远程研究助理 II——海洋计算基因组学
运用计算生物学和生物信息学方法分析海洋微生物及珊瑚礁基因组数据集。 支持伍兹霍尔海洋研究所的海洋保护研究。
描述
- 分析微生物生态与海洋保护实验室的海洋微生物测序数据
- 为研究数据项目构建并运行生物信息学流程
- 处理、统计分析、整合并可视化基于序列的海洋微生物数据集
- 为研究不足的生物和环境系统创建生物信息学与数据分析平台，重点关注珊瑚及珊瑚礁生态系统
- 支持研究数据分析与管理工作
- 将项目和分析工具连接至实验室现有的高性能计算集群
- 在需要时向学生和员工教授相关分析技术
- 管理多个同时开展的项目
- 在艾米·阿普里尔博士实验室的指导下履行职责
任职要求
- 具备计算机科学、生物信息学、海洋学、微生物学、化学、环境科学或相关学科硕士学位，或具备学士学位及数年工作经验
- 优先考虑具备相关专业经验者
- 优先考虑接受过生物信息学培训或具备相关经验者
- 优先考虑具备海洋微生物学经验者
- 优先考虑对珊瑚礁环境感兴趣者
- 具备比较基因组学、系统基因组学、基因与蛋白质家族分析、基因组环境与功能推断、基因型到表型假设构建、生物合成基因簇、代谢通路、基因组与宏基因组组装和注释、宏基因组学、宏转录组学、长读长测序、基于HMM的分析、蛋白质聚类、大规模序列比较及16S rRNA基因分析经验
- 熟练使用Python及科学计算库、R、Bash/Unix、SQL、Nextflow或Snakemake、高性能计算环境、SLURM或Sun Grid Engine、AWS、Git及可扩展计算流程
- 熟悉MEGAHIT、Prodigal、HMMER/Pfam、CD-HIT、GATK及比较分析或系统发育分析工具
- 优先考虑具备测序方法、DNA和RNA分离、PCR、qRT-PCR、微生物培养与发酵，以及将基因组预测与生物表型联系起来的实验设计实践经验
- 能够同时管理多个项目
- 提交完整的个人简历，并附三位推荐人的联系方式
- 提交详细的求职信，说明与该职位相关的经验
福利待遇
- 提供完整福利
- 全面的福利待遇
- 全职、免加班费职位
- 职位可根据工作表现和资金供应情况逐年续聘
