Cape Cod Technology Council, Inc. er en organisasjon på Cape Cod som støtter innovasjon og samarbeid på tvers av teknologisektoren. Rådet ble grunnlagt i 1996 og knytter lokale virksomheter og fagfolk sammen med teknologifokuserte ressurser, initiativer og nettverksmuligheter. Arbeidet omfatter rådgivning, helsetjenester og utdanning, med fokus på å styrke den regionale økonomien gjennom teknologidrevet vekst.
Fjernbasert forskningsmedarbeider II – marin beregningsgenomikk
Bruk beregningsbiologiske og bioinformatiske metoder på marine mikrobielle genomdatasett og datasett fra korallrev. Støtt forskning på bevaring av havet ved Woods Hole Oceanographic Institution.
USA
Massachusetts70 963 $ – 91 796 $ / år
FjernarbeidHeltidJuniorMellomnivåPåkrevd Språk: engelskForskningsanalytikerBeskrivelse
- Analysere sekvenseringsdata fra marine mikroorganismer for laboratoriet for mikrobiell økologi for bevaring av havet
- Bygge og kjøre bioinformatiske pipelines for forskningsdataprosjekter
- Bearbeide, statistisk analysere, integrere og visualisere sekvensbaserte marine mikrobielle datasett
- Utvikle bioinformatiske plattformer og plattformer for dataanalyse av lite studerte organismer og miljøsystemer, med fokus på koraller og korallrevsøkosystemer
- Støtte aktiviteter knyttet til analyse og håndtering av forskningsdata
- Koble prosjekter og analyseverktøy til laboratoriets eksisterende høyytelsesdataklynge
- Undervise studenter og ansatte i relevante analyseteknikker ved behov
- Håndtere arbeid på tvers av flere samtidige prosjekter
- Utføre arbeidsoppgaver under ledelse av Dr. Amy Apprills laboratorium
Krav
- Mastergrad i informatikk, bioinformatikk, oseanografi, mikrobiologi, kjemi, miljøvitenskap eller et beslektet fagområde, eller bachelorgrad med flere års erfaring
- Relevant yrkeserfaring foretrekkes
- Utdanning eller erfaring innen bioinformatikk foretrekkes
- Erfaring med marin mikrobiologi foretrekkes
- Interesse for korallrevmiljøer foretrekkes
- Erfaring med komparativ genomikk, fylogenomikk, analyse av gener og proteinfamilier, genomisk kontekst og funksjonell inferens, utvikling av hypoteser fra genotype til fenotype, biosyntetiske genklynger, metabolske pathways, sammensetting og annotering av genomer og metagenomer, metagenomikk, metatranskriptomikk, langlesningssekvensering, HMM-baserte analyser, proteinklynging, storskala sekvenssammenligning og analyse av 16S rRNA-gener
- Gode ferdigheter i Python og vitenskapelige biblioteker, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow eller Snakemake, HPC-miljøer, SLURM eller Sun Grid Engine, AWS, Git og skalerbare beregningsarbeidsflyter
- Kjennskap til MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK samt verktøy for komparativ eller fylogenetisk analyse
- Praktisk erfaring med sekvenseringsmetoder, isolering av DNA og RNA, PCR, qRT-PCR, dyrking og fermentering av mikroorganismer samt eksperimentell utforming som knytter genomiske prediksjoner til biologiske fenotyper, foretrekkes
- Evne til å håndtere flere prosjekter samtidig
- Send inn en fullstendig CV med kontaktopplysninger til tre referanser
- Send inn et detaljert søknadsbrev som beskriver erfaring relevant for stillingen
Fordeler
- Fullstendige ytelser tilbys
- Omfattende ytelsespakke
- Heltidsstilling som unntatt arbeidstidsbestemmelsene
- Stillingen kan fornyes årlig avhengig av prestasjoner og tilgjengelig finansiering