
SeqOne tworzy oprogramowanie bioinformatyczne oparte na sztucznej inteligencji dla laboratoriów molekularnych pracujących z danymi z sekwencjonowania nowej generacji. Zintegrowana platforma obsługuje analizę germinalną i somatyczną paneli, eksomów oraz genomów sekwencjonowanych metodami short-read i long-read, automatyzując procesy dzięki SeqOne Flow i zapewniając klinicznie zweryfikowaną interpretację za pośrednictwem DiagAI. Technologie firmy są wykorzystywane w onkologii oraz w diagnostyce chorób dziedzicznych i zakaźnych, łącząc priorytetyzację wariantów, dopasowanie fenotypów, przewidywanie patogenności oraz reguły definiowane przez ekspertów. SeqOne oferuje również integracje z systemami LIMS i IT, profesjonalne i kliniczne usługi interpretacyjne, wysokiej jakości źródła adnotacji oraz wielojęzyczne wsparcie wdrożeń laboratoryjnych. Firma działa na styku ochrony zdrowia, biotechnologii i sztucznej inteligencji, koncentrując się na bezpieczeństwie, zgodności z przepisami i wdrażaniu rozwiązań w praktyce klinicznej.
Inżynier bioinformatyki w onkologii i hematologii — SeqOne (praca hybrydowa, Francja)
Twórz powtarzalne potoki bioinformatyczne i oprogramowanie dla platformy genomiki klinicznej SeqOne. Wspieraj badania w onkologii i hematologii za pomocą niezawodnych, skalowalnych rozwiązań.
32 000 € – 48 000 € / rok
HybrydowoPełny etatJuniorPoziom średniWymagany Język: angielskiInżynierOpis
- Tworzyć narzędzia i potoki dla złożonych zbiorów danych biologicznych
- Utrzymywać i rozwijać istniejące aplikacje
- Analizować i rozwiązywać problemy zgłaszane przez użytkowników
- Poprawiać wydajność i niezawodność aplikacji
- Dostarczać solidne, powtarzalne wyniki analiz
- Ściśle współpracować z zespołami naukowymi
- Wspierać publikacje naukowe i prezentacje
- Ułatwiać przeglądy kodu
- Stosować standardy kodowania i praktyki bezpiecznego wytwarzania oprogramowania
- Oceniać nowe metody i technologie pod kątem ich zasadnego wdrożenia
- Tworzyć i utrzymywać dokumentację techniczną
- Szkolić i wspierać użytkowników oraz współpracowników
- Współpracować z zespołami badawczymi i produktowymi, przekładając potrzeby naukowe na niezawodne oprogramowanie
- Podnosić jakość kodu dzięki przeglądom, testom i praktykom CI/CD
- Pomagać w tworzeniu praktyk zespołowych, które sprawiają, że złożone analizy stają się rutynowe, powtarzalne i skalowalne
Wymagania
- Wymagane jest doświadczenie zawodowe w onkohematologii
- Tytuł magistra (Bac+5) w dziedzinie bioinformatyki, informatyki lub pokrewnej dyscyplinie
- Co najmniej dwa lata doświadczenia w tworzeniu oprogramowania bioinformatycznego
- Zaawansowana znajomość Pythona, UNIX/Linux i Bash
- Praktyczne doświadczenie z narzędziami do zarządzania przepływami pracy, takimi jak Snakemake i Nextflow
- Znajomość Git, w tym pracy z gałęziami, pull requestami i przeglądami kodu
- Doświadczenie w korzystaniu z Dockera do tworzenia powtarzalnych środowisk
- Bardzo dobre umiejętności komunikacji pisemnej i ustnej
- Umiejętność współpracy zespołowej
- Umiejętność samodzielnego zarządzania obowiązkami
- Silne umiejętności analityczne i rozwiązywania problemów
- Doktorat lub równoważne doświadczenie badawcze będą dodatkowym atutem
- Doświadczenie z systemami CI/CD, takimi jak GitLab CI lub GitHub Actions, będzie dodatkowym atutem
- Znajomość narzędzi do zarządzania środowiskami, takich jak pyenv, Poetry lub środowiska wirtualne
- Doświadczenie z HPC lub środowiskami chmurowymi, w tym SLURM, AWS, GCP lub Azure, będzie dużym atutem
- Dodatkowe doświadczenie programistyczne w R, Perlu, Groovy, Nim lub Rust jest mile widziane
Benefity
- Możliwość pracy zdalnej
- Elastyczne godziny pracy
- Konkurencyjny pakiet świadczeń
- Możliwości rozwoju kariery wewnątrz firmy
- Stałe szkolenia zawodowe
- Wsparcie w uczestnictwie w konferencjach naukowych
- Stałe wynagrodzenie
- Premie
- Ubezpieczenie zdrowotne bezpłatne dla pracownika
- Elastyczny hybrydowy, stacjonarny lub w pełni zdalny model pracy