Cape Cod Technology Council, Inc. là một tổ chức có trụ sở tại Cape Cod, hỗ trợ đổi mới và hợp tác trong lĩnh vực công nghệ. Được thành lập vào năm 1996, hội đồng kết nối các doanh nghiệp và chuyên gia địa phương với những nguồn lực, sáng kiến và cơ hội giao lưu tập trung vào công nghệ. Hoạt động của tổ chức bao gồm các lĩnh vực tư vấn, y tế và giáo dục, tập trung củng cố nền kinh tế khu vực thông qua tăng trưởng dựa trên công nghệ.
Chuyên viên nghiên cứu II – Genomics tính toán biển
Áp dụng các phương pháp sinh học tính toán và tin sinh học vào những bộ dữ liệu hệ gen của vi sinh vật biển và rạn san hô. Hỗ trợ nghiên cứu bảo tồn đại dương tại Viện Hải dương học Woods Hole.
Mô tả
- Phân tích dữ liệu giải trình tự vi sinh vật biển cho Phòng thí nghiệm Sinh thái Vi sinh vật vì Bảo tồn Đại dương
- Xây dựng và thực thi các quy trình tin sinh học cho các dự án dữ liệu nghiên cứu
- Xử lý, phân tích thống kê, tích hợp và trực quan hóa các bộ dữ liệu vi sinh vật biển dựa trên trình tự
- Tạo các nền tảng tin sinh học và phân tích dữ liệu cho những sinh vật và hệ thống môi trường chưa được nghiên cứu đầy đủ, tập trung vào san hô và các hệ sinh thái rạn san hô
- Hỗ trợ các hoạt động phân tích và quản lý dữ liệu nghiên cứu
- Kết nối các dự án và công cụ phân tích với cụm máy tính hiệu năng cao hiện có của phòng thí nghiệm
- Giảng dạy các kỹ thuật phân tích liên quan cho sinh viên và nhân viên khi cần
- Quản lý công việc trong nhiều dự án diễn ra đồng thời
- Thực hiện nhiệm vụ dưới sự chỉ đạo của phòng thí nghiệm do Tiến sĩ Amy Apprill phụ trách
Yêu cầu
- Bằng thạc sĩ về khoa học máy tính, tin sinh học, hải dương học, vi sinh học, hóa học, khoa học môi trường hoặc ngành liên quan; hoặc bằng cử nhân cùng vài năm kinh nghiệm
- Ưu tiên kinh nghiệm chuyên môn liên quan
- Ưu tiên được đào tạo hoặc có kinh nghiệm về tin sinh học
- Ưu tiên có kinh nghiệm về vi sinh vật biển
- Ưu tiên có mối quan tâm đến môi trường rạn san hô
- Kinh nghiệm về genomics so sánh, phylogenomics, phân tích gen và họ protein, suy luận bối cảnh hệ gen và chức năng, xây dựng giả thuyết từ kiểu gen đến kiểu hình, các cụm gen sinh tổng hợp, các con đường chuyển hóa, lắp ráp và chú giải hệ gen và metagenome, metagenomics, metatranscriptomics, giải trình tự đọc dài, phân tích dựa trên HMM, phân cụm protein, so sánh trình tự quy mô lớn và phân tích gen 16S rRNA
- Thành thạo Python và các thư viện khoa học, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow hoặc Snakemake, môi trường HPC, SLURM hoặc Sun Grid Engine, AWS, Git và các quy trình tính toán có khả năng mở rộng
- Quen thuộc với MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK và các công cụ phân tích so sánh hoặc phát sinh loài
- Ưu tiên có kinh nghiệm thực hành với các phương pháp giải trình tự, phân lập DNA và RNA, PCR, qRT-PCR, nuôi cấy và lên men vi sinh vật, cũng như thiết kế thí nghiệm liên kết các dự đoán hệ gen với kiểu hình sinh học
- Có khả năng quản lý đồng thời nhiều dự án
- Nộp lý lịch khoa học đầy đủ, kèm thông tin liên hệ của ba người tham khảo
- Nộp thư xin việc chi tiết mô tả kinh nghiệm liên quan đến vị trí
Phúc lợi
- Được cung cấp đầy đủ phúc lợi
- Gói phúc lợi toàn diện
- Việc làm toàn thời gian, không thuộc diện hưởng lương làm thêm giờ
- Vị trí có thể được gia hạn hằng năm tùy thuộc vào kết quả công việc và nguồn kinh phí