SeqOne
SeqOne
A SeqOne mesterséges intelligenciával támogatott bioinformatikai szoftvereket fejleszt újgenerációs szekvenálási adatokkal dolgozó molekuláris laboratóriumok számára. All-in-one platformja támogatja a csíravonal- és szomatikus elemzést panelek, exomok, valamint rövid vagy hosszú olvasatú genomok esetében. A SeqOne Flow automatizált munkafolyamatokat, a DiagAI pedig klinikailag validált értelmezést biztosít. A vállalat technológiáját onkológiai, öröklődő és fertőző betegségek vizsgálatára használják; egyesíti a variánsok rangsorolását, a fenotípus-illesztést, a patogenitás előrejelzését és a szakértők által meghatározott szabályokat. A SeqOne emellett LIMS- és IT-integrációkat, professzionális és klinikai értelmezési szolgáltatásokat, prémium annotációs forrásokat, valamint többnyelvű támogatást nyújt laboratóriumi bevezetésekhez. Munkája az egészségügy, a biotechnológia és a mesterséges intelligencia metszéspontjában helyezkedik el, a biztonságra, a megfelelőségre és a klinikai alkalmazásra összpontosítva.

Bioinformatikai mérnök, onkológia és hematológia — SeqOne (hibrid, Franciaország)

Megbízható, reprodukálható bioinformatikai folyamatokat és szoftvereket fejleszt a SeqOne klinikai genomikai platformjához. Megbízható, skálázható megoldásokkal támogatja az onkológiai és hematológiai kutatásokat.

Leírás

  • Eszközök és folyamatok fejlesztése összetett biológiai adathalmazokhoz
  • Meglévő alkalmazások karbantartása és továbbfejlesztése
  • A felhasználók által jelzett problémák kivizsgálása és megoldása
  • Az alkalmazások teljesítményének és megbízhatóságának javítása
  • Robusztus, reprodukálható elemzési eredmények biztosítása
  • Szoros együttműködés a tudományos csapatokkal
  • Tudományos publikációk és prezentációk támogatása
  • A kódellenőrzések elősegítése
  • A kódolási szabványok és a biztonságos fejlesztési gyakorlatok alkalmazása
  • Az új módszerek és technológiák értékelése a releváns bevezetés érdekében
  • Műszaki dokumentáció írása és karbantartása
  • A felhasználók és kollégák képzése és támogatása
  • Együttműködés a kutatási és termékcsapatokkal a tudományos igények megbízható szoftverré alakításában
  • A kódminőség javítása ellenőrzésekkel, teszteléssel és CI/CD-gyakorlatokkal
  • Olyan csapatgyakorlatok kialakításának támogatása, amelyek a komplex elemzéseket rutinszerűvé, reprodukálhatóvá és skálázhatóvá teszik

Követelmények

  • Onkohematológiai szakmai tapasztalat szükséges
  • Bioinformatikai, informatikai vagy kapcsolódó szakterületen szerzett mesterfokozat (Bac+5)
  • Legalább két év tapasztalat bioinformatikai szoftverek fejlesztésében
  • Haladó szintű Python-, UNIX/Linux- és Bash-ismeretek
  • Gyakorlati tapasztalat olyan munkafolyamat-eszközökkel, mint a Snakemake és a Nextflow
  • A Git magabiztos használata, beleértve az ágkezelést, a pull requesteket és a kódellenőrzéseket
  • Tapasztalat Docker használatában reprodukálható környezetek létrehozásához
  • Erős írásbeli és szóbeli kommunikációs készség
  • Együttműködő hozzáállás a csapatmunkához
  • Önálló munkavégzés és a felelősségek kezelése
  • Erős elemző- és problémamegoldó készség
  • A PhD vagy az azzal egyenértékű kutatási tapasztalat előnyt jelent
  • A GitLab CI-hez vagy GitHub Actions-höz hasonló CI/CD-rendszerekben szerzett tapasztalat előnyt jelent
  • Az olyan környezetkezelő eszközök ismerete, mint a pyenv, a Poetry vagy a virtuális környezetek
  • A HPC- vagy felhőkörnyezetekben, például SLURM, AWS, GCP vagy Azure használatában szerzett tapasztalat jelentős előnyt jelent
  • Az R, Perl, Groovy, Nim vagy Rust nyelvekben szerzett további programozási tapasztalat előnyt jelent

Juttatások

  • Távoli munkavégzési lehetőségek
  • Rugalmas munkaidő
  • Versenyképes juttatási csomag
  • Belső karrierfejlesztési lehetőségek
  • Folyamatos szakmai képzés
  • Támogatás tudományos konferenciákon való részvételhez
  • Fix fizetés
  • Bónuszjuttatás
  • Térítésmentes egészségbiztosítás
  • Rugalmas hibrid, irodai vagy teljesen távoli munkavégzési lehetőségek