Cape Cod Technology Council, Inc.
Cape Cod Technology Council, Inc.
Cape Cod Technology Council, Inc. är en organisation baserad på Cape Cod som främjar innovation och samarbete inom tekniksektorn. Rådet grundades 1996 och sammanför lokala företag och yrkesverksamma med teknikfokuserade resurser, initiativ och nätverksmöjligheter. Verksamheten omfattar konsulttjänster, hälso- och sjukvård samt utbildning, med fokus på att stärka den regionala ekonomin genom teknikdriven tillväxt.

Forskningsassistent II på distans – marin beräkningsgenomik

Tillämpa beräkningsbiologiska och bioinformatiska metoder på marina mikrobiella genomdata och data från korallrev. Stöd forskning om havsbevarande vid Woods Hole Oceanographic Institution.

Beskrivning

  • Analysera sekvenseringsdata från marina mikroorganismer för laboratoriet för mikrobiell ekologi för havsbevarande
  • Bygg och kör bioinformatiska pipelines för forskningsdataprojekt
  • Bearbeta, statistiskt analysera, integrera och visualisera sekvensbaserade marina mikrobiella dataset
  • Skapa bioinformatiska plattformar och dataanalysplattformar för understuderade organismer och miljösystem, med fokus på koraller och korallrevsekosystem
  • Stöd aktiviteter inom analys och hantering av forskningsdata
  • Anslut projekt och analysverktyg till laboratoriets befintliga högpresterande datorkluster
  • Undervisa studenter och personal i relevanta analystekniker vid behov
  • Hantera arbete inom flera pågående projekt samtidigt
  • Utföra arbetsuppgifter under ledning av Dr. Amy Apprills laboratorium

Krav

  • Masterexamen i datavetenskap, bioinformatik, oceanografi, mikrobiologi, kemi, miljövetenskap eller ett närliggande ämne, eller kandidatexamen med flera års erfarenhet
  • Relevant yrkeserfarenhet är meriterande
  • Utbildning eller erfarenhet av bioinformatik är meriterande
  • Erfarenhet av marin mikrobiologi är meriterande
  • Intresse för korallrevens miljöer är meriterande
  • Erfarenhet av jämförande genomik, fylogenomik, analys av gener och proteinfamiljer, analys av genomkontext och funktionella samband, utveckling av hypoteser om sambandet mellan genotyp och fenotyp, biosyntetiska genkluster, metabola vägar, hopsättning och annotering av genom och metagenom, metagenomik, metatranskriptomik, långläsningssekvensering, HMM-baserade analyser, proteinklustering, storskalig sekvensjämförelse och analys av 16S rRNA-gener
  • Goda kunskaper i Python och vetenskapliga bibliotek, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow eller Snakemake, HPC-miljöer, SLURM eller Sun Grid Engine, AWS, Git och skalbara beräkningsarbetsflöden
  • Kännedom om MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK samt verktyg för jämförande eller fylogenetisk analys
  • Praktisk erfarenhet av sekvenseringsmetoder, isolering av DNA och RNA, PCR, qRT-PCR, odling och fermentering av mikroorganismer samt experimentell design som kopplar genomiska förutsägelser till biologiska fenotyper är meriterande
  • Förmåga att hantera flera projekt samtidigt
  • Skicka in ett komplett CV med kontaktuppgifter till tre referenser
  • Skicka in ett detaljerat personligt brev som beskriver erfarenhet relevant för tjänsten

Förmåner

  • Fullständiga förmåner erbjuds
  • Omfattande förmånspaket
  • Heltidsanställning med undantagen arbetstid
  • Tjänsten kan förnyas årligen beroende på prestation och tillgång till finansiering

Relaterade jobb

Air Liquide

Finanstrainee – fransk-, tysk- eller nederländsktalande

Air Liquide

Delta i Air Liquides traineeprogram inom ekonomi och stötta redovisning, treasury och avstämningar vid företagets globala center för affärstjänster. Bidra till att förbättra boksluts- och ERP-processer och arbeta på engelska samt franska, tyska eller nederländska.

Öppna