IMU Biosciencesは、臨床研究、診断、医薬品開発向けの高次元免疫学技術を開発する、ロンドンを拠点とするバイオテクノロジー企業です。同社のマルチオミクス・ハイスループットプラットフォームは、2 mLの血液サンプルから1億を超える免疫データポイントを解析し、約2,500種類の免疫細胞サブセットをリアルタイムで識別します。こうして得られる大規模な集団免疫データセットは、造血幹細胞移植における予測スクリーニング、固形臓器移植における移植片拒絶の評価、免疫腫瘍学における治療反応や有害事象に関連する免疫シグネチャーなどの用途を支えます。IMU Biosciencesは、臨床研究グループ、製薬・バイオテクノロジー企業、診断分野のパートナーと連携し、免疫表現型解析を実用的な臨床・商業ツールへと発展させています。
バイオインフォマティクス・ソフトウェアエンジニア（フローサイトメトリー）
IMU Biosciencesで、フローサイトメトリー向けの規制準拠機械学習パイプラインを構築・保守します。 アノテーション、モデル追跡、再現性、精密医療プラットフォームのコンプライアンスを担います。
仕事内容
- 大規模なフローサイトメトリーデータセットで自動細胞アノテーションワークフローを実行する。
- 細胞所属ファイル、細胞サブセット比率表、品質管理用の外れ値を示す自動レポートを作成する。
- ロック済みの自動ゲーティングアンサンブルを交差検証および評価用データ分割に適用する。
- 患者ごとのゲーティング曝露指標を追跡し、記録する。
- フローサイトメトリー特徴量抽出パイプラインのベースラインモデルと数値安定性基準を設定し、ロックする。
- 正式なモデルライフサイクル登録簿を管理する。ゲーティングアンサンブルと予測候補モデルのバージョン管理、凍結、ロックを含む。
- より大規模なコホートで候補に選ばれた機械学習モデルを再適合し、盲検臨床評価の前に最終モデルを凍結する。
- バージョン管理されたコードをコミットし、CondaおよびDockerの環境仕様を固定し、乱数シードとモデルのハイパーパラメーターを記録する。
- 計算パイプライン全体の主担当コードレビュアーを務める。
- データ漏洩対策を実施し、データの完全性を検証し、モジュール型コーディング標準を維持する。
- 独立手法レビュー、トレーサビリティ監査、規制遵守確認に参加する。
- 機械学習エンジニア、生物統計学者、臨床研究者と協働する。
- リードデータサイエンティストに報告する。
応募要件
- バイオインフォマティクス、統計学、計算生物学、コンピューターサイエンス、バイオエンジニアリング、または関連する定量分野の修士号または博士号。
- 規制下の組織、学術機関、またはバイオテクノロジー分野で、高スループットのフローサイトメトリーデータを扱った実務経験が3年以上あること。
- Pythonに精通し、NumPy、Pandas、SciPy、scikit-learn、PyTorchの使用経験があること。
- Git、CI/CD、Nextflowなどのワークフローマネージャー、Docker環境の固定、機械学習成果物の追跡を含むソフトウェアエンジニアリングの実践経験。
- フローサイトメトリーの特徴量生成とバッチ効果の調和に関する知識。
- 高次元フローサイトメトリー予測モデリングにおける交差検証時のデータ漏洩リスクに関する知識。
- 英国で就労する権利をすでに有していること。
福利厚生
- 競争力のある給与と会社業績賞与制度。
- 年金。
- 健康保険。
- 生命保険。
- 所得補償。
- スピード感のある協働的なスタートアップ環境。
- キャリア開発と昇進の機会。