SeqOne
SeqOne
A SeqOne desenvolve software de bioinformática com inteligência artificial para laboratórios moleculares que trabalham com dados de sequenciamento de nova geração. Sua plataforma completa oferece suporte à análise de linhagem germinativa e somática em painéis, exomas e genomas de leitura curta ou longa, com fluxos de trabalho automatizados pelo SeqOne Flow e interpretação clinicamente validada por meio do DiagAI. A tecnologia da empresa é utilizada em testes de oncologia, doenças hereditárias e doenças infecciosas, combinando priorização de variantes, correspondência fenotípica, previsão de patogenicidade e regras definidas por especialistas. A SeqOne também oferece integrações com LIMS e sistemas de TI, serviços profissionais e de interpretação clínica, fontes premium de anotação e suporte multilíngue para implementações laboratoriais. Seu trabalho está na interseção entre saúde, biotecnologia e inteligência artificial, com foco em segurança, conformidade e adoção clínica.

Engenheiro(a) de Bioinformática, Oncologia e Hematologia — SeqOne (Híbrido, França)

Desenvolva pipelines bioinformáticos reproduzíveis e software para a plataforma de genômica clínica da SeqOne. Apoie pesquisas em oncologia e hematologia com soluções confiáveis e escaláveis.

Descrição

  • Desenvolver ferramentas e pipelines para conjuntos de dados biológicos complexos
  • Manter e aprimorar aplicações existentes
  • Investigar e resolver problemas relatados pelos usuários
  • Melhorar o desempenho e a confiabilidade das aplicações
  • Entregar resultados analíticos robustos e reproduzíveis
  • Trabalhar em estreita colaboração com equipes científicas
  • Apoiar publicações e apresentações científicas
  • Facilitar revisões de código
  • Aplicar padrões de programação e práticas de desenvolvimento seguro
  • Avaliar métodos e tecnologias emergentes para adoção quando forem relevantes
  • Escrever e manter documentação técnica
  • Treinar e apoiar usuários e colegas
  • Trabalhar com as equipes de pesquisa e produto para transformar necessidades científicas em software confiável
  • Promover a qualidade do código por meio de revisões, testes e práticas de CI/CD
  • Ajudar a estabelecer práticas de equipe que tornem análises complexas rotineiras, reproduzíveis e escaláveis

Requisitos

  • É necessária experiência profissional em onco-hematologia
  • Mestrado (Bac+5) em bioinformática, ciência da computação ou área relacionada
  • Pelo menos dois anos de experiência no desenvolvimento de software bioinformático
  • Conhecimentos avançados de Python, UNIX/Linux e Bash
  • Experiência prática com ferramentas de workflow, como Snakemake e Nextflow
  • Conhecimento prático de Git, incluindo branching, pull requests e revisões de código
  • Experiência no uso do Docker para criar ambientes reproduzíveis
  • Excelentes habilidades de comunicação escrita e verbal
  • Abordagem colaborativa para o trabalho em equipe
  • Capacidade de gerenciar responsabilidades de forma independente
  • Excelentes habilidades analíticas e de resolução de problemas
  • Doutorado ou experiência equivalente em pesquisa são considerados diferenciais
  • Experiência com sistemas de CI/CD, como GitLab CI ou GitHub Actions, é um diferencial
  • Conhecimento de ferramentas de gerenciamento de ambientes, como pyenv, Poetry ou ambientes virtuais
  • Experiência com ambientes de HPC ou nuvem, incluindo SLURM, AWS, GCP ou Azure, é um forte diferencial
  • Experiência adicional de programação em R, Perl, Groovy, Nim ou Rust é bem-vinda

Benefícios

  • Oportunidades de trabalho remoto
  • Horário de trabalho flexível
  • Pacote de benefícios competitivo
  • Oportunidades internas de desenvolvimento de carreira
  • Treinamento profissional contínuo
  • Apoio para participação em conferências científicas
  • Salário fixo
  • Remuneração variável
  • Plano de saúde oferecido sem custo
  • Modelos flexíveis de trabalho híbrido, presencial ou totalmente remoto

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