
SeqOne разработва биоинформатичен софтуер с изкуствен интелект за молекулярни лаборатории, които работят с данни от секвениране от ново поколение. Нейната универсална платформа поддържа герминативен и соматичен анализ на панели, екзоми и геноми с кратки или дълги прочити, с автоматизирани работни процеси чрез SeqOne Flow и клинично валидирана интерпретация чрез DiagAI. Технологията на компанията се използва при изследвания в онкологията, наследствените и инфекциозните заболявания, като съчетава приоритизиране на варианти, съпоставяне на фенотипи, прогнозиране на патогенността и правила, дефинирани от експерти. SeqOne предоставя също интеграции с LIMS и ИТ системи, професионални и клинични услуги за интерпретация, премиум източници на анотации и многоезична поддръжка за внедряване в лаборатории. Дейността ѝ е на пресечната точка между здравеопазването, биотехнологиите и изкуствения интелект, с фокус върху сигурността, съответствието с нормативните изисквания и клиничното внедряване.
Инженер по биоинформатика, онкология и хематология — SeqOne (хибридно, Франция)
Разработвайте възпроизводими биоинформатични пайплайни и софтуер за клиничната геномна платформа на SeqOne. Подпомагайте изследванията в онкологията и хематологията с надеждни и мащабируеми решения.
32 000 € – 48 000 € / година
ХибридноПълен работен денМладшиСредно нивоЗадължителен Език: английскиИнженерОписание
- Разработване на инструменти и пайплайни за сложни биологични набори от данни
- Поддържане и усъвършенстване на съществуващи приложения
- Проучване и отстраняване на проблеми, докладвани от потребители
- Подобряване на производителността и надеждността на приложенията
- Предоставяне на стабилни и възпроизводими аналитични резултати
- Тясно сътрудничество с научни екипи
- Подпомагане на научни публикации и презентации
- Улесняване на прегледите на кода
- Прилагане на стандарти за кодиране и практики за сигурна разработка
- Оценяване на нови методи и технологии за подходящо внедряване
- Създаване и поддържане на техническа документация
- Обучение и подкрепа на потребители и колеги
- Работа с изследователски и продуктови екипи за превръщане на научните потребности в надежден софтуер
- Повишаване на качеството на кода чрез прегледи, тестване и практики за CI/CD
- Помагане за установяване на екипни практики, които правят сложните анализи рутинни, възпроизводими и мащабируеми
Изисквания
- Изисква се професионален опит в онкохематологията
- Магистърска степен (Bac+5) по биоинформатика, компютърни науки или сродна дисциплина
- Най-малко две години опит в разработването на биоинформатичен софтуер
- Напреднали умения по Python, UNIX/Linux и Bash
- Практически опит с инструменти за работни процеси като Snakemake и Nextflow
- Работни познания по Git, включително разклоняване, pull request-и и прегледи на код
- Опит с Docker за изграждане на възпроизводими среди
- Отлични писмени и устни комуникационни умения
- Сътруднически подход към екипната работа
- Способност за самостоятелно управление на отговорностите
- Силни аналитични умения и умения за решаване на проблеми
- Докторска степен или равностоен изследователски опит са предимство
- Опит със системи CI/CD като GitLab CI или GitHub Actions е предимство
- Познания за инструменти за управление на среди като pyenv, Poetry или виртуални среди
- Опит с HPC или облачни среди, включително SLURM, AWS, GCP или Azure, е значително предимство
- Допълнителен програмен опит с R, Perl, Groovy, Nim или Rust е добре дошъл
Придобивки
- Възможности за работа от разстояние
- Гъвкаво работно време
- Конкурентен пакет от придобивки
- Вътрешни възможности за кариерно развитие
- Продължаващо професионално обучение
- Подкрепа за участие в научни конференции
- Фиксирано възнаграждение
- Бонусно възнаграждение
- Здравно осигуряване без разходи за служителя
- Гъвкави възможности за хибридна, присъствена или изцяло дистанционна работа