IMU Biosciences 是一家总部位于伦敦的生物技术公司，致力于为临床研究、诊断和药物开发构建高维免疫学技术。其多组学高通量平台可从 2 mL 血液样本中分析超过 1 亿个免疫数据点，并实时区分约 2,500 个免疫细胞亚群。由此形成的大规模人群免疫数据集支持多种应用，包括造血干细胞移植的预测性筛查、实体器官移植中的移植物排斥评估，以及与免疫肿瘤学治疗反应和不良事件相关的免疫特征。IMU Biosciences 与临床研究团队、制药和生物技术公司以及诊断合作伙伴开展合作，将免疫表型分析转化为切实可用的临床和商业工具。
生物信息学软件工程师——流式细胞术
为 IMU Biosciences 构建并维护用于流式细胞术的受监管机器学习流水线。 工作涵盖注释、模型追踪、可复现性及精准医疗平台合规。
描述
- 在大型流式细胞术数据集上运行自动细胞注释工作流。
- 生成细胞归属文件、细胞亚群比例表和自动报告，以标记质量控制所需关注的异常值。
- 将锁定的自动门控集成模型应用于交叉验证和评估数据分区。
- 追踪并记录每位患者的门控暴露指标。
- 为流式细胞术特征提取流水线设定并锁定基线模型和数值稳定性标准。
- 维护正式的模型生命周期注册表，包括对门控集成模型和候选预测模型进行版本管理、冻结和锁定。
- 在更大规模的队列上重新拟合入围机器学习模型，并在盲法临床评估前冻结最终模型。
- 提交带版本控制的代码，固定 Conda 和 Docker 环境规范，并记录随机种子和模型超参数。
- 担任整个计算流水线的主要代码审查员。
- 实施防止数据泄漏的控制措施，验证数据完整性，并遵守模块化编码标准。
- 参与独立方法审查、可追溯性审计和法规合规检查。
- 与机器学习工程师、生物统计学家和临床科学家合作。
- 向首席数据科学家汇报。
任职要求
- 拥有生物信息学、统计学、计算生物学、计算机科学、生物工程或相关定量学科的硕士或博士学位。
- 至少三年在受监管、学术或生物技术环境中处理高通量流式细胞术数据的专业经验。
- 熟练使用 Python，并具有 NumPy、Pandas、SciPy、scikit-learn 和 PyTorch 的使用经验。
- 具备软件工程实践经验，包括 Git、CI/CD、Nextflow 等工作流管理器、Docker 环境固定和机器学习工件追踪。
- 熟悉流式细胞术特征生成和批次效应协调。
- 熟悉高维流式细胞术预测建模中的交叉验证数据泄漏风险。
- 已拥有在英国工作的权利。
福利待遇
- 具有竞争力的薪资和公司奖金计划。
- 养老金。
- 健康保险。
- 人寿保障。
- 收入保障。
- 节奏快、注重协作的初创公司工作环境。
- 职业发展与晋升机会。