원격 연구원 II — 해양 계산 유전체학
계산생물학 및 생물정보학 방법을 적용해 해양 미생물과 산호초 유전체 데이터세트를 분석합니다. 우즈홀 해양연구소의 해양 보전 연구를 지원합니다.
설명
- 미생물 생태 및 해양 보전 연구실의 해양 미생물 시퀀싱 데이터를 분석합니다
- 연구 데이터 프로젝트를 위한 생물정보학 파이프라인을 구축하고 실행합니다
- 서열 기반 해양 미생물 데이터세트를 처리하고 통계적으로 분석하며 통합하고 시각화합니다
- 연구가 부족한 생물과 환경 시스템을 위한 생물정보학 및 데이터 분석 플랫폼을 구축하며, 산호와 산호초 생태계에 중점을 둡니다
- 연구 데이터 분석 및 관리 활동을 지원합니다
- 프로젝트와 분석 도구를 연구실의 기존 고성능 컴퓨팅 클러스터에 연결합니다
- 필요할 때 학생과 직원에게 관련 분석 기법을 교육합니다
- 여러 프로젝트를 동시에 관리합니다
- 에이미 애프릴 박사 연구실의 지시에 따라 업무를 수행합니다
지원 자격
- 컴퓨터과학, 생물정보학, 해양학, 미생물학, 화학, 환경과학 또는 관련 분야의 석사 학위, 또는 학사 학위와 수년의 경력
- 관련 전문 경력이 있으면 우대합니다
- 생물정보학 교육 또는 경험이 있으면 우대합니다
- 해양 미생물학 경험이 있으면 우대합니다
- 산호초 환경에 관심이 있으면 우대합니다
- 비교 유전체학, 계통 유전체학, 유전자 및 단백질군 분석, 유전체 맥락 및 기능 추론, 유전자형에서 표현형으로 이어지는 가설 개발, 생합성 유전자 클러스터, 대사 경로, 유전체 및 메타유전체 조립과 주석, 메타유전체학, 메타전사체학, 롱리드 시퀀싱, HMM 기반 분석, 단백질 클러스터링, 대규모 서열 비교 및 16S rRNA 유전자 분석 경험
- Python 및 과학 라이브러리, R, Bash/Unix, SQL, Nextflow 또는 Snakemake, HPC 환경, SLURM 또는 Sun Grid Engine, AWS, Git 및 확장 가능한 계산 워크플로를 능숙하게 사용할 수 있어야 합니다
- MEGAHIT, Prodigal, HMMER/Pfam, CD-HIT, GATK 및 비교 분석 또는 계통 분석 도구에 익숙해야 합니다
- 시퀀싱 방법, DNA 및 RNA 분리, PCR, qRT-PCR, 미생물 배양 및 발효, 유전체 예측과 생물학적 표현형을 연결하는 실험 설계에 대한 실무 경험이 있으면 우대합니다
- 여러 프로젝트를 동시에 관리할 수 있어야 합니다
- 연락처가 포함된 완전한 이력서와 추천인 3명의 연락처를 제출해야 합니다
- 직무와 관련된 경험을 설명하는 상세한 자기소개서를 제출해야 합니다
복리후생
- 종합 복리후생을 제공합니다
- 포괄적인 복리후생 패키지
- 전일제 면제 근로자 고용
- 업무 성과와 자금 확보 여부에 따라 매년 갱신 가능합니다
