„SeqOne“ kuria dirbtiniu intelektu grindžiamą bioinformatikos programinę įrangą molekulinėms laboratorijoms, dirbančioms su naujos kartos sekoskaitos duomenimis. Jos universali platforma palaiko gemalinės linijos ir somatinių pokyčių analizę, atliekamą naudojant paneles, egzomus ir trumpo arba ilgo skaitymo genomus. „SeqOne Flow“ automatizuoja darbo eigas, o „DiagAI“ teikia kliniškai patvirtintą interpretaciją. Bendrovės technologija naudojama onkologijoje, tiriant paveldimas ligas ir diagnozuojant infekcines ligas. Ji apima variantų prioritetų nustatymą, fenotipų atitikties paiešką, patogeniškumo prognozavimą ir ekspertų apibrėžtas taisykles. „SeqOne“ taip pat teikia LIMS ir IT integracijas, profesionalias bei klinikines interpretavimo paslaugas, aukščiausios kokybės anotacijų šaltinius ir daugiakalbę pagalbą laboratorijoms diegiant sprendimus. Bendrovės veikla yra sveikatos priežiūros, biotechnologijų ir dirbtinio intelekto sankirtoje, daugiausia dėmesio skiriant saugumui, atitikties reikalavimams ir klinikiniam pritaikymui.
Bioinformatikos inžinierius, onkologija ir hematologija — SeqOne (hibridinis darbas, Prancūzija)
Kurkite atkuriamus bioinformatikos procesus ir programinę įrangą „SeqOne“ klinikinės genomikos platformai. Padėkite vykdyti onkologijos ir hematologijos tyrimus, pasitelkdami patikimus ir lengvai plečiamus sprendimus.
Prancūzija32 000 € – 48 000 € / metai
HibridinisVisas etatasJaunesnysis specialistasVidutinis lygisPrivaloma Kalba: anglųInžinieriusAprašymas
- Kurkite įrankius ir procesus sudėtingiems biologiniams duomenų rinkiniams
- Prižiūrėkite ir tobulinkite esamas taikomąsias programas
- Tirkite naudotojų praneštas problemas ir jas spręskite
- Gerinkite taikomųjų programų našumą ir patikimumą
- Užtikrinkite patikimus ir atkuriamus analizės rezultatus
- Glaudžiai bendradarbiaukite su mokslinėmis komandomis
- Prisidėkite prie mokslinių publikacijų ir pranešimų
- Organizuokite kodo peržiūras
- Taikykite programavimo standartus ir saugaus kūrimo praktiką
- Vertinkite naujus metodus ir technologijas, kad būtų galima juos tinkamai pritaikyti
- Renkite ir prižiūrėkite techninę dokumentaciją
- Mokykite ir konsultuokite naudotojus bei kolegas
- Bendradarbiaukite su tyrimų ir produktų komandomis, kad mokslinius poreikius paverstumėte patikima programine įranga
- Gerinkite kodo kokybę atlikdami peržiūras, testuodami ir taikydami CI/CD praktikas
- Padėkite kurti komandos darbo praktiką, kuri sudėtingas analizes paverčia įprastomis, atkuriamomis ir lengvai plečiamomis
Reikalavimai
- Būtina profesinė onkohematologijos patirtis
- Magistro laipsnis (Bac+5) bioinformatikos, informatikos ar susijusioje srityje
- Ne mažesnė kaip dvejų metų bioinformatikos programinės įrangos kūrimo patirtis
- Puikūs Python, UNIX/Linux ir Bash įgūdžiai
- Praktinė darbo su procesų valdymo įrankiais, tokiais kaip „Snakemake“ ir „Nextflow“, patirtis
- Geros Git žinios, įskaitant šakas, „pull request“ užklausas ir kodo peržiūras
- Patirtis naudojant „Docker“ atkuriamoms aplinkoms kurti
- Puikūs rašytinės ir žodinės komunikacijos įgūdžiai
- Gebėjimas bendradarbiauti komandoje
- Gebėjimas savarankiškai valdyti priskirtas atsakomybes
- Stiprūs analitiniai ir problemų sprendimo įgūdžiai
- Daktaro laipsnis arba lygiavertė mokslinių tyrimų patirtis būtų privalumas
- Patirtis dirbant su CI/CD sistemomis, tokiomis kaip „GitLab CI“ ar „GitHub Actions“, būtų privalumas
- Aplinkų valdymo įrankių, tokių kaip „pyenv“, „Poetry“ ar virtualiosios aplinkos, išmanymas
- Patirtis dirbant su HPC ar debesijos aplinkomis, įskaitant SLURM, AWS, GCP ar Azure, būtų didelis privalumas
- Papildoma programavimo patirtis naudojant R, Perl, Groovy, Nim ar Rust yra sveikintina
Privalumai
- Nuotolinio darbo galimybės
- Lankstus darbo laikas
- Konkurencingas naudų paketas
- Vidinės karjeros plėtros galimybės
- Nuolatiniai profesiniai mokymai
- Parama dalyvaujant mokslinėse konferencijose
- Fiksuotas atlyginimas
- Premijos
- Nemokamas sveikatos draudimas
- Lankstus hibridinis, darbas biure arba visiškai nuotolinis darbas