遠端研究助理 II——海洋計算基因組學
運用計算生物學與生物資訊學方法分析海洋微生物及珊瑚礁基因組資料集。 支援伍茲霍爾海洋研究所的海洋保育研究。
說明
- 分析微生物生態與海洋保育實驗室的海洋微生物定序資料
- 為研究資料專案建構並執行生物資訊學流程
- 處理、統計分析、整合並視覺化以序列為基礎的海洋微生物資料集
- 為研究不足的生物與環境系統建立生物資訊學及資料分析平台，重點關注珊瑚與珊瑚礁生態系
- 支援研究資料分析與管理工作
- 將專案與分析工具連接至實驗室現有的高效能運算叢集
- 在需要時向學生與員工教授相關分析技術
- 管理多個同時進行的專案
- 在艾美·阿普里爾博士實驗室的指導下履行職責
職位要求
- 具備計算機科學、生物資訊學、海洋學、微生物學、化學、環境科學或相關學科碩士學位，或具備學士學位及數年工作經驗
- 具備相關專業經驗者優先
- 接受過生物資訊學訓練或具備相關經驗者優先
- 具備海洋微生物學經驗者優先
- 對珊瑚礁環境感興趣者優先
- 具備比較基因組學、系統基因組學、基因與蛋白質家族分析、基因組環境與功能推論、基因型到表型假說建立、生物合成基因簇、代謝途徑、基因組與宏基因組組裝及註解、宏基因組學、宏轉錄組學、長讀長定序、基於HMM的分析、蛋白質分群、大規模序列比較及16S rRNA基因分析經驗
- 熟悉Python及科學運算函式庫、R、Bash/Unix、SQL、Nextflow或Snakemake、高效能運算環境、SLURM或Sun Grid Engine、AWS、Git及可擴充的計算工作流程
- 熟悉MEGAHIT、Prodigal、HMMER/Pfam、CD-HIT、GATK及比較分析或系統發育分析工具
- 具備定序方法、DNA與RNA分離、PCR、qRT-PCR、微生物培養與發酵，以及將基因組預測與生物表型連結的實驗設計實務經驗者優先
- 能夠同時管理多個專案
- 提交完整履歷，並附上三位推薦人的聯絡方式
- 提交詳細求職信，說明與該職位相關的經驗
福利待遇
- 提供完整福利
- 完整福利方案
- 全職、免加班費職位
- 職位可依工作表現與資金供應情況逐年續聘
