SeqOne
SeqOne
SeqOne sviluppa software di bioinformatica basato sull’intelligenza artificiale per laboratori molecolari che lavorano con dati di sequenziamento di nuova generazione. La sua piattaforma completa supporta l’analisi della linea germinale e somatica su pannelli, esomi e genomi a lettura corta o lunga, con flussi di lavoro automatizzati tramite SeqOne Flow e interpretazione clinicamente validata attraverso DiagAI. La tecnologia dell’azienda viene utilizzata nei test oncologici e per le malattie ereditarie e infettive, combinando la prioritizzazione delle varianti, la corrispondenza fenotipica, la previsione della patogenicità e regole definite da esperti. SeqOne offre inoltre integrazioni con LIMS e sistemi IT, servizi professionali e di interpretazione clinica, fonti di annotazione premium e supporto multilingue per le implementazioni nei laboratori. La sua attività si colloca all’intersezione tra assistenza sanitaria, biotecnologia e intelligenza artificiale, con particolare attenzione alla sicurezza, alla conformità e all’adozione clinica.

Ingegnere di Bioinformatica, Oncologia ed Ematologia — SeqOne (Ibrido, Francia)

Sviluppa pipeline bioinformatiche riproducibili e software per la piattaforma di genomica clinica di SeqOne. Supporta la ricerca in oncologia ed ematologia con soluzioni affidabili e scalabili.

Descrizione

  • Sviluppare strumenti e pipeline per set di dati biologici complessi
  • Mantenere e migliorare le applicazioni esistenti
  • Analizzare e risolvere i problemi segnalati dagli utenti
  • Migliorare le prestazioni e l’affidabilità delle applicazioni
  • Fornire risultati analitici solidi e riproducibili
  • Collaborare strettamente con i team scientifici
  • Supportare pubblicazioni e presentazioni scientifiche
  • Facilitare le revisioni del codice
  • Applicare gli standard di programmazione e pratiche di sviluppo sicuro
  • Valutare metodi e tecnologie emergenti per un’adozione pertinente
  • Scrivere e mantenere la documentazione tecnica
  • Formare e supportare utenti e colleghi
  • Collaborare con i team di ricerca e prodotto per trasformare le esigenze scientifiche in software affidabile
  • Promuovere la qualità del codice attraverso revisioni, test e pratiche di CI/CD
  • Contribuire a definire pratiche di team che rendano le analisi complesse ordinarie, riproducibili e scalabili

Requisiti

  • È richiesta esperienza professionale in oncoematologia
  • Laurea magistrale (Bac+5) in bioinformatica, informatica o disciplina affine
  • Almeno due anni di esperienza nello sviluppo di software bioinformatico
  • Conoscenza avanzata di Python, UNIX/Linux e Bash
  • Esperienza pratica con strumenti di workflow come Snakemake e Nextflow
  • Conoscenza operativa di Git, inclusi branching, pull request e revisioni del codice
  • Esperienza nell’uso di Docker per creare ambienti riproducibili
  • Ottime capacità di comunicazione scritta e orale
  • Approccio collaborativo al lavoro di squadra
  • Capacità di gestire le responsabilità in autonomia
  • Ottime capacità analitiche e di problem solving
  • Il dottorato di ricerca o un’esperienza equivalente nella ricerca costituisce un titolo preferenziale
  • L’esperienza con sistemi CI/CD come GitLab CI o GitHub Actions costituisce un vantaggio
  • Conoscenza di strumenti per la gestione degli ambienti come pyenv, Poetry o gli ambienti virtuali
  • L’esperienza con ambienti HPC o cloud, inclusi SLURM, AWS, GCP o Azure, costituisce un forte vantaggio
  • È apprezzata un’ulteriore esperienza di programmazione in R, Perl, Groovy, Nim o Rust

Benefit

  • Opportunità di lavoro da remoto
  • Orari di lavoro flessibili
  • Pacchetto di benefit competitivo
  • Opportunità interne di sviluppo professionale
  • Formazione professionale continua
  • Supporto per la partecipazione a conferenze scientifiche
  • Stipendio fisso
  • Compenso variabile
  • Assicurazione sanitaria fornita gratuitamente
  • Modalità di lavoro flessibili, ibride, in presenza o completamente da remoto