SeqOne розробляє біоінформатичне програмне забезпечення на основі штучного інтелекту для молекулярних лабораторій, які працюють із даними секвенування нового покоління. Універсальна платформа підтримує гермінальний і соматичний аналіз панелей, екзомів, а також короткочитаних і довгочитаних геномів, автоматизуючи робочі процеси за допомогою SeqOne Flow і забезпечуючи клінічно валідовану інтерпретацію завдяки DiagAI. Технології компанії використовують в онкології, діагностиці спадкових та інфекційних захворювань; вони поєднують пріоритизацію варіантів, зіставлення фенотипів, прогнозування патогенності та правила, визначені експертами. SeqOne також надає інтеграції з LIMS та ІТ-системами, послуги професійної й клінічної інтерпретації, преміальні джерела анотацій і багатомовну підтримку лабораторних впроваджень. Компанія працює на перетині охорони здоров’я, біотехнологій і штучного інтелекту, зосереджуючись на безпеці, дотриманні нормативних вимог і клінічному впровадженні.
Інженер з біоінформатики в онкології та гематології — SeqOne (гібридний формат, Франція)
Розробляйте відтворювані біоінформатичні конвеєри та програмне забезпечення для клінічної геномної платформи SeqOne. Підтримуйте дослідження в онкології та гематології за допомогою надійних і масштабованих рішень.
Франція32 000 € – 48 000 € / рік
ГібридПовна зайнятістьМолодший спеціалістСередній рівеньОбов’язкова Мова: англійськаІнженерОпис
- Розробляти інструменти та конвеєри для складних біологічних наборів даних
- Підтримувати й удосконалювати наявні застосунки
- Досліджувати проблеми, про які повідомляють користувачі, та усувати їх
- Покращувати продуктивність і надійність застосунків
- Забезпечувати надійні, відтворювані результати аналізу
- Тісно співпрацювати з науковими командами
- Підтримувати підготовку наукових публікацій і презентацій
- Сприяти проведенню рев’ю коду
- Застосовувати стандарти кодування та практики безпечної розробки
- Оцінювати нові методи й технології для доцільного впровадження
- Створювати й підтримувати технічну документацію
- Навчати та підтримувати користувачів і колег
- Працювати з дослідницькими та продуктовими командами, перетворюючи наукові потреби на надійне програмне забезпечення
- Підвищувати якість коду за допомогою рев’ю, тестування та практик CI/CD
- Допомагати формувати командні практики, що роблять складний аналіз стандартним, відтворюваним і масштабованим
Вимоги
- Потрібен професійний досвід в онкогематології
- Ступінь магістра (Bac+5) у галузі біоінформатики, інформатики або суміжній дисципліні
- Щонайменше два роки досвіду розробки біоінформатичного програмного забезпечення
- Високий рівень володіння Python, UNIX/Linux і Bash
- Практичний досвід роботи з інструментами керування робочими процесами, такими як Snakemake і Nextflow
- Знання Git, зокрема роботи з гілками, pull request і рев’ю коду
- Досвід використання Docker для створення відтворюваних середовищ
- Відмінні навички письмової та усної комунікації
- Уміння працювати в команді
- Здатність самостійно керувати своїми обов’язками
- Сильні аналітичні навички та навички розв’язання проблем
- Наявність PhD або еквівалентного дослідницького досвіду буде перевагою
- Досвід роботи із системами CI/CD, такими як GitLab CI або GitHub Actions, буде перевагою
- Знання інструментів керування середовищами, таких як pyenv, Poetry або віртуальні середовища
- Досвід роботи з HPC або хмарними середовищами, зокрема SLURM, AWS, GCP або Azure, буде значною перевагою
- Додатковий досвід програмування на R, Perl, Groovy, Nim або Rust вітається
Переваги
- Можливість віддаленої роботи
- Гнучкий робочий графік
- Конкурентний пакет пільг
- Можливості внутрішнього кар’єрного розвитку
- Постійне професійне навчання
- Підтримка участі в наукових конференціях
- Фіксована заробітна плата
- Бонусні виплати
- Медичне страхування безкоштовно для працівника
- Гнучкий гібридний, офісний або повністю віддалений формат роботи