SeqOne
SeqOne
SeqOne разработва биоинформатичен софтуер с изкуствен интелект за молекулярни лаборатории, които работят с данни от секвениране от ново поколение. Нейната универсална платформа поддържа герминативен и соматичен анализ на панели, екзоми и геноми с кратки или дълги прочити, с автоматизирани работни процеси чрез SeqOne Flow и клинично валидирана интерпретация чрез DiagAI. Технологията на компанията се използва при изследвания в онкологията, наследствените и инфекциозните заболявания, като съчетава приоритизиране на варианти, съпоставяне на фенотипи, прогнозиране на патогенността и правила, дефинирани от експерти. SeqOne предоставя също интеграции с LIMS и ИТ системи, професионални и клинични услуги за интерпретация, премиум източници на анотации и многоезична поддръжка за внедряване в лаборатории. Дейността ѝ е на пресечната точка между здравеопазването, биотехнологиите и изкуствения интелект, с фокус върху сигурността, съответствието с нормативните изисквания и клиничното внедряване.

Инженер по биоинформатика, онкология и хематология — SeqOne (хибридно, Франция)

Разработвайте възпроизводими биоинформатични пайплайни и софтуер за клиничната геномна платформа на SeqOne. Подпомагайте изследванията в онкологията и хематологията с надеждни и мащабируеми решения.

Описание

  • Разработване на инструменти и пайплайни за сложни биологични набори от данни
  • Поддържане и усъвършенстване на съществуващи приложения
  • Проучване и отстраняване на проблеми, докладвани от потребители
  • Подобряване на производителността и надеждността на приложенията
  • Предоставяне на стабилни и възпроизводими аналитични резултати
  • Тясно сътрудничество с научни екипи
  • Подпомагане на научни публикации и презентации
  • Улесняване на прегледите на кода
  • Прилагане на стандарти за кодиране и практики за сигурна разработка
  • Оценяване на нови методи и технологии за подходящо внедряване
  • Създаване и поддържане на техническа документация
  • Обучение и подкрепа на потребители и колеги
  • Работа с изследователски и продуктови екипи за превръщане на научните потребности в надежден софтуер
  • Повишаване на качеството на кода чрез прегледи, тестване и практики за CI/CD
  • Помагане за установяване на екипни практики, които правят сложните анализи рутинни, възпроизводими и мащабируеми

Изисквания

  • Изисква се професионален опит в онкохематологията
  • Магистърска степен (Bac+5) по биоинформатика, компютърни науки или сродна дисциплина
  • Най-малко две години опит в разработването на биоинформатичен софтуер
  • Напреднали умения по Python, UNIX/Linux и Bash
  • Практически опит с инструменти за работни процеси като Snakemake и Nextflow
  • Работни познания по Git, включително разклоняване, pull request-и и прегледи на код
  • Опит с Docker за изграждане на възпроизводими среди
  • Отлични писмени и устни комуникационни умения
  • Сътруднически подход към екипната работа
  • Способност за самостоятелно управление на отговорностите
  • Силни аналитични умения и умения за решаване на проблеми
  • Докторска степен или равностоен изследователски опит са предимство
  • Опит със системи CI/CD като GitLab CI или GitHub Actions е предимство
  • Познания за инструменти за управление на среди като pyenv, Poetry или виртуални среди
  • Опит с HPC или облачни среди, включително SLURM, AWS, GCP или Azure, е значително предимство
  • Допълнителен програмен опит с R, Perl, Groovy, Nim или Rust е добре дошъл

Придобивки

  • Възможности за работа от разстояние
  • Гъвкаво работно време
  • Конкурентен пакет от придобивки
  • Вътрешни възможности за кариерно развитие
  • Продължаващо професионално обучение
  • Подкрепа за участие в научни конференции
  • Фиксирано възнаграждение
  • Бонусно възнаграждение
  • Здравно осигуряване без разходи за служителя
  • Гъвкави възможности за хибридна, присъствена или изцяло дистанционна работа