SeqOne kehittää tekoälypohjaisia bioinformatiikkaohjelmistoja molekyylilaboratorioille, jotka käsittelevät uuden sukupolven sekvensointidataa. Sen kokonaisvaltainen alusta tukee ituradan ja somaattisten muutosten analysointia paneeleista, eksomeista sekä lyhyen tai pitkän lukupituuden genomeista. SeqOne Flow automatisoi työnkulkuja, ja DiagAI tarjoaa kliinisesti validoitua tulkintaa. Yhtiön teknologiaa käytetään syövän, perinnöllisten sairauksien ja infektiotautien tutkimuksessa. Se yhdistää varianttien priorisoinnin, fenotyyppien yhteensovittamisen, patogeenisyyden ennustamisen ja asiantuntijoiden määrittelemät säännöt. SeqOne tarjoaa myös LIMS- ja IT-integraatioita, ammatillisia ja kliinisiä tulkintapalveluja, ensiluokkaisia annotaatiolähteitä sekä monikielistä tukea laboratorioiden käyttöönottoihin. Sen toiminta sijoittuu terveydenhuollon, bioteknologian ja tekoälyn risteykseen, ja siinä painottuvat turvallisuus, vaatimustenmukaisuus ja kliininen käyttöönotto.
Bioinformatiikan insinööri, onkologia ja hematologia — SeqOne (hybridityö, Ranska)
Rakenna toistettavia bioinformatiikan työnkulkuja ja ohjelmistoja SeqOnen kliinisen genomiikan alustalle. Tue onkologian ja hematologian tutkimusta luotettavilla ja skaalautuvilla ratkaisuilla.
Ranska32 000 € – 48 000 € / vuosi
HybridityöKokoaikainenJuniorKeskitasoVaadittu Kieli: englantiInsinööriKuvaus
- Kehitä työkaluja ja työnkulkuja monimutkaisille biologisille aineistoille
- Ylläpidä ja kehitä olemassa olevia sovelluksia
- Tutki käyttäjien ilmoittamia ongelmia ja ratkaise niitä
- Paranna sovellusten suorituskykyä ja luotettavuutta
- Tuota vankkoja ja toistettavia analyyttisiä tuloksia
- Työskentele tiiviisti tieteellisten tiimien kanssa
- Tue tieteellisiä julkaisuja ja esityksiä
- Edistä koodikatselmointeja
- Noudata koodausstandardeja ja turvallisen ohjelmistokehityksen käytäntöjä
- Arvioi uusia menetelmiä ja teknologioita niiden tarkoituksenmukaista käyttöönottoa varten
- Laadi ja ylläpidä teknistä dokumentaatiota
- Kouluta ja tue käyttäjiä ja kollegoita
- Työskentele tutkimus- ja tuotetiimien kanssa tieteellisten tarpeiden muuttamiseksi luotettavaksi ohjelmistoksi
- Edistä koodin laatua katselmusten, testauksen ja CI/CD-käytäntöjen avulla
- Auta luomaan tiimikäytäntöjä, jotka tekevät monimutkaisista analyyseistä rutiininomaisia, toistettavia ja skaalautuvia
Vaatimukset
- Ammatillinen kokemus onkohematologiasta on välttämätön
- Ylempi korkeakoulututkinto (Bac+5) bioinformatiikasta, tietojenkäsittelytieteestä tai vastaavalta alalta
- Vähintään kahden vuoden kokemus bioinformatiikkaohjelmistojen kehittämisestä
- Edistyneet taidot Pythonissa, UNIX/Linuxissa ja Bashissa
- Käytännön kokemusta työnkulkutyökaluista, kuten Snakemakesta ja Nextflow’sta
- Käytännön tuntemus Gitistä, mukaan lukien haarat, pull requestit ja koodikatselmoinnit
- Kokemusta Dockerin käytöstä toistettavien ympäristöjen rakentamiseen
- Erinomaiset kirjalliset ja suulliset viestintätaidot
- Yhteistyökykyinen työskentelyote
- Kyky hallita vastuualueita itsenäisesti
- Vahvat analyyttiset ja ongelmanratkaisutaidot
- Tohtorintutkinto tai vastaava tutkimuskokemus katsotaan eduksi
- Kokemus CI/CD-järjestelmistä, kuten GitLab CI:stä tai GitHub Actionsista, katsotaan eduksi
- Ympäristöjen hallintatyökalujen, kuten pyenvin, Poetryn tai virtuaaliympäristöjen, tuntemus
- Kokemus HPC- tai pilviympäristöistä, mukaan lukien SLURM, AWS, GCP tai Azure, on merkittävä etu
- Lisäohjelmointikokemus R:stä, Perlistä, Groovysta, Nimistä tai Rustista katsotaan eduksi
Edut
- Etätyömahdollisuudet
- Joustavat työajat
- Kilpailukykyinen etupaketti
- Sisäiset urakehitysmahdollisuudet
- Jatkuva ammatillinen koulutus
- Tuki tieteellisiin konferensseihin osallistumiseen
- Kiinteä palkka
- Bonuspalkkio
- Maksuton sairausvakuutus
- Joustavat hybridi-, toimisto- tai täysin etänä työskentelyn järjestelyt