Η SeqOne αναπτύσσει λογισμικό βιοπληροφορικής με τεχνητή νοημοσύνη για μοριακά εργαστήρια που εργάζονται με δεδομένα αλληλούχισης επόμενης γενιάς. Η ολοκληρωμένη πλατφόρμα της υποστηρίζει την ανάλυση βλαστικών και σωματικών μεταλλάξεων σε πάνελ, εξώματα και γονιδιώματα με σύντομες ή μακρές αναγνώσεις, προσφέροντας αυτοματοποιημένες ροές εργασίας μέσω του SeqOne Flow και κλινικά επικυρωμένη ερμηνεία μέσω του DiagAI. Η τεχνολογία της εταιρείας χρησιμοποιείται σε εξετάσεις ογκολογίας, κληρονομικών και λοιμωδών νοσημάτων, συνδυάζοντας ιεράρχηση παραλλαγών, αντιστοίχιση φαινοτύπων, πρόβλεψη παθογονικότητας και κανόνες που ορίζονται από ειδικούς. Η SeqOne παρέχει επίσης διασυνδέσεις με συστήματα LIMS και IT, υπηρεσίες επαγγελματικής και κλινικής ερμηνείας, premium πηγές σχολιασμού και πολύγλωσση υποστήριξη για εγκαταστάσεις εργαστηρίων. Το έργο της βρίσκεται στη διασταύρωση της υγειονομικής περίθαλψης, της βιοτεχνολογίας και της τεχνητής νοημοσύνης, με έμφαση στην ασφάλεια, τη συμμόρφωση και την κλινική υιοθέτηση.
Μηχανικός Βιοπληροφορικής, Ογκολογία και Αιματολογία — SeqOne (Υβριδική εργασία, Γαλλία)
Αναπτύξτε αναπαραγώγιμες ροές εργασίας και λογισμικό βιοπληροφορικής για την πλατφόρμα κλινικής γονιδιωματικής της SeqOne. Υποστηρίξτε την έρευνα στην ογκολογία και την αιματολογία με αξιόπιστες, επεκτάσιμες λύσεις.
Γαλλία32.000 € – 48.000 € / έτος
ΥβριδικάΠλήρης απασχόλησηJuniorΜεσαίο επίπεδοΑπαιτούμενη Γλώσσα: ΑγγλικάΜηχανικόςΠεριγραφή
- Ανάπτυξη εργαλείων και ροών εργασίας για σύνθετα βιολογικά σύνολα δεδομένων
- Συντήρηση και βελτίωση υφιστάμενων εφαρμογών
- Διερεύνηση και επίλυση ζητημάτων που αναφέρουν οι χρήστες
- Βελτίωση της απόδοσης και της αξιοπιστίας των εφαρμογών
- Παράδοση robust και αναπαραγώγιμων αναλυτικών αποτελεσμάτων
- Στενή συνεργασία με επιστημονικές ομάδες
- Υποστήριξη επιστημονικών δημοσιεύσεων και παρουσιάσεων
- Διευκόλυνση επισκοπήσεων κώδικα
- Εφαρμογή προτύπων κωδικοποίησης και πρακτικών ασφαλούς ανάπτυξης
- Αξιολόγηση αναδυόμενων μεθόδων και τεχνολογιών για σχετική υιοθέτηση
- Σύνταξη και συντήρηση τεχνικής τεκμηρίωσης
- Εκπαίδευση και υποστήριξη χρηστών και συναδέλφων
- Συνεργασία με τις ομάδες έρευνας και προϊόντος για τη μετατροπή επιστημονικών αναγκών σε αξιόπιστο λογισμικό
- Προώθηση της ποιότητας του κώδικα μέσω επισκοπήσεων, δοκιμών και πρακτικών CI/CD
- Συμβολή στη θέσπιση ομαδικών πρακτικών που κάνουν τις σύνθετες αναλύσεις τακτικές, αναπαραγώγιμες και επεκτάσιμες
Απαιτήσεις
- Απαιτείται επαγγελματική εμπειρία στην ογκοαιματολογία
- Μεταπτυχιακό δίπλωμα (Bac+5) στη βιοπληροφορική, την επιστήμη υπολογιστών ή συναφή κλάδο
- Τουλάχιστον δύο χρόνια εμπειρίας στην ανάπτυξη λογισμικού βιοπληροφορικής
- Προχωρημένες δεξιότητες σε Python, UNIX/Linux και Bash
- Πρακτική εμπειρία με εργαλεία ροών εργασίας όπως τα Snakemake και Nextflow
- Πρακτική γνώση του Git, συμπεριλαμβανομένων διακλαδώσεων, pull requests και επισκοπήσεων κώδικα
- Εμπειρία στη χρήση του Docker για τη δημιουργία αναπαραγώγιμων περιβαλλόντων
- Ισχυρές δεξιότητες γραπτής και προφορικής επικοινωνίας
- Συνεργατική προσέγγιση στην ομαδική εργασία
- Ικανότητα ανεξάρτητης διαχείρισης ευθυνών
- Ισχυρές αναλυτικές δεξιότητες και ικανότητες επίλυσης προβλημάτων
- Διδακτορικό ή ισοδύναμη ερευνητική εμπειρία αποτελεί πλεονέκτημα
- Εμπειρία με συστήματα CI/CD όπως τα GitLab CI ή GitHub Actions αποτελεί επιπλέον προσόν
- Γνώση εργαλείων διαχείρισης περιβαλλόντων όπως τα pyenv, Poetry ή εικονικά περιβάλλοντα
- Εμπειρία σε περιβάλλοντα HPC ή cloud, συμπεριλαμβανομένων των SLURM, AWS, GCP ή Azure, αποτελεί σημαντικό πλεονέκτημα
- Πρόσθετη εμπειρία προγραμματισμού σε R, Perl, Groovy, Nim ή Rust είναι ευπρόσδεκτη
Παροχές
- Δυνατότητες τηλεργασίας
- Ευέλικτο ωράριο εργασίας
- Ανταγωνιστικό πακέτο παροχών
- Εσωτερικές ευκαιρίες επαγγελματικής εξέλιξης
- Συνεχής επαγγελματική κατάρτιση
- Υποστήριξη για συμμετοχή σε επιστημονικά συνέδρια
- Σταθερός μισθός
- Μπόνους αμοιβή
- Ασφάλιση υγείας χωρίς κόστος για τον εργαζόμενο
- Ευέλικτες ρυθμίσεις υβριδικής, επιτόπιας ή πλήρως εξ αποστάσεως εργασίας