
SeqOne utvikler AI-drevet bioinformatikkprogramvare for molekylære laboratorier som arbeider med data fra neste generasjons sekvensering. Den helhetlige plattformen støtter germline- og somatisk analyse av paneler, eksomer samt kort- eller langleste genomer, med automatiserte arbeidsflyter gjennom SeqOne Flow og klinisk validert tolkning gjennom DiagAI. Selskapets teknologi brukes i testing for kreft, arvelige sykdommer og infeksjonssykdommer, og kombinerer prioritering av varianter, fenotypetilpasning, prediksjon av patogenisitet og ekspertdefinerte regler. SeqOne tilbyr også LIMS- og IT-integrasjoner, profesjonelle og kliniske tolkingstjenester, premiumkilder for annotering og flerspråklig støtte for laboratorieimplementeringer. Arbeidet befinner seg i skjæringspunktet mellom helsetjenester, bioteknologi og kunstig intelligens, med fokus på sikkerhet, etterlevelse og klinisk bruk.
Bioinformatikkingeniør, onkologi og hematologi — SeqOne (hybrid, Frankrike)
Bygg reproduserbare bioinformatikkpipelines og programvare for SeqOnes kliniske genomikkplattform. Støtt forskning innen onkologi og hematologi med pålitelige, skalerbare løsninger.
Beskrivelse
- Utvikle verktøy og pipelines for komplekse biologiske datasett
- Vedlikeholde og forbedre eksisterende applikasjoner
- Undersøke og løse problemer rapportert av brukere
- Forbedre applikasjonenes ytelse og pålitelighet
- Levere robuste og reproduserbare analytiske resultater
- Arbeide tett med vitenskapelige team
- Støtte vitenskapelige publikasjoner og presentasjoner
- Tilrettelegge for kodegjennomganger
- Bruke kodestandarder og sikker utviklingspraksis
- Evaluere nye metoder og teknologier for relevant bruk
- Skrive og vedlikeholde teknisk dokumentasjon
- Opplære og støtte brukere og kolleger
- Arbeide med forsknings- og produktteam for å omsette vitenskapelige behov til pålitelig programvare
- Fremme kodekvalitet gjennom gjennomganger, testing og CI/CD-praksis
- Bidra til å etablere teampraksis som gjør komplekse analyser rutinemessige, reproduserbare og skalerbare
Krav
- Yrkeserfaring innen onkohematologi er påkrevd
- Mastergrad (Bac+5) i bioinformatikk, informatikk eller et beslektet fagområde
- Minst to års erfaring med utvikling av bioinformatikkprogramvare
- Avanserte ferdigheter i Python, UNIX/Linux og Bash
- Praktisk erfaring med workflowverktøy som Snakemake og Nextflow
- Arbeidskunnskap om Git, inkludert branching, pull requests og kodegjennomganger
- Erfaring med Docker for å bygge reproduserbare miljøer
- Gode skriftlige og muntlige kommunikasjonsevner
- Samarbeidsorientert tilnærming til teamarbeid
- Evne til å håndtere ansvarsområder selvstendig
- Sterke analytiske evner og problemløsningsevner
- Doktorgrad eller tilsvarende forskningserfaring er en fordel
- Erfaring med CI/CD-systemer som GitLab CI eller GitHub Actions er en fordel
- Kunnskap om verktøy for miljøhåndtering som pyenv, Poetry eller virtuelle miljøer
- Erfaring med HPC- eller skymiljøer, inkludert SLURM, AWS, GCP eller Azure, er en stor fordel
- Ytterligere programmeringserfaring i R, Perl, Groovy, Nim eller Rust er velkommen
Fordeler
- Mulighet for fjernarbeid
- Fleksibel arbeidstid
- Konkurransedyktig fordelspakke
- Interne muligheter for karriereutvikling
- Løpende faglig opplæring
- Støtte til deltakelse på vitenskapelige konferanser
- Fastlønn
- Bonusordning
- Helseforsikring uten kostnad
- Fleksible arbeidsformer med hybridarbeid, arbeid på stedet eller fullt fjernarbeid