LogoFresh Jobs Ahead
IMU Biosciences
IMU Biosciences
11 – 50 Anställda
B2BBioteknikHälso- och sjukvård
IMU Biosciences är ett Londonbaserat bioteknikföretag som utvecklar högdimensionella immunologitekniker för klinisk forskning, diagnostik och läkemedelsutveckling. Företagets multiomikplattform med hög genomströmning analyserar mer än 100 miljoner immunologiska datapunkter från ett blodprov på 2 ml och identifierar cirka 2 500 immuncellsubpopulationer i realtid. Den resulterande immunologiska datamängden i populationsskala stöder tillämpningar som prediktiv screening inför hematopoetisk stamcellstransplantation, bedömning av transplantatavstötning vid transplantation av solida organ samt immunologiska signaturer kopplade till behandlingsrespons och biverkningar inom immunonkologi. IMU Biosciences samarbetar med kliniska forskningsgrupper, läkemedels- och bioteknikföretag samt diagnostikpartners för att omsätta immunfenotypning till praktiska kliniska och kommersiella verktyg.
LinkedIn
Jobb på företaget

Bioinformatikingenjör inom mjukvara – flödescytometri

Bygg och underhåll reglerade maskininlärningspipelines för flödescytometri hos IMU Biosciences. Rollen omfattar annotering, modellspårning, reproducerbarhet och regelefterlevnad för en plattform för precisionsmedicin.

GBStorbritannienHybridHeltidMellannivåSeniorObligatoriskt Språk: engelskaFullstackingenjörMjukvaruingenjör
DockerNumpyPandasPythonPyTorchScikit-Learn

Beskrivning

  • Kör automatiserade arbetsflöden för cellannotering på stora flödescytometridatauppsättningar.
  • Skapa cellmedlemskapsfiler, tabeller över andelar av cellsubpopulationer och automatiserade rapporter som flaggar avvikande värden för kvalitetskontroll.
  • Tillämpa låsta automatiserade gating-ensembler på datapartitioner för korsvalidering och utvärdering.
  • Följ upp och dokumentera mått på gate-exponering för varje patient.
  • Fastställ och lås baslinjemodeller och kriterier för numerisk stabilitet i pipelines för extraktion av flödescytometriska egenskaper.
  • Underhåll det formella registret över modellernas livscykel, inklusive versionshantering samt frysning och låsning av gating-ensembler och prediktiva kandidatmodeller.
  • Träna om utvalda maskininlärningsmodeller på större kohorter och frys slutmodeller före blindade kliniska utvärderingar.
  • Checka in versionshanterad kod, lås specifikationerna för Conda- och Docker-miljöer och logga slumptalsfrön och modellhyperparametrar.
  • Agera som primär kodgranskare för hela den beräkningsbaserade pipelinen.
  • Tillämpa kontroller mot dataläckage, verifiera dataintegritet och upprätthålla modulära kodningsstandarder.
  • Delta i oberoende metodgranskningar, spårbarhetsrevisioner och kontroller av regelefterlevnad.
  • Samarbeta med maskininlärningsingenjörer, biostatistiker och kliniska forskare.
  • Rapportera till Lead Data Scientist.

Krav

  • Masterexamen eller doktorsexamen i bioinformatik, statistik, beräkningsbiologi, datavetenskap, bioteknik eller ett närliggande kvantitativt ämne.
  • Minst tre års yrkeserfarenhet av högkapacitetsdata från flödescytometri i en reglerad, akademisk eller bioteknisk miljö.
  • Goda kunskaper i Python och erfarenhet av NumPy, Pandas, SciPy, scikit-learn och PyTorch.
  • Dokumenterad användning av metoder inom mjukvaruutveckling, bland annat Git, CI/CD, arbetsflödeshanterare som Nextflow, låsta Docker-miljöer och spårning av ML-artefakter.
  • Kännedom om generering av egenskaper från flödescytometri och harmonisering av batch-effekter.
  • Kännedom om risker för dataläckage vid korsvalidering i prediktiv modellering med högdimensionella flödescytometridata.
  • Befintlig rätt att arbeta i Storbritannien.

Förmåner

  • Konkurrenskraftig lön och företagets bonusprogram.
  • Pension.
  • Sjukförsäkring.
  • Livförsäkring.
  • Inkomstförsäkring.
  • En snabb och samarbetsinriktad startupmiljö.
  • Möjligheter till karriärutveckling och avancemang.

Relaterade jobb

Euromonitor International

Europeisk marknadsanalytiker

Euromonitor International
1 001 – 5 000 Anställda
Sponsor för visum för kvalificerade arbetstagare
GBStorbritannienHybridHeltidMellannivåSeniorObligatoriskt Språk: engelskaObligatoriskt Språk: spanskaObligatoriskt Språk: franskaObligatoriskt Språk: italienskaAnalytiker

Marknadsanalytiker på Euromonitor International som utvecklar och validerar europeiska marknadsestimat. Omsätter lokal marknads-, konsument- och branschkunskap i kundunderlag och bygger relationer i regionen.

Öppna