SeqOne 为使用新一代测序数据的分子实验室开发由人工智能驱动的生物信息学软件。其一体化平台支持针对基因 panel、外显子组以及短读长或长读长基因组的胚系和体细胞分析，并通过 SeqOne Flow 实现工作流程自动化，通过经临床验证的 DiagAI 提供结果解读。该公司的技术应用于肿瘤、遗传病和传染病检测，将变异优先级排序、表型匹配、致病性预测和专家定义规则结合起来。SeqOne 还提供 LIMS 与 IT 集成、专业及临床解读服务、高级注释数据源，以及面向实验室部署的多语言支持。其业务位于医疗保健、生物技术和人工智能的交汇处，重点关注安全性、合规性和临床应用。
生物信息学工程师，肿瘤与血液学 — SeqOne（混合办公，法国）
为 SeqOne 临床基因组学平台构建可复现的生物信息学流程和软件。 以可靠且可扩展的解决方案支持肿瘤学与血液学研究。
描述
- 为复杂生物数据集开发工具和流程
- 维护并改进现有应用程序
- 调查并解决用户报告的问题
- 提升应用程序的性能和可靠性
- 交付稳健且可复现的分析结果
- 与科研团队密切合作
- 支持科学出版物和演示汇报
- 组织代码审查
- 遵循编码标准和安全开发实践
- 评估新兴方法和技术，以便在适用时采用
- 编写和维护技术文档
- 培训并支持用户和同事
- 与研究团队和产品团队合作，将科学需求转化为可靠的软件
- 通过代码审查、测试和 CI/CD 实践提升代码质量
- 帮助建立团队实践，使复杂分析变得日常化、可复现且可扩展
任职要求
- 必须具备肿瘤血液学领域的专业经验
- 拥有生物信息学、计算机科学或相关专业的硕士学位（Bac+5）
- 至少两年生物信息学软件开发经验
- 熟练掌握 Python、UNIX/Linux 和 Bash
- 具备使用 Snakemake、Nextflow 等工作流工具的实践经验
- 熟悉 Git，包括分支、拉取请求和代码审查
- 具备使用 Docker 构建可复现环境的经验
- 具备出色的书面和口头沟通能力
- 具有良好的团队协作意识
- 能够独立管理工作职责
- 具备较强的分析和问题解决能力
- 拥有博士学位或同等研究经验者优先
- 具备 GitLab CI 或 GitHub Actions 等 CI/CD 系统经验者优先
- 了解 pyenv、Poetry 或虚拟环境等环境管理工具
- 具备 HPC 或云环境经验，包括 SLURM、AWS、GCP 或 Azure 者优先
- 欢迎具备 R、Perl、Groovy、Nim 或 Rust 等额外编程经验
福利待遇
- 提供远程工作机会
- 工作时间灵活
- 具有竞争力的福利待遇
- 内部职业发展机会
- 持续的专业培训
- 支持参加科学会议
- 固定薪资
- 奖金报酬
- 免费提供医疗保险
- 可灵活选择混合办公、现场办公或完全远程办公安排