SeqOne
SeqOne
SeqOne desarrolla software de bioinformática basado en inteligencia artificial para laboratorios moleculares que trabajan con datos de secuenciación de nueva generación. Su plataforma integral admite análisis de línea germinal y somático en paneles, exomas y genomas de lectura corta o larga, con flujos de trabajo automatizados mediante SeqOne Flow e interpretación clínicamente validada a través de DiagAI. La tecnología de la empresa se utiliza en pruebas de oncología, enfermedades hereditarias e infecciosas, combinando priorización de variantes, correspondencia fenotípica, predicción de patogenicidad y reglas definidas por expertos. SeqOne también ofrece integraciones con LIMS y sistemas informáticos, servicios profesionales y de interpretación clínica, fuentes de anotación premium y soporte multilingüe para implementaciones en laboratorios. Su actividad se sitúa en la intersección de la atención sanitaria, la biotecnología y la inteligencia artificial, con especial atención a la seguridad, el cumplimiento normativo y la adopción clínica.

Ingeniero/a de Bioinformática, Oncología y Hematología — SeqOne (Híbrido, Francia)

Desarrolla pipelines bioinformáticos reproducibles y software para la plataforma de genómica clínica de SeqOne. Apoya la investigación en oncología y hematología con soluciones fiables y escalables.

Descripción

  • Desarrollar herramientas y pipelines para conjuntos de datos biológicos complejos
  • Mantener y mejorar las aplicaciones existentes
  • Investigar y resolver problemas notificados por los usuarios
  • Mejorar el rendimiento y la fiabilidad de las aplicaciones
  • Proporcionar resultados analíticos sólidos y reproducibles
  • Trabajar estrechamente con equipos científicos
  • Apoyar publicaciones y presentaciones científicas
  • Facilitar revisiones de código
  • Aplicar estándares de programación y prácticas de desarrollo seguro
  • Evaluar métodos y tecnologías emergentes para determinar su adopción cuando sean pertinentes
  • Redactar y mantener documentación técnica
  • Formar y apoyar a usuarios y compañeros
  • Colaborar con los equipos de investigación y producto para convertir las necesidades científicas en software fiable
  • Impulsar la calidad del código mediante revisiones, pruebas y prácticas de CI/CD
  • Ayudar a establecer prácticas de equipo que hagan que los análisis complejos sean rutinarios, reproducibles y escalables

Requisitos

  • Se requiere experiencia profesional en oncohematología
  • Máster (Bac+5) en bioinformática, informática o una disciplina relacionada
  • Al menos dos años de experiencia en el desarrollo de software bioinformático
  • Dominio avanzado de Python, UNIX/Linux y Bash
  • Experiencia práctica con herramientas de workflows como Snakemake y Nextflow
  • Conocimientos prácticos de Git, incluidas ramas, solicitudes de incorporación y revisiones de código
  • Experiencia en el uso de Docker para crear entornos reproducibles
  • Sólidas habilidades de comunicación escrita y verbal
  • Enfoque colaborativo para el trabajo en equipo
  • Capacidad para gestionar responsabilidades de forma independiente
  • Sólidas habilidades analíticas y de resolución de problemas
  • Se valoran un doctorado o experiencia investigadora equivalente
  • Se valorará la experiencia con sistemas de CI/CD como GitLab CI o GitHub Actions
  • Conocimientos de herramientas de gestión de entornos como pyenv, Poetry o entornos virtuales
  • La experiencia con entornos HPC o en la nube, incluidos SLURM, AWS, GCP o Azure, supone una gran ventaja
  • Se valorará experiencia adicional de programación en R, Perl, Groovy, Nim o Rust

Beneficios

  • Oportunidades de trabajo remoto
  • Horario laboral flexible
  • Paquete de beneficios competitivo
  • Oportunidades internas de desarrollo profesional
  • Formación profesional continua
  • Apoyo para asistir a congresos científicos
  • Salario fijo
  • Remuneración variable
  • Seguro médico sin coste para la persona empleada
  • Modalidades de trabajo híbridas, presenciales o totalmente remotas y flexibles