
SeqOne dezvoltă software de bioinformatică bazat pe inteligență artificială pentru laboratoare moleculare care lucrează cu date de secvențiere de nouă generație. Platforma sa integrată acceptă analiza variantelor germinale și somatice pentru panouri, exomi și genomuri cu citiri scurte sau lungi, oferind fluxuri de lucru automatizate prin SeqOne Flow și interpretare validată clinic prin DiagAI. Tehnologia companiei este utilizată în testarea oncologică, a bolilor ereditare și a bolilor infecțioase, combinând prioritizarea variantelor, corelarea fenotipurilor, predicția patogenității și reguli definite de experți. SeqOne oferă, de asemenea, integrări LIMS și IT, servicii de interpretare profesională și clinică, surse premium de adnotare și asistență multilingvă pentru implementări în laboratoare. Activitatea sa se află la intersecția dintre serviciile medicale, biotehnologie și inteligența artificială, cu accent pe securitate, conformitate și adoptare clinică.
Inginer bioinformatică, oncologie și hematologie — SeqOne (Hibrid, Franța)
Dezvoltă fluxuri de lucru și software de bioinformatică reproductibile pentru platforma de genomică clinică SeqOne. Sprijină cercetarea în oncologie și hematologie prin soluții fiabile și scalabile.
32.000 € – 48.000 € / an
HibridNormă întreagăJuniorNivel mediuLimbă Obligatorie: englezăInginerDescriere
- Dezvoltă instrumente și fluxuri de lucru pentru seturi de date biologice complexe
- Menține și îmbunătățește aplicațiile existente
- Investighează și rezolvă problemele raportate de utilizatori
- Îmbunătățește performanța și fiabilitatea aplicațiilor
- Livrează rezultate analitice robuste și reproductibile
- Colaborează îndeaproape cu echipele științifice
- Sprijină publicațiile și prezentările științifice
- Facilitează evaluările codului
- Aplică standarde de programare și practici de dezvoltare securizată
- Evaluează metodele și tehnologiile emergente pentru adoptarea celor relevante
- Redactează și menține documentația tehnică
- Instruiește și sprijină utilizatorii și colegii
- Colaborează cu echipele de cercetare și produs pentru a transforma nevoile științifice în software fiabil
- Promovează calitatea codului prin evaluări, testare și practici CI/CD
- Contribuie la stabilirea unor practici de echipă care fac analizele complexe rutină, reproductibile și scalabile
Cerințe
- Este necesară experiență profesională în oncohematologie
- Diplomă de master (Bac+5) în bioinformatică, informatică sau un domeniu conex
- Cel puțin doi ani de experiență în dezvoltarea de software de bioinformatică
- Competențe avansate în Python, UNIX/Linux și Bash
- Experiență practică cu instrumente pentru fluxuri de lucru precum Snakemake și Nextflow
- Cunoștințe practice de Git, inclusiv ramificare, pull request-uri și evaluări ale codului
- Experiență în utilizarea Docker pentru construirea unor medii reproductibile
- Abilități excelente de comunicare scrisă și verbală
- Abordare colaborativă a muncii în echipă
- Capacitatea de a gestiona responsabilitățile în mod independent
- Abilități analitice și de rezolvare a problemelor solide
- Doctoratul sau experiența de cercetare echivalentă constituie un avantaj
- Experiența cu sisteme CI/CD precum GitLab CI sau GitHub Actions constituie un avantaj
- Cunoștințe despre instrumente de gestionare a mediilor precum pyenv, Poetry sau mediile virtuale
- Experiența în medii HPC sau cloud, inclusiv SLURM, AWS, GCP sau Azure, constituie un avantaj important
- Experiența suplimentară de programare în R, Perl, Groovy, Nim sau Rust este binevenită
Beneficii
- Oportunități de lucru la distanță
- Program de lucru flexibil
- Pachet de beneficii competitiv
- Oportunități interne de dezvoltare profesională
- Formare profesională continuă
- Sprijin pentru participarea la conferințe științifice
- Salariu fix
- Compensație sub formă de bonus
- Asigurare de sănătate oferită fără costuri
- Opțiuni flexibile de lucru hibrid, de la sediu sau complet la distanță