SeqOne razvija bioinformatički softver pokretan umjetnom inteligencijom za molekularne laboratorije koji rade s podacima sekvenciranja nove generacije. Njegova objedinjena platforma podržava germinalnu i somatsku analizu panela, egzoma te genoma sekvenciranih kratkim ili dugim očitanjima, uz automatizirane tijekove rada putem platforme SeqOne Flow i klinički validiranu interpretaciju kroz DiagAI. Tehnologija tvrtke koristi se u testiranju u onkologiji, kod nasljednih bolesti i zaraznih bolesti, a objedinjuje određivanje prioriteta varijanti, podudaranje fenotipova, predviđanje patogenosti i pravila koja definiraju stručnjaci. SeqOne pruža i integracije s LIMS i IT sustavima, profesionalne i kliničke usluge interpretacije, premium izvore anotacija te višejezičnu podršku za implementaciju u laboratorijima. Njezin rad nalazi se na sjecištu zdravstva, biotehnologije i umjetne inteligencije, uz naglasak na sigurnosti, usklađenosti s propisima i kliničkom prihvaćanju.
Inženjer bioinformatike, onkologija i hematologija — SeqOne (hibridno, Francuska)
Razvijajte reproducibilne bioinformatičke cjevovode i softver za kliničku genomsku platformu SeqOne. Podržite istraživanja u onkologiji i hematologiji pouzdanim i skalabilnim rješenjima.
Francuska32.000 € – 48.000 € / godina
HibridnoPuno radno vrijemeJuniorSrednja razinaObavezan Jezik: engleskiInženjerOpis
- Razvijati alate i cjevovode za složene biološke skupove podataka
- Održavati i unapređivati postojeće aplikacije
- Istraživati i rješavati probleme koje prijavljuju korisnici
- Poboljšavati performanse i pouzdanost aplikacija
- Isporučivati robusne i reproducibilne analitičke rezultate
- Blisko surađivati sa znanstvenim timovima
- Podržavati znanstvene publikacije i prezentacije
- Olakšavati pregled koda
- Primjenjivati standarde kodiranja i prakse sigurnog razvoja
- Procjenjivati nove metode i tehnologije radi njihove relevantne primjene
- Pisati i održavati tehničku dokumentaciju
- Obučavati i podržavati korisnike i kolege
- Surađivati s istraživačkim i proizvodnim timovima kako bi se znanstvene potrebe pretvorile u pouzdan softver
- Poticati kvalitetu koda kroz preglede, testiranje i CI/CD prakse
- Pomagati u uspostavi timskih praksi koje složene analize čine rutinskima, reproducibilnima i skalabilnima
Zahtjevi
- Potrebno je profesionalno iskustvo u onkohematologiji
- Magisterij (Bac+5) iz bioinformatike, računalnih znanosti ili srodnog područja
- Najmanje dvije godine iskustva u razvoju bioinformatičkog softvera
- Napredno znanje Pythona, UNIX/Linuxa i Basha
- Praktično iskustvo s alatima za upravljanje tijekovima rada kao što su Snakemake i Nextflow
- Radno znanje Gita, uključujući grananje, zahtjeve za povlačenje i preglede koda
- Iskustvo u korištenju Dockera za izgradnju reproducibilnih okruženja
- Izvrsne pisane i usmene komunikacijske vještine
- Suradnički pristup timskom radu
- Sposobnost samostalnog upravljanja odgovornostima
- Izražene analitičke vještine i sposobnost rješavanja problema
- Doktorat ili ekvivalentno istraživačko iskustvo predstavljaju prednost
- Iskustvo sa sustavima CI/CD kao što su GitLab CI ili GitHub Actions predstavlja prednost
- Poznavanje alata za upravljanje okruženjima kao što su pyenv, Poetry ili virtualna okruženja
- Iskustvo s HPC ili računalnim okruženjima u oblaku, uključujući SLURM, AWS, GCP ili Azure, velika je prednost
- Dodatno programersko iskustvo u R-u, Perlu, Groovyju, Nimu ili Rustu je dobrodošlo
Pogodnosti
- Mogućnosti rada na daljinu
- Fleksibilno radno vrijeme
- Konkurentan paket pogodnosti
- Interni razvoj karijere
- Kontinuirano stručno usavršavanje
- Potpora za sudjelovanje na znanstvenim konferencijama
- Fiksna plaća
- Bonusna naknada
- Zdravstveno osiguranje bez troška za zaposlenika
- Fleksibilan hibridni, uredski ili potpuno udaljeni način rada