SeqOne разрабатывает программное обеспечение для биоинформатики на основе искусственного интеллекта, предназначенное для молекулярных лабораторий, работающих с данными секвенирования нового поколения. Универсальная платформа поддерживает герминальный и соматический анализ панелей, экзомов, а также короткочитаемых и длинночитаемых геномов, автоматизируя рабочие процессы с помощью SeqOne Flow и обеспечивая клинически валидированную интерпретацию благодаря DiagAI. Технологии компании применяются в онкологии, диагностике наследственных и инфекционных заболеваний и объединяют приоритизацию вариантов, сопоставление фенотипов, прогнозирование патогенности и правила, определённые экспертами. SeqOne также предоставляет интеграции с LIMS и ИТ-системами, услуги профессиональной и клинической интерпретации, премиальные источники аннотаций и многоязычную поддержку лабораторных внедрений. Компания работает на пересечении здравоохранения, биотехнологий и искусственного интеллекта, уделяя особое внимание безопасности, соблюдению нормативных требований и клиническому внедрению.
Инженер по биоинформатике в онкологии и гематологии — SeqOne (гибридный формат, Франция)
Разрабатывайте воспроизводимые биоинформатические конвейеры и программное обеспечение для клинической геномной платформы SeqOne. Поддерживайте исследования в онкологии и гематологии с помощью надежных и масштабируемых решений.
Франция32 000 € – 48 000 € / год
ГибридПолная занятостьМладший специалистСредний уровеньТребуемый Язык: английскийИнженерОписание
- Разрабатывать инструменты и конвейеры для сложных биологических наборов данных
- Поддерживать и совершенствовать существующие приложения
- Исследовать проблемы, о которых сообщают пользователи, и устранять их
- Повышать производительность и надежность приложений
- Обеспечивать надежные и воспроизводимые результаты анализа
- Тесно сотрудничать с научными командами
- Поддерживать подготовку научных публикаций и презентаций
- Содействовать проведению ревью кода
- Применять стандарты написания кода и практики безопасной разработки
- Оценивать новые методы и технологии для целесообразного внедрения
- Создавать и поддерживать техническую документацию
- Обучать и поддерживать пользователей и коллег
- Работать с исследовательскими и продуктовыми командами, превращая научные потребности в надежное программное обеспечение
- Повышать качество кода с помощью ревью, тестирования и практик CI/CD
- Помогать формировать командные практики, делающие сложный анализ стандартным, воспроизводимым и масштабируемым
Требования
- Требуется профессиональный опыт в онкогематологии
- Степень магистра (Bac+5) в области биоинформатики, информатики или смежной дисциплины
- Не менее двух лет опыта разработки биоинформатического программного обеспечения
- Продвинутые навыки работы с Python, UNIX/Linux и Bash
- Практический опыт работы с инструментами управления рабочими процессами, такими как Snakemake и Nextflow
- Знание Git, включая ветвление, pull request и ревью кода
- Опыт использования Docker для создания воспроизводимых окружений
- Отличные навыки письменной и устной коммуникации
- Умение работать в команде
- Способность самостоятельно управлять своими обязанностями
- Сильные аналитические навыки и навыки решения проблем
- Наличие PhD или эквивалентного исследовательского опыта будет преимуществом
- Опыт работы с системами CI/CD, такими как GitLab CI или GitHub Actions, будет преимуществом
- Знание инструментов управления окружениями, таких как pyenv, Poetry или виртуальные окружения
- Опыт работы с HPC или облачными средами, включая SLURM, AWS, GCP или Azure, будет большим преимуществом
- Дополнительный опыт программирования на R, Perl, Groovy, Nim или Rust приветствуется
Преимущества
- Возможность удаленной работы
- Гибкий рабочий график
- Конкурентоспособный пакет льгот
- Возможности внутреннего карьерного развития
- Постоянное профессиональное обучение
- Поддержка участия в научных конференциях
- Фиксированная заработная плата
- Бонусные выплаты
- Медицинская страховка за счет компании
- Гибкий гибридный, офисный или полностью удаленный формат работы