SeqOne
SeqOne
SeqOneは、次世代シーケンシングデータを扱う分子検査ラボ向けに、AIを活用したバイオインフォマティクスソフトウェアを開発しています。オールインワンプラットフォームは、パネル、エクソーム、ショートリードまたはロングリードのゲノムを対象とした生殖細胞系列および体細胞解析に対応し、SeqOne Flowによるワークフローの自動化と、臨床的に検証されたDiagAIによる解釈を提供します。同社の技術は、腫瘍、遺伝性疾患、感染症の検査に利用されており、バリアントの優先順位付け、表現型マッチング、病原性予測、専門家が定義したルールを組み合わせています。SeqOneは、LIMSおよびIT連携、専門的・臨床的な解釈サービス、高度なアノテーション情報源、ラボ導入向けの多言語サポートも提供しています。医療、バイオテクノロジー、人工知能の接点に位置し、安全性、コンプライアンス、臨床現場での導入を重視しています。

バイオインフォマティクスエンジニア、腫瘍学・血液学 — SeqOne(ハイブリッド勤務、フランス)

SeqOneの臨床ゲノム解析プラットフォーム向けに、再現性の高いバイオインフォマティクスパイプラインとソフトウェアを構築します。 信頼性と拡張性に優れたソリューションで、腫瘍学・血液学研究を支援します。

仕事内容

  • 複雑な生物学的データセット向けのツールとパイプラインを開発する
  • 既存のアプリケーションを保守・改善する
  • ユーザーから報告された問題を調査し解決する
  • アプリケーションの性能と信頼性を向上させる
  • 堅牢で再現性のある分析結果を提供する
  • 科学研究チームと緊密に連携する
  • 科学論文の作成と発表を支援する
  • コードレビューを促進する
  • コーディング標準と安全な開発プラクティスを適用する
  • 新しい手法や技術を評価し、適切なものを導入する
  • 技術文書を作成・維持する
  • ユーザーや同僚をトレーニングしサポートする
  • 研究チームおよびプロダクトチームと連携し、科学的ニーズを信頼できるソフトウェアに変換する
  • レビュー、テスト、CI/CDプラクティスを通じてコード品質を高める
  • 複雑な解析を日常的かつ再現可能で拡張可能なものにするチームプラクティスの確立を支援する

応募要件

  • 腫瘍血液学分野での実務経験が必須
  • バイオインフォマティクス、コンピューターサイエンス、または関連分野の修士号(Bac+5)
  • バイオインフォマティクスソフトウェアの開発経験2年以上
  • Python、UNIX/Linux、Bashの高度なスキル
  • SnakemakeやNextflowなどのワークフローツールの実務経験
  • ブランチ、プルリクエスト、コードレビューを含むGitの実務知識
  • 再現性のある環境構築にDockerを使用した経験
  • 優れた文書および口頭でのコミュニケーション能力
  • 協調してチームで働けること
  • 担当業務を自律的に管理できること
  • 高い分析力と問題解決能力
  • 博士号または同等の研究経験があれば尚可
  • GitLab CIやGitHub ActionsなどのCI/CDシステムの経験があれば尚可
  • pyenv、Poetry、仮想環境などの環境管理ツールに関する知識
  • SLURM、AWS、GCP、AzureなどのHPCまたはクラウド環境の経験があれば大きな強み
  • R、Perl、Groovy、Nim、Rustなどの追加のプログラミング経験があれば歓迎

福利厚生

  • リモート勤務の機会
  • 柔軟な勤務時間
  • 競争力のある福利厚生パッケージ
  • 社内でのキャリア開発機会
  • 継続的な専門研修
  • 科学会議への参加支援
  • 固定給
  • 賞与
  • 医療保険を無料で提供
  • ハイブリッド勤務、出社勤務、完全リモート勤務から柔軟に選択可能