
SeqOne ontwikkelt AI-gestuurde bio-informaticasoftware voor moleculaire laboratoria die werken met gegevens uit next-generation sequencing. Het alles-in-éénplatform ondersteunt kiembaan- en somatische analyses van panels, exomen en genomen die met short-read- of long-readtechnologie zijn onderzocht. Via SeqOne Flow biedt het geautomatiseerde workflows, terwijl DiagAI klinisch gevalideerde interpretatie mogelijk maakt. De technologie van het bedrijf wordt gebruikt voor onderzoek naar en diagnostiek van kanker, erfelijke aandoeningen en infectieziekten. Daarbij worden variantprioritering, fenotypekoppeling, voorspelling van pathogeniciteit en door experts gedefinieerde regels gecombineerd. SeqOne levert ook LIMS- en IT-integraties, professionele en klinische interpretatiediensten, hoogwaardige annotatiebronnen en meertalige ondersteuning voor laboratoriumimplementaties. Het bedrijf bevindt zich op het snijvlak van gezondheidszorg, biotechnologie en kunstmatige intelligentie, met aandacht voor beveiliging, naleving van regelgeving en klinische toepassing.
Bio-informatica-engineer voor oncologie en hematologie — SeqOne (hybride, Frankrijk)
Bouw reproduceerbare bio-informaticapipelines en software voor het klinischegenomicsplatform van SeqOne. Ondersteun onderzoek in de oncologie en hematologie met betrouwbare, schaalbare oplossingen.
Beschrijving
- Ontwikkel tools en pipelines voor complexe biologische datasets
- Onderhoud en verbeter bestaande applicaties
- Onderzoek en los door gebruikers gemelde problemen op
- Verbeter de prestaties en betrouwbaarheid van applicaties
- Lever robuuste, reproduceerbare analyseresultaten
- Werk nauw samen met wetenschappelijke teams
- Ondersteun wetenschappelijke publicaties en presentaties
- Begeleid codebeoordelingen
- Pas coderingsstandaarden en veilige ontwikkelpraktijken toe
- Evalueer opkomende methoden en technologieën voor relevante toepassingen
- Schrijf en onderhoud technische documentatie
- Train en ondersteun gebruikers en collega's
- Werk samen met onderzoeks- en productteams om wetenschappelijke behoeften om te zetten in betrouwbare software
- Bevorder codekwaliteit door middel van reviews, tests en CI/CD-praktijken
- Help teampraktijken op te zetten die complexe analyses routinematig, reproduceerbaar en schaalbaar maken
Vereisten
- Professionele ervaring in de oncohematologie is vereist
- Masterdiploma (Bac+5) in bio-informatica, informatica of een verwante studierichting
- Minimaal twee jaar ervaring met de ontwikkeling van bio-informaticasoftware
- Gevorderde vaardigheden in Python, UNIX/Linux en Bash
- Praktische ervaring met workflowtools zoals Snakemake en Nextflow
- Werkkennis van Git, waaronder branching, pull requests en codebeoordelingen
- Ervaring met Docker voor het bouwen van reproduceerbare omgevingen
- Sterke schriftelijke en mondelinge communicatieve vaardigheden
- Een samenwerkingsgerichte werkhouding
- Vermogen om verantwoordelijkheden zelfstandig te beheren
- Sterke analytische en probleemoplossende vaardigheden
- Een PhD of gelijkwaardige onderzoekservaring is een pluspunt
- Ervaring met CI/CD-systemen zoals GitLab CI of GitHub Actions is een pluspunt
- Kennis van tools voor omgevingsbeheer, zoals pyenv, Poetry of virtuele omgevingen
- Ervaring met HPC- of cloudomgevingen, waaronder SLURM, AWS, GCP of Azure, is een groot voordeel
- Aanvullende programmeerervaring in R, Perl, Groovy, Nim of Rust is welkom
Voordelen
- Mogelijkheden voor werken op afstand
- Flexibele werktijden
- Aantrekkelijk arbeidsvoorwaardenpakket
- Interne mogelijkheden voor loopbaanontwikkeling
- Doorlopende professionele training
- Ondersteuning bij deelname aan wetenschappelijke conferenties
- Vast salaris
- Bonusvergoeding
- Gratis zorgverzekering
- Flexibele hybride, op locatie of volledig externe werkmogelijkheden