SeqOne razvija bioinformacijsko programsko opremo, ki temelji na umetni inteligenci, za molekularne laboratorije, ki delajo s podatki sekvenciranja nove generacije. Njena celovita platforma podpira germinalno in somatsko analizo panelov, eksomov ter genomov s kratkimi ali dolgimi odčitki, z avtomatiziranimi delovnimi tokovi prek SeqOne Flow in klinično potrjeno interpretacijo prek DiagAI. Tehnologija podjetja se uporablja pri testiranju na področju onkologije, dednih bolezni in nalezljivih bolezni ter združuje določanje prednostnih različic, ujemanje fenotipov, napovedovanje patogenosti in pravila, ki jih določijo strokovnjaki. SeqOne zagotavlja tudi integracije z LIMS in sistemi IT, strokovne in klinične storitve interpretacije, vrhunske vire anotacij ter večjezično podporo pri uvajanju rešitev v laboratorijih. Njeno delo je na stičišču zdravstva, biotehnologije in umetne inteligence, s poudarkom na varnosti, skladnosti s predpisi in kliničnem sprejetju.
Inženir bioinformatike, onkologija in hematologija — SeqOne (hibridno, Francija)
Razvijajte ponovljive bioinformatske cevovode in programsko opremo za klinično genomsko platformo SeqOne. Podprite raziskave na področju onkologije in hematologije z zanesljivimi, razširljivimi rešitvami.
Francija32.000 € – 48.000 € / leto
HibridnoPolni delovni časJuniorSrednja ravenZahtevani Jezik: angleščinaInženirOpis
- Razvijanje orodij in cevovodov za kompleksne biološke podatkovne nize
- Vzdrževanje in izboljševanje obstoječih aplikacij
- Preiskovanje in odpravljanje težav, ki jih prijavijo uporabniki
- Izboljševanje zmogljivosti in zanesljivosti aplikacij
- Zagotavljanje robustnih in ponovljivih analitičnih rezultatov
- Tesno sodelovanje z znanstvenimi ekipami
- Podpora znanstvenim publikacijam in predstavitvam
- Olajševanje pregledov kode
- Uporaba standardov kodiranja in praks varnega razvoja
- Ocenjevanje novih metod in tehnologij za ustrezno uvedbo
- Pisanje in vzdrževanje tehnične dokumentacije
- Usposabljanje in podpora uporabnikom ter sodelavcem
- Sodelovanje z raziskovalnimi in produktnimi ekipami pri pretvarjanju znanstvenih potreb v zanesljivo programsko opremo
- Izboljševanje kakovosti kode s pregledi, testiranjem ter praksami CI/CD
- Pomoč pri vzpostavljanju ekipnih praks, zaradi katerih kompleksne analize postanejo rutinske, ponovljive in razširljive
Zahteve
- Potrebne so strokovne izkušnje na področju onkohematologije
- Magisterij (Bac+5) iz bioinformatike, računalništva ali sorodne discipline
- Vsaj dve leti izkušenj z razvojem bioinformatske programske opreme
- Napredno znanje Pythona, UNIX/Linuxa in Basha
- Praktične izkušnje z orodji za delovne tokove, kot sta Snakemake in Nextflow
- Delovno znanje Gita, vključno z vejami, pull requesti in pregledi kode
- Izkušnje z uporabo Dockera za izdelavo ponovljivih okolij
- Odlične pisne in ustne komunikacijske sposobnosti
- Sodelovalen pristop k timskemu delu
- Sposobnost samostojnega upravljanja odgovornosti
- Močne analitične sposobnosti in sposobnosti reševanja problemov
- Doktorski naziv ali enakovredne raziskovalne izkušnje so prednost
- Izkušnje s sistemi CI/CD, kot sta GitLab CI ali GitHub Actions, so prednost
- Poznavanje orodij za upravljanje okolij, kot so pyenv, Poetry ali navidezna okolja
- Izkušnje z okolji HPC ali oblačnimi okolji, vključno s SLURM, AWS, GCP ali Azure, so velika prednost
- Dodatne programerske izkušnje v R, Perlu, Groovyju, Nimu ali Rustu so dobrodošle
Ugodnosti
- Možnosti dela na daljavo
- Prilagodljiv delovni čas
- Konkurenčen paket ugodnosti
- Notranje priložnosti za razvoj kariere
- Nenehno strokovno izobraževanje
- Podpora pri udeležbi na znanstvenih konferencah
- Fiksno plačilo
- Bonusno plačilo
- Zdravstveno zavarovanje brez stroškov za zaposlenega
- Prilagodljive možnosti hibridnega, pisarniškega ali popolnoma oddaljenega dela