
SeqOne arendab tehisintellektil põhinevat bioinformaatikatarkvara molekulaarlaboritele, mis töötavad järgmise põlvkonna sekveneerimisandmetega. Selle kõik-ühes platvorm toetab iduliini- ja somaatiliste muutuste analüüsi paneelide, eks oomide ning lühikese või pika lugemispikkusega genoomide puhul. SeqOne Flow automatiseerib töövooge ja DiagAI pakub kliiniliselt valideeritud tõlgendust. Ettevõtte tehnoloogiat kasutatakse onkoloogias, pärilike haiguste ja nakkushaiguste testimisel. See ühendab variantide prioritiseerimise, fenotüüpide sobitamise, patogeensuse ennustamise ning ekspertide määratud reeglid. SeqOne pakub ka LIMS- ja IT-integratsioone, professionaalseid ja kliinilisi tõlgendamisteenuseid, kvaliteetseid annotatsiooniallikaid ning mitmekeelset tuge laborilahenduste juurutamisel. Ettevõtte tegevus paikneb tervishoiu, biotehnoloogia ja tehisintellekti ristumiskohas, keskendudes turvalisusele, nõuetele vastavusele ja kliinilisele kasutuselevõtule.
Bioinformaatikainsener, onkoloogia ja hematoloogia — SeqOne (hübriidtöö, Prantsusmaa)
Loo SeqOne’i kliinilise genoomika platvormi jaoks reprodutseeritavaid bioinformaatika töövooge ja tarkvara. Toeta onkoloogia- ja hematoloogiauuringuid töökindlate ning skaleeritavate lahendustega.
32 000 € – 48 000 € / aasta
HübriidtööTäistööaegJuuniorKesktaseNõutav Keel: ingliseInsenerKirjeldus
- Tööta välja tööriistu ja töövooge keerukate bioloogiliste andmekogumite jaoks
- Hoolda ja täiusta olemasolevaid rakendusi
- Uuri kasutajate teatatud probleeme ja lahenda neid
- Paranda rakenduste jõudlust ja töökindlust
- Paku tugevaid ja reprodutseeritavaid analüütilisi tulemusi
- Tee tihedat koostööd teadusmeeskondadega
- Toeta teaduspublikatsioone ja ettekandeid
- Korralda koodiretsensioone
- Rakenda kodeerimisstandardeid ja turvalise arenduse tavasid
- Hinda uusi meetodeid ja tehnoloogiaid nende asjakohaseks kasutuselevõtuks
- Koosta ja halda tehnilist dokumentatsiooni
- Koolita ja toeta kasutajaid ning kolleege
- Tee teadus- ja tootemeeskondadega koostööd, et muuta teaduslikud vajadused töökindlaks tarkvaraks
- Edenda koodi kvaliteeti retsensioonide, testimise ja CI/CD-tavade abil
- Aita kujundada meeskonnatavasid, mis muudavad keerukad analüüsid rutiinseks, reprodutseeritavaks ja skaleeritavaks
Nõuded
- Nõutav on erialane kogemus onkohematoloogia valdkonnas
- Magistrikraad (Bac+5) bioinformaatikas, informaatikas või seotud erialal
- Vähemalt kaheaastane kogemus bioinformaatikatarkvara arendamisel
- Edasijõudnud teadmised Pythonist, UNIX/Linuxist ja Bashist
- Praktiline kogemus töövootööriistadega, nagu Snakemake ja Nextflow
- Git-i tööalased teadmised, sealhulgas harud, pull request’id ja koodiretsensioonid
- Kogemus Dockeriga reprodutseeritavate keskkondade loomiseks
- Väga hea kirjalik ja suuline suhtlusoskus
- Koostöövalmidus
- Võime hallata vastutusvaldkondi iseseisvalt
- Tugev analüüsi- ja probleemilahendusoskus
- Doktorikraad või samaväärne teadustöö kogemus tuleb kasuks
- CI/CD-süsteemide, näiteks GitLab CI või GitHub Actionsi, kasutamise kogemus tuleb kasuks
- Keskkonnahaldustööriistade, näiteks pyenvi, Poetry või virtuaalkeskkondade, tundmine
- Kogemus HPC- või pilvekeskkondadega, sealhulgas SLURM-i, AWS-i, GCP või Azure’iga, on suur eelis
- Täiendav programmeerimiskogemus R-i, Perli, Groovy, Nimi või Rustiga on teretulnud
Hüved
- Kaugtöö võimalused
- Paindlik tööaeg
- Konkurentsivõimeline hüvitiste pakett
- Ettevõttesisesed karjäärivõimalused
- Pidev erialane koolitus
- Toetus teaduskonverentsidel osalemiseks
- Fikseeritud palk
- Boonustasu
- Tasuta tervisekindlustus
- Paindlikud hübriid-, kontori- või täielikult kaugtöö võimalused