdet omfatter rådgivning, sundhedspleje og uddannelse med fokus på at styrke den regionale økonomi gennem teknologidrevet vækst.
Forskningsmedarbejder II på afstand – marin beregningsgenomik
Anvend beregningsbiologiske og bioinformatiske metoder på marine mikrobielle genomdatasæt og datasæt fra koralrev. Understøt forskning i havbevarelse ved Woods Hole Oceanographic Institution.
USA
Massachusetts70.963 $ – 91.796 $ / år
FjernarbejdeFuldtidJuniorMellemniveauPåkrævet Sprog: engelskForskningsanalytikerBeskrivelse
- Analysere sekventeringsdata fra marine mikroorganismer for Laboratoriet for Mikrobiel Økologi til Havbevarelse
- Opbygge og køre bioinformatiske pipelines til forskningsdataprojekter
- Behandle, statistisk analysere, integrere og visualisere sekvensbaserede marine mikrobielle datasæt
- Oprette bioinformatiske platforme og dataanalyseplatforme for understuderede organismer og miljøsystemer med fokus på koraller og koralrevsøkosystemer
- Understøtte aktiviteter inden for analyse og håndtering af forskningsdata
- Forbinde projekter og analyseværktøjer med laboratoriets eksisterende højtydende computerklynge
- Undervise studerende og medarbejdere i relevante analyseteknikker efter behov
- Håndtere arbejde på tværs af flere samtidige projekter
- Udføre arbejdsopgaver under ledelse af Dr. Amy Apprills laboratorium
Krav
- En kandidatgrad i datalogi, bioinformatik, oceanografi, mikrobiologi, kemi, miljøvidenskab eller et beslægtet fagområde, eller en bachelorgrad med flere års erfaring
- Relevant erhvervserfaring foretrækkes
- Uddannelse eller erfaring inden for bioinformatik foretrækkes
- Erfaring med marin mikrobiologi foretrækkes
- Interesse for koralrevmiljøer foretrækkes
- Erfaring med komparativ genomik, fylogenomik, analyse af gener og proteinfamilier, genomisk kontekst og funktionel inferens, udvikling af hypoteser fra genotype til fænotype, biosyntetiske genklynger, metaboliske pathways, samling og annotering af genomer og metagenomer, metagenomik, metatranskriptomik, long-read-sekventering, HMM-baserede analyser, proteinklyngedannelse, storskala sekvenssammenligning og analyse af 16S rRNA-gener
- Gode kundskaber i Python og videnskabelige biblioteker, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow eller Snakemake, HPC-miljøer, SLURM eller Sun Grid Engine, AWS, Git og skalerbare beregningsarbejdsgange
- Kendskab til MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK samt værktøjer til komparativ eller fylogenetisk analyse
- Praktisk erfaring med sekventeringsmetoder, DNA- og RNA-isolering, PCR, qRT-PCR, mikrobiel dyrkning og fermentering samt eksperimentelt design, der forbinder genomiske forudsigelser med biologiske fænotyper, foretrækkes
- Evne til at håndtere flere projekter samtidigt
- Indsend et komplet CV med kontaktoplysninger på tre referencer
- Indsend et detaljeret følgebrev, der beskriver erfaring, som er relevant for stillingen
Fordele
- Der tilbydes fulde personalegoder
- Omfattende fordelspakke
- Fuldtidsansættelse som funktionær
- Stillingen kan fornyes årligt afhængigt af præstation og adgang til finansiering