
A SeqOne mesterséges intelligenciával támogatott bioinformatikai szoftvereket fejleszt újgenerációs szekvenálási adatokkal dolgozó molekuláris laboratóriumok számára. All-in-one platformja támogatja a csíravonal- és szomatikus elemzést panelek, exomok, valamint rövid vagy hosszú olvasatú genomok esetében. A SeqOne Flow automatizált munkafolyamatokat, a DiagAI pedig klinikailag validált értelmezést biztosít. A vállalat technológiáját onkológiai, öröklődő és fertőző betegségek vizsgálatára használják; egyesíti a variánsok rangsorolását, a fenotípus-illesztést, a patogenitás előrejelzését és a szakértők által meghatározott szabályokat. A SeqOne emellett LIMS- és IT-integrációkat, professzionális és klinikai értelmezési szolgáltatásokat, prémium annotációs forrásokat, valamint többnyelvű támogatást nyújt laboratóriumi bevezetésekhez. Munkája az egészségügy, a biotechnológia és a mesterséges intelligencia metszéspontjában helyezkedik el, a biztonságra, a megfelelőségre és a klinikai alkalmazásra összpontosítva.
Bioinformatikai mérnök, onkológia és hematológia — SeqOne (hibrid, Franciaország)
Megbízható, reprodukálható bioinformatikai folyamatokat és szoftvereket fejleszt a SeqOne klinikai genomikai platformjához. Megbízható, skálázható megoldásokkal támogatja az onkológiai és hematológiai kutatásokat.
32 000 € – 48 000 € / év
HibridTeljes munkaidőJuniorKözéphaladóKötelező Nyelv: angolMérnökLeírás
- Eszközök és folyamatok fejlesztése összetett biológiai adathalmazokhoz
- Meglévő alkalmazások karbantartása és továbbfejlesztése
- A felhasználók által jelzett problémák kivizsgálása és megoldása
- Az alkalmazások teljesítményének és megbízhatóságának javítása
- Robusztus, reprodukálható elemzési eredmények biztosítása
- Szoros együttműködés a tudományos csapatokkal
- Tudományos publikációk és prezentációk támogatása
- A kódellenőrzések elősegítése
- A kódolási szabványok és a biztonságos fejlesztési gyakorlatok alkalmazása
- Az új módszerek és technológiák értékelése a releváns bevezetés érdekében
- Műszaki dokumentáció írása és karbantartása
- A felhasználók és kollégák képzése és támogatása
- Együttműködés a kutatási és termékcsapatokkal a tudományos igények megbízható szoftverré alakításában
- A kódminőség javítása ellenőrzésekkel, teszteléssel és CI/CD-gyakorlatokkal
- Olyan csapatgyakorlatok kialakításának támogatása, amelyek a komplex elemzéseket rutinszerűvé, reprodukálhatóvá és skálázhatóvá teszik
Követelmények
- Onkohematológiai szakmai tapasztalat szükséges
- Bioinformatikai, informatikai vagy kapcsolódó szakterületen szerzett mesterfokozat (Bac+5)
- Legalább két év tapasztalat bioinformatikai szoftverek fejlesztésében
- Haladó szintű Python-, UNIX/Linux- és Bash-ismeretek
- Gyakorlati tapasztalat olyan munkafolyamat-eszközökkel, mint a Snakemake és a Nextflow
- A Git magabiztos használata, beleértve az ágkezelést, a pull requesteket és a kódellenőrzéseket
- Tapasztalat Docker használatában reprodukálható környezetek létrehozásához
- Erős írásbeli és szóbeli kommunikációs készség
- Együttműködő hozzáállás a csapatmunkához
- Önálló munkavégzés és a felelősségek kezelése
- Erős elemző- és problémamegoldó készség
- A PhD vagy az azzal egyenértékű kutatási tapasztalat előnyt jelent
- A GitLab CI-hez vagy GitHub Actions-höz hasonló CI/CD-rendszerekben szerzett tapasztalat előnyt jelent
- Az olyan környezetkezelő eszközök ismerete, mint a pyenv, a Poetry vagy a virtuális környezetek
- A HPC- vagy felhőkörnyezetekben, például SLURM, AWS, GCP vagy Azure használatában szerzett tapasztalat jelentős előnyt jelent
- Az R, Perl, Groovy, Nim vagy Rust nyelvekben szerzett további programozási tapasztalat előnyt jelent
Juttatások
- Távoli munkavégzési lehetőségek
- Rugalmas munkaidő
- Versenyképes juttatási csomag
- Belső karrierfejlesztési lehetőségek
- Folyamatos szakmai képzés
- Támogatás tudományos konferenciákon való részvételhez
- Fix fizetés
- Bónuszjuttatás
- Térítésmentes egészségbiztosítás
- Rugalmas hibrid, irodai vagy teljesen távoli munkavégzési lehetőségek