SeqOne phát triển phần mềm tin sinh học ứng dụng trí tuệ nhân tạo dành cho các phòng xét nghiệm phân tử làm việc với dữ liệu giải trình tự thế hệ mới. Nền tảng tất cả trong một của công ty hỗ trợ phân tích dòng mầm và đột biến soma trên các bộ gen mục tiêu, exome và bộ gen đọc ngắn hoặc đọc dài, với quy trình tự động hóa thông qua SeqOne Flow và khả năng diễn giải đã được thẩm định lâm sàng thông qua DiagAI. Công nghệ của SeqOne được sử dụng trong xét nghiệm ung thư, bệnh di truyền và bệnh truyền nhiễm, kết hợp các tính năng xếp hạng ưu tiên biến thể, đối chiếu kiểu hình, dự đoán tính gây bệnh và các quy tắc do chuyên gia xác định. SeqOne cũng cung cấp tích hợp LIMS và hệ thống công nghệ thông tin, dịch vụ diễn giải chuyên môn và lâm sàng, các nguồn chú giải cao cấp cùng hỗ trợ đa ngôn ngữ cho hoạt động triển khai tại phòng xét nghiệm. Công ty hoạt động tại giao điểm giữa y tế, công nghệ sinh học và trí tuệ nhân tạo, tập trung vào bảo mật, tuân thủ và việc ứng dụng trong lâm sàng.
Kỹ sư Tin sinh học, Ung thư học và Huyết học — SeqOne (Làm việc kết hợp, Pháp)
Xây dựng các quy trình phân tích và phần mềm tin sinh học có khả năng tái lập cho nền tảng genom học lâm sàng của SeqOne. Hỗ trợ nghiên cứu ung thư học và huyết học bằng các giải pháp đáng tin cậy, có khả năng mở rộng.
Mô tả
- Phát triển công cụ và quy trình phân tích cho các tập dữ liệu sinh học phức tạp
- Bảo trì và cải tiến các ứng dụng hiện có
- Điều tra và xử lý các vấn đề do người dùng báo cáo
- Cải thiện hiệu suất và độ tin cậy của ứng dụng
- Cung cấp kết quả phân tích vững chắc, có khả năng tái lập
- Phối hợp chặt chẽ với các nhóm khoa học
- Hỗ trợ các ấn phẩm và bài thuyết trình khoa học
- Điều phối hoạt động đánh giá mã nguồn
- Áp dụng các tiêu chuẩn lập trình và thực hành phát triển an toàn
- Đánh giá các phương pháp và công nghệ mới nổi để áp dụng khi phù hợp
- Viết và duy trì tài liệu kỹ thuật
- Đào tạo và hỗ trợ người dùng cùng đồng nghiệp
- Phối hợp với các nhóm nghiên cứu và sản phẩm để chuyển nhu cầu khoa học thành phần mềm đáng tin cậy
- Nâng cao chất lượng mã nguồn thông qua đánh giá, kiểm thử và thực hành CI/CD
- Góp phần xây dựng các phương thức làm việc giúp những phân tích phức tạp trở nên thường quy, có khả năng tái lập và mở rộng
Yêu cầu
- Yêu cầu có kinh nghiệm chuyên môn trong lĩnh vực ung thư huyết học
- Tốt nghiệp thạc sĩ (Bac+5) về tin sinh học, khoa học máy tính hoặc lĩnh vực liên quan
- Có ít nhất hai năm kinh nghiệm phát triển phần mềm tin sinh học
- Thành thạo Python, UNIX/Linux và Bash
- Có kinh nghiệm thực tế với các công cụ quản lý quy trình như Snakemake và Nextflow
- Có kiến thức thực hành về Git, bao gồm phân nhánh, yêu cầu kéo và đánh giá mã nguồn
- Có kinh nghiệm sử dụng Docker để xây dựng môi trường có khả năng tái lập
- Kỹ năng giao tiếp bằng văn bản và lời nói tốt
- Có tinh thần hợp tác trong làm việc nhóm
- Có khả năng tự quản lý trách nhiệm công việc
- Kỹ năng phân tích và giải quyết vấn đề tốt
- Bằng tiến sĩ hoặc kinh nghiệm nghiên cứu tương đương là một lợi thế
- Có kinh nghiệm với các hệ thống CI/CD như GitLab CI hoặc GitHub Actions là một lợi thế
- Có kiến thức về các công cụ quản lý môi trường như pyenv, Poetry hoặc môi trường ảo
- Có kinh nghiệm với môi trường HPC hoặc đám mây, bao gồm SLURM, AWS, GCP hoặc Azure, là một lợi thế lớn
- Có thêm kinh nghiệm lập trình bằng R, Perl, Groovy, Nim hoặc Rust là điểm cộng
Phúc lợi
- Cơ hội làm việc từ xa
- Giờ làm việc linh hoạt
- Gói phúc lợi cạnh tranh
- Cơ hội phát triển nghề nghiệp nội bộ
- Đào tạo chuyên môn liên tục
- Hỗ trợ tham dự các hội nghị khoa học
- Mức lương cố định
- Khoản thưởng
- Bảo hiểm y tế được cung cấp miễn phí
- Hình thức làm việc kết hợp, tại văn phòng hoặc hoàn toàn từ xa linh hoạt