IMU Biosciences
IMU Biosciences
IMU Biosciences è un’azienda biotecnologica con sede a Londra che sviluppa tecnologie di immunologia ad alta dimensionalità per la ricerca clinica, la diagnostica e lo sviluppo di farmaci. La sua piattaforma multiomica ad alto rendimento analizza oltre 100 milioni di dati immunologici a partire da un campione di sangue di 2 ml e distingue in tempo reale circa 2.500 sottopopolazioni di cellule immunitarie. Il dataset immunologico risultante, ottenuto su scala di popolazione, supporta applicazioni come lo screening predittivo per il trapianto di cellule staminali ematopoietiche, la valutazione del rigetto nei trapianti di organi solidi e l’identificazione di firme immunitarie associate alla risposta al trattamento e agli eventi avversi nell’immuno-oncologia. IMU Biosciences collabora con gruppi di ricerca clinica, aziende farmaceutiche e biotecnologiche e partner diagnostici per trasformare il fenotipo immunitario in strumenti clinici e commerciali concreti.

Ingegnere software bioinformatico – citometria a flusso

Sviluppa e gestisce pipeline di apprendimento automatico regolamentate per la citometria a flusso presso IMU Biosciences. Il ruolo comprende annotazione, monitoraggio dei modelli, riproducibilità e conformità per una piattaforma di medicina di precisione.

Descrizione

  • Eseguire flussi di lavoro automatizzati di annotazione cellulare su grandi set di dati di citometria.
  • Produrre file di appartenenza cellulare, tabelle delle proporzioni dei sottotipi cellulari e report automatizzati che segnalano valori anomali per il controllo qualità.
  • Applicare ensemble bloccati di algoritmi automatizzati di gating alle partizioni di convalida incrociata e valutazione.
  • Monitorare e documentare le metriche di esposizione al gating per ciascun paziente.
  • Definire e bloccare modelli di riferimento e criteri di stabilità numerica per le pipeline di estrazione delle caratteristiche della citometria a flusso.
  • Gestire il registro formale del ciclo di vita dei modelli, inclusi versionamento, congelamento e blocco degli ensemble di gating e dei modelli predittivi candidati.
  • Riaddestrare i modelli di apprendimento automatico selezionati su coorti più ampie e congelare i modelli finali prima delle valutazioni cliniche in cieco.
  • Eseguire il commit del codice versionato, fissare le specifiche degli ambienti Conda e Docker e registrare i seed casuali e gli iperparametri dei modelli.
  • Agire come revisore principale del codice nell’intera pipeline computazionale.
  • Applicare controlli contro la perdita di dati, verificare l’integrità dei dati e rispettare gli standard di programmazione modulare.
  • Partecipare a revisioni indipendenti dei metodi, audit di tracciabilità e verifiche di conformità normativa.
  • Collaborare con ingegneri di apprendimento automatico, biostatistici e scienziati clinici.
  • Fare riferimento al responsabile della Data Science.

Requisiti

  • Laurea magistrale o dottorato in bioinformatica, statistica, biologia computazionale, informatica, bioingegneria o disciplina quantitativa correlata.
  • Almeno tre anni di esperienza professionale con dati di citometria a flusso ad alto rendimento in un contesto regolamentato, accademico o biotecnologico.
  • Ottima conoscenza di Python ed esperienza con NumPy, Pandas, SciPy, scikit-learn e PyTorch.
  • Esperienza dimostrata nelle pratiche di ingegneria del software, tra cui Git, CI/CD, gestori di workflow come Nextflow, fissaggio degli ambienti Docker e tracciamento degli artefatti di apprendimento automatico.
  • Conoscenza della generazione di caratteristiche per la citometria a flusso e dell’armonizzazione degli effetti batch.
  • Conoscenza dei rischi di leakage nella convalida incrociata per la modellazione predittiva di dati di citometria a flusso ad alta dimensionalità.
  • Diritto già acquisito a lavorare nel Regno Unito.

Benefit

  • Retribuzione competitiva e programma di bonus aziendale.
  • Pensione.
  • Assicurazione sanitaria.
  • Assicurazione sulla vita.
  • Copertura per la perdita di reddito.
  • Ambiente startup dinamico e collaborativo.
  • Opportunità di sviluppo e avanzamento professionale.

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