SeqOne udvikler AI-baseret bioinformatiksoftware til molekylære laboratorier, der arbejder med data fra næste generations sekventering. Den samlede platform understøtter germline- og somatisk analyse af paneler, exomer samt kort- eller langlæste genomer, med automatiserede arbejdsgange gennem SeqOne Flow og klinisk valideret fortolkning gennem DiagAI. Virksomhedens teknologi anvendes til test for kræft, arvelige sygdomme og infektionssygdomme og kombinerer prioritering af varianter, fænotypematchning, forudsigelse af patogenicitet og ekspertdefinerede regler. SeqOne tilbyder også LIMS- og IT-integrationer, professionelle og kliniske fortolkningstjenester, premiumkilder til annotation samt flersproget support til laboratorieinstallationer. Arbejdet ligger i krydsfeltet mellem sundhedssektoren, bioteknologi og kunstig intelligens med fokus på sikkerhed, compliance og klinisk anvendelse.
Bioinformatikingeniør, onkologi og hæmatologi — SeqOne (hybrid, Frankrig)
Byg reproducerbare bioinformatikpipelines og software til SeqOnes kliniske genomikplatform. Understøt forskning inden for onkologi og hæmatologi med pålidelige, skalerbare løsninger.
Beskrivelse
- Udvikle værktøjer og pipelines til komplekse biologiske datasæt
- Vedligeholde og forbedre eksisterende applikationer
- Undersøge og løse problemer rapporteret af brugere
- Forbedre applikationernes ydeevne og pålidelighed
- Levere robuste og reproducerbare analytiske resultater
- Arbejde tæt sammen med videnskabelige teams
- Understøtte videnskabelige publikationer og præsentationer
- Facilitere kodegennemgange
- Anvende kodestandarder og sikker udviklingspraksis
- Evaluere nye metoder og teknologier med henblik på relevant anvendelse
- Skrive og vedligeholde teknisk dokumentation
- Uddanne og supportere brugere og kolleger
- Arbejde sammen med forsknings- og produktteams om at omsætte videnskabelige behov til pålidelig software
- Fremme kodekvaliteten gennem gennemgange, test og CI/CD-praksis
- Bidrage til at etablere teampraksis, der gør komplekse analyser rutinemæssige, reproducerbare og skalerbare
Krav
- Erhvervserfaring inden for onkohematologi er påkrævet
- Kandidatgrad (Bac+5) i bioinformatik, datalogi eller en relateret disciplin
- Mindst to års erfaring med udvikling af bioinformatiksoftware
- Avancerede færdigheder i Python, UNIX/Linux og Bash
- Praktisk erfaring med workflowværktøjer som Snakemake og Nextflow
- Arbejdskendskab til Git, herunder branching, pull requests og kodegennemgange
- Erfaring med Docker til opbygning af reproducerbare miljøer
- Stærke skriftlige og mundtlige kommunikationsevner
- Samarbejdsorienteret tilgang til teamwork
- Evne til at håndtere ansvarsområder selvstændigt
- Stærke analytiske evner og problemløsningsevner
- Ph.d. eller tilsvarende forskningserfaring er en fordel
- Erfaring med CI/CD-systemer som GitLab CI eller GitHub Actions er en fordel
- Kendskab til værktøjer til miljøstyring som pyenv, Poetry eller virtuelle miljøer
- Erfaring med HPC- eller cloudmiljøer, herunder SLURM, AWS, GCP eller Azure, er en stor fordel
- Yderligere programmeringserfaring i R, Perl, Groovy, Nim eller Rust er velkommen
Fordele
- Mulighed for fjernarbejde
- Fleksible arbejdstider
- Konkurrencedygtig fordelspakke
- Interne muligheder for karriereudvikling
- Løbende faglig uddannelse
- Støtte til deltagelse i videnskabelige konferencer
- Fast løn
- Bonusordning
- Sundhedsforsikring uden omkostninger
- Fleksible arbejdsformer med hybridarbejde, arbejde på stedet eller fuldt fjernarbejde