Cape Cod Technology Council, Inc. — Кейп-Кодта орналасқан, технология саласындағы инновациялар мен ынтымақтастықты қолдайтын ұйым. 1996 жылы құрылған кеңес жергілікті кәсіпорындар мен мамандарды технологияға бағытталған ресурстармен, бастамалармен және кәсіби байланыс орнату мүмкіндіктерімен байланыстырады. Оның қызметі консалтинг, денсаулық сақтау және білім беру салаларын қамтиды және технологияға негізделген өсу арқылы өңірлік экономиканы нығайтуға бағытталған.
Қашықтан жұмыс істейтін II санатты зерттеу ассистенті – теңіздік есептеу геномикасы
Теңіз микроорганизмдері мен маржан рифтерінің геномдық деректер жиынтықтарына есептеу биологиясы және биоинформатика әдістерін қолданыңыз. Woods Hole океанографиялық институтында мұхиттарды қорғау зерттеулеріне қолдау көрсетіңіз.
Сипаттама
- Мұхиттарды қорғауға арналған микробтық экология зертханасы үшін теңіз микроорганизмдерінің секвенирлеу деректерін талдау
- Зерттеу деректеріне арналған жобалар үшін биоинформатикалық конвейерлерді құру және іске қосу
- Тізбекке негізделген теңіз микробтық деректер жиынтықтарын өңдеу, статистикалық талдау, біріктіру және визуализациялау
- Зерттелуі жеткіліксіз организмдер мен қоршаған орта жүйелеріне, әсіресе маржандар мен маржан рифтері экожүйелеріне бағытталған биоинформатика және деректерді талдау платформаларын құру
- Зерттеу деректерін талдау және басқару жұмыстарына қолдау көрсету
- Жобалар мен аналитикалық құралдарды зертхананың қолданыстағы жоғары өнімді есептеу кластеріне қосу
- Қажет болған жағдайда студенттер мен қызметкерлерге тиісті талдау әдістерін үйрету
- Бір уақытта орындалып жатқан бірнеше жоба бойынша жұмысты басқару
- Доктор Эми Апприлл зертханасының басшылығымен міндеттерді орындау
Талаптар
- Компьютер ғылымдары, биоинформатика, океанография, микробиология, химия, қоршаған орта ғылымдары немесе сабақтас сала бойынша магистр дәрежесі не бірнеше жылдық тәжірибесі бар бакалавр дәрежесі
- Тиісті кәсіби тәжірибе құпталады
- Биоинформатика бойынша дайындық немесе тәжірибе құпталады
- Теңіз микробиологиясы бойынша тәжірибе құпталады
- Маржан рифтері ортасына қызығушылық құпталады
- Салыстырмалы геномика, филогеномика, гендер мен ақуыз тұқымдастарын талдау, геномдық контекст пен функционалдық қорытынды жасау, генотиптен фенотипке қатысты гипотеза әзірлеу, биосинтетикалық ген кластерлері, метаболизм жолдары, геномдар мен метагеномдарды жинақтау және аннотациялау, метагеномика, метатранскриптомика, ұзын оқылымды секвенирлеу, HMM негізіндегі талдаулар, ақуыздарды кластерлеу, ауқымды тізбек салыстыру және 16S rRNA генін талдау бойынша тәжірибе
- Python және ғылыми кітапханалар, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow немесе Snakemake, HPC орталары, SLURM немесе Sun Grid Engine, AWS, Git және масштабталатын есептеу жұмыс процестері бойынша біліктілік
- MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK және салыстырмалы немесе филогенетикалық талдау құралдарын білу
- Секвенирлеу әдістері, ДНҚ мен РНҚ бөліп алу, PCR, qRT-PCR, микробтарды өсіру және ферментациялау, сондай-ақ геномдық болжамдарды биологиялық фенотиптермен байланыстыратын эксперименттік дизайн бойынша практикалық тәжірибе құпталады
- Бірнеше жобаны қатар басқару қабілеті
- Үш ұсыным берушінің байланыс деректері көрсетілген толық түйіндеме ұсыну
- Лауазымға қатысты тәжірибені сипаттайтын толық ілеспе хат ұсыну
Артықшылықтар
- Толық әлеуметтік пакет ұсынылады
- Кешенді әлеуметтік пакет
- Толық жұмыс күнімен, босатылған қызметкер мәртебесінде жұмысқа қабылдау
- Лауазым жұмыс нәтижелеріне және қаржыландырудың болуына қарай жыл сайын ұзартылуы мүмкін