SeqOne
SeqOne
SeqOne utvikler AI-drevet bioinformatikkprogramvare for molekylære laboratorier som arbeider med data fra neste generasjons sekvensering. Den helhetlige plattformen støtter germline- og somatisk analyse av paneler, eksomer samt kort- eller langleste genomer, med automatiserte arbeidsflyter gjennom SeqOne Flow og klinisk validert tolkning gjennom DiagAI. Selskapets teknologi brukes i testing for kreft, arvelige sykdommer og infeksjonssykdommer, og kombinerer prioritering av varianter, fenotypetilpasning, prediksjon av patogenisitet og ekspertdefinerte regler. SeqOne tilbyr også LIMS- og IT-integrasjoner, profesjonelle og kliniske tolkingstjenester, premiumkilder for annotering og flerspråklig støtte for laboratorieimplementeringer. Arbeidet befinner seg i skjæringspunktet mellom helsetjenester, bioteknologi og kunstig intelligens, med fokus på sikkerhet, etterlevelse og klinisk bruk.

Bioinformatikkingeniør, onkologi og hematologi — SeqOne (hybrid, Frankrike)

Bygg reproduserbare bioinformatikkpipelines og programvare for SeqOnes kliniske genomikkplattform. Støtt forskning innen onkologi og hematologi med pålitelige, skalerbare løsninger.

Beskrivelse

  • Utvikle verktøy og pipelines for komplekse biologiske datasett
  • Vedlikeholde og forbedre eksisterende applikasjoner
  • Undersøke og løse problemer rapportert av brukere
  • Forbedre applikasjonenes ytelse og pålitelighet
  • Levere robuste og reproduserbare analytiske resultater
  • Arbeide tett med vitenskapelige team
  • Støtte vitenskapelige publikasjoner og presentasjoner
  • Tilrettelegge for kodegjennomganger
  • Bruke kodestandarder og sikker utviklingspraksis
  • Evaluere nye metoder og teknologier for relevant bruk
  • Skrive og vedlikeholde teknisk dokumentasjon
  • Opplære og støtte brukere og kolleger
  • Arbeide med forsknings- og produktteam for å omsette vitenskapelige behov til pålitelig programvare
  • Fremme kodekvalitet gjennom gjennomganger, testing og CI/CD-praksis
  • Bidra til å etablere teampraksis som gjør komplekse analyser rutinemessige, reproduserbare og skalerbare

Krav

  • Yrkeserfaring innen onkohematologi er påkrevd
  • Mastergrad (Bac+5) i bioinformatikk, informatikk eller et beslektet fagområde
  • Minst to års erfaring med utvikling av bioinformatikkprogramvare
  • Avanserte ferdigheter i Python, UNIX/Linux og Bash
  • Praktisk erfaring med workflowverktøy som Snakemake og Nextflow
  • Arbeidskunnskap om Git, inkludert branching, pull requests og kodegjennomganger
  • Erfaring med Docker for å bygge reproduserbare miljøer
  • Gode skriftlige og muntlige kommunikasjonsevner
  • Samarbeidsorientert tilnærming til teamarbeid
  • Evne til å håndtere ansvarsområder selvstendig
  • Sterke analytiske evner og problemløsningsevner
  • Doktorgrad eller tilsvarende forskningserfaring er en fordel
  • Erfaring med CI/CD-systemer som GitLab CI eller GitHub Actions er en fordel
  • Kunnskap om verktøy for miljøhåndtering som pyenv, Poetry eller virtuelle miljøer
  • Erfaring med HPC- eller skymiljøer, inkludert SLURM, AWS, GCP eller Azure, er en stor fordel
  • Ytterligere programmeringserfaring i R, Perl, Groovy, Nim eller Rust er velkommen

Fordeler

  • Mulighet for fjernarbeid
  • Fleksibel arbeidstid
  • Konkurransedyktig fordelspakke
  • Interne muligheter for karriereutvikling
  • Løpende faglig opplæring
  • Støtte til deltakelse på vitenskapelige konferanser
  • Fastlønn
  • Bonusordning
  • Helseforsikring uten kostnad
  • Fleksible arbeidsformer med hybridarbeid, arbeid på stedet eller fullt fjernarbeid