生物資訊軟體工程師——流式細胞術
為 IMU Biosciences 建置並維護用於流式細胞術的受規範機器學習管線。 工作涵蓋註釋、模型追蹤、可重現性，以及精準醫療平台的法規遵循。
說明
- 在大型流式細胞術資料集上執行自動細胞註釋工作流程。
- 產生細胞歸屬檔案、細胞亞群比例表，以及標示品質管制異常值的自動化報告。
- 將已鎖定的自動閘控集成模型套用至交叉驗證和評估資料分區。
- 追蹤並記錄每位患者的閘控暴露指標。
- 為流式細胞術特徵擷取管線設定並鎖定基線模型和數值穩定性標準。
- 維護正式的模型生命週期登錄表，包括對閘控集成模型和候選預測模型進行版本管理、凍結及鎖定。
- 在較大型的隊列上重新擬合入選的機器學習模型，並於盲性臨床評估前凍結最終模型。
- 提交具版本管理的程式碼，固定 Conda 和 Docker 環境規格，並記錄隨機種子和模型超參數。
- 擔任整個計算管線的主要程式碼審查者。
- 實施防止資料洩漏的控管措施、驗證資料完整性，並遵循模組化程式碼標準。
- 參與獨立方法審查、可追溯性稽核及法規遵循檢查。
- 與機器學習工程師、生物統計學家及臨床科學家合作。
- 向首席資料科學家報告。
職位要求
- 具備生物資訊、統計、計算生物學、資訊工程、生物工程或相關定量領域的碩士或博士學位。
- 至少三年在受規範、學術或生技環境中處理高通量流式細胞術資料的專業經驗。
- 熟練使用 Python，並具備 NumPy、Pandas、SciPy、scikit-learn 及 PyTorch 的經驗。
- 具備軟體工程實務經驗，包括 Git、CI/CD、Nextflow 等工作流程管理工具、Docker 環境固定，以及機器學習產物追蹤。
- 熟悉流式細胞術特徵產生和批次效應調和。
- 熟悉高維流式細胞術預測建模中的交叉驗證資料洩漏風險。
- 已具備在英國工作的權利。
福利待遇
- 具競爭力的薪資及公司獎金制度。
- 退休金。
- 健康保險。
- 人壽保障。
- 收入保障。
- 步調快速、重視協作的新創環境。
- 職涯發展與晉升機會。