IMU Biosciences es una empresa de biotecnología con sede en Londres que desarrolla tecnologías de inmunología multidimensional para la investigación clínica, el diagnóstico y el desarrollo de fármacos. Su plataforma multiómica de alto rendimiento analiza más de 100 millones de datos inmunitarios a partir de una muestra de sangre de 2 ml y distingue en tiempo real aproximadamente 2.500 subpoblaciones de células inmunitarias. El conjunto de datos inmunitarios resultante, obtenido a escala poblacional, respalda aplicaciones como el cribado predictivo para el trasplante de células madre hematopoyéticas, la evaluación del rechazo en trasplantes de órganos sólidos y la identificación de firmas inmunitarias relacionadas con la respuesta al tratamiento y los acontecimientos adversos en inmunooncología. IMU Biosciences colabora con grupos de investigación clínica, empresas farmacéuticas y biotecnológicas, y socios del sector diagnóstico para transformar la fenotipificación inmunitaria en herramientas clínicas y comerciales prácticas.
Ingeniero/a de software en bioinformática – citometría de flujo
Desarrolla y mantiene flujos de trabajo de aprendizaje automático regulados para citometría de flujo en IMU Biosciences. El puesto abarca anotación, seguimiento de modelos, reproducibilidad y cumplimiento normativo para una plataforma de medicina de precisión.
Descripción
- Ejecuta flujos automatizados de anotación celular en grandes conjuntos de datos de citometría.
- Genera archivos de pertenencia celular, tablas de proporciones de subpoblaciones celulares e informes automatizados que señalan valores atípicos para el control de calidad.
- Aplica conjuntos bloqueados de algoritmos automatizados de gating a particiones de validación cruzada y evaluación.
- Registra y documenta métricas de exposición al gating para cada paciente.
- Define y bloquea modelos de referencia y criterios de estabilidad numérica para los flujos de extracción de características de citometría de flujo.
- Mantiene el registro formal del ciclo de vida de los modelos, incluidas las versiones, la congelación y el bloqueo de conjuntos de gating y modelos predictivos candidatos.
- Vuelve a ajustar los modelos de aprendizaje automático preseleccionados con cohortes más grandes y congela los modelos finales antes de las evaluaciones clínicas a ciegas.
- Confirma código versionado, fija las especificaciones de los entornos Conda y Docker y registra las semillas aleatorias y los hiperparámetros de los modelos.
- Actúa como revisor/a principal del código en todo el flujo computacional.
- Aplica controles para evitar fugas de datos, verifica su integridad y mantiene estándares de programación modular.
- Participa en revisiones independientes de métodos, auditorías de trazabilidad y controles de cumplimiento normativo.
- Colabora con ingenieros/as de aprendizaje automático, bioestadísticos/as y científicos/as clínicos/as.
- Reporta al/a la responsable de ciencia de datos.
Requisitos
- Máster o doctorado en bioinformática, estadística, biología computacional, informática, bioingeniería o una disciplina cuantitativa relacionada.
- Al menos tres años de experiencia profesional con datos de citometría de flujo de alto rendimiento en un entorno regulado, académico o biotecnológico.
- Dominio de Python y experiencia con NumPy, Pandas, SciPy, scikit-learn y PyTorch.
- Experiencia demostrable con prácticas de ingeniería de software, como Git, CI/CD, gestores de flujos de trabajo como Nextflow, fijación de entornos Docker y seguimiento de artefactos de aprendizaje automático.
- Familiaridad con la generación de características de citometría de flujo y la armonización de efectos de lote.
- Familiaridad con los riesgos de fuga de datos en la validación cruzada de modelos predictivos de citometría de flujo de alta dimensión.
- Derecho vigente a trabajar en el Reino Unido.
Beneficios
- Salario competitivo y programa de bonificación de la empresa.
- Plan de pensiones.
- Seguro médico.
- Seguro de vida.
- Seguro de protección de ingresos.
- Entorno de startup dinámico y colaborativo.
- Oportunidades de desarrollo y crecimiento profesional.